Protein–RNA interactions for Protein: Q9D289

Trappc6b, Trafficking protein particle complex subunit 6B, mousemouse

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Length 158 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trappc6bQ9D289 Gm37055-201ENSMUST00000191866 133 ntBASIC14.22□□□□□ -0.13
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Trappc6bQ9D289 AC135963.1-201ENSMUST00000211640 717 ntBASIC14.22□□□□□ -0.13
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Trappc6bQ9D289 BC048679-201ENSMUST00000073406 522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Trappc6bQ9D289 Cops9-201ENSMUST00000097642 438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Trappc6bQ9D289 Pex12-205ENSMUST00000175741 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Trappc6bQ9D289 Ssfa2-202ENSMUST00000111785 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Trappc6bQ9D289 Krt6b-201ENSMUST00000023786 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Trappc6bQ9D289 Hspa1b-201ENSMUST00000172753 2803 ntAPPRIS P1 BASIC14.22□□□□□ -0.13
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Trappc6bQ9D289 Dap-201ENSMUST00000044524 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Trappc6bQ9D289 Brap-201ENSMUST00000031414 3744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
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Trappc6bQ9D289 Prmt1-203ENSMUST00000207370 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Trappc6bQ9D289 Eda-206ENSMUST00000113779 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Trappc6bQ9D289 Casp3-201ENSMUST00000093517 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Trappc6bQ9D289 AC093043.3-201ENSMUST00000226531 2273 ntBASIC14.21□□□□□ -0.13
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Trappc6bQ9D289 Fam78b-206ENSMUST00000190081 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
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Trappc6bQ9D289 Lsm10-201ENSMUST00000055575 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
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Trappc6bQ9D289 Nfkbid-202ENSMUST00000108175 2000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Trappc6bQ9D289 Lrrfip1-212ENSMUST00000189617 2155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Trappc6bQ9D289 Tap1-201ENSMUST00000041633 2614 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Trappc6bQ9D289 Tnfrsf25-201ENSMUST00000025706 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Trappc6bQ9D289 Adarb1-202ENSMUST00000098374 6584 ntTSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Trappc6bQ9D289 Csnk1e-201ENSMUST00000117786 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Trappc6bQ9D289 AC133083.1-201ENSMUST00000221736 2209 ntBASIC14.19□□□□□ -0.14
Trappc6bQ9D289 B4galt3-205ENSMUST00000126699 1758 ntTSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.14
Trappc6bQ9D289 Gm16201-202ENSMUST00000139218 2330 ntTSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Trappc6bQ9D289 Cspp1-203ENSMUST00000118263 2162 ntTSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Trappc6bQ9D289 St6gal2-201ENSMUST00000025000 6066 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.14
Trappc6bQ9D289 Atp5c1-202ENSMUST00000114896 1735 ntTSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Trappc6bQ9D289 A930029G22Rik-201ENSMUST00000181032 1710 ntTSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Trappc6bQ9D289 Hdhd2-202ENSMUST00000097521 1716 ntTSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Trappc6bQ9D289 Dmpk-202ENSMUST00000108473 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Trappc6bQ9D289 Pagr1a-202ENSMUST00000200948 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Trappc6bQ9D289 Gm42742-205ENSMUST00000202798 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Trappc6bQ9D289 Mrps18c-203ENSMUST00000112901 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
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Trappc6bQ9D289 Fau-203ENSMUST00000179142 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
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