Protein–RNA interactions for Protein: Q9D287

Bcas2, Pre-mRNA-splicing factor SPF27, mousemouse

Predictions only

Length 225 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Bcas2Q9D287 Washc1-202ENSMUST00000116556 2887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Bcas2Q9D287 E030042O20Rik-201ENSMUST00000135244 1427 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Bcas2Q9D287 Polr3gl-201ENSMUST00000091924 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Bcas2Q9D287 Smad1-203ENSMUST00000109885 3775 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Bcas2Q9D287 Dmpk-203ENSMUST00000108474 2591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Bcas2Q9D287 Pax8-201ENSMUST00000028355 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Bcas2Q9D287 Klc4-201ENSMUST00000003642 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Bcas2Q9D287 Gabrb3-201ENSMUST00000039697 5579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Bcas2Q9D287 St8sia1-201ENSMUST00000032421 8991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Bcas2Q9D287 Nptn-212ENSMUST00000177292 1390 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Bcas2Q9D287 Chst10-201ENSMUST00000027249 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Bcas2Q9D287 Med26-201ENSMUST00000058534 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Bcas2Q9D287 Kdelr2-201ENSMUST00000110731 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Bcas2Q9D287 Clvs2-201ENSMUST00000019920 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Bcas2Q9D287 Oxr1-206ENSMUST00000170127 4251 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Bcas2Q9D287 Safb-207ENSMUST00000182533 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Bcas2Q9D287 Ankra2-201ENSMUST00000022164 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Bcas2Q9D287 Mpst-203ENSMUST00000169133 1309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Bcas2Q9D287 Spock1-201ENSMUST00000172326 1320 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Bcas2Q9D287 Mpdu1-201ENSMUST00000018905 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Bcas2Q9D287 Rflnb-201ENSMUST00000021207 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Bcas2Q9D287 Tmem87b-201ENSMUST00000110325 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Bcas2Q9D287 Brap-201ENSMUST00000031414 3744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Bcas2Q9D287 Mta3-203ENSMUST00000112350 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Bcas2Q9D287 Gm16675-202ENSMUST00000208508 2586 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Bcas2Q9D287 Map3k7-201ENSMUST00000037607 5773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Bcas2Q9D287 Syt8-202ENSMUST00000105976 1289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Bcas2Q9D287 Pdcd5-202ENSMUST00000120714 767 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Bcas2Q9D287 Syt8-205ENSMUST00000122393 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Bcas2Q9D287 Gm2274-201ENSMUST00000184539 609 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Bcas2Q9D287 Gm28876-201ENSMUST00000188137 703 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Bcas2Q9D287 Gm19610-201ENSMUST00000202894 408 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Bcas2Q9D287 Tdg-201ENSMUST00000092266 2959 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Bcas2Q9D287 Ctage5-213ENSMUST00000176464 4434 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Bcas2Q9D287 Gm13074-201ENSMUST00000124848 2735 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Bcas2Q9D287 Ush1c-208ENSMUST00000177212 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Bcas2Q9D287 Sacs-204ENSMUST00000121091 4581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Bcas2Q9D287 Ssfa2-201ENSMUST00000111784 4999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Bcas2Q9D287 Sf1-203ENSMUST00000113488 2282 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Bcas2Q9D287 Nudt16-201ENSMUST00000035179 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Bcas2Q9D287 Tex19.2-201ENSMUST00000039146 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Bcas2Q9D287 Dnajb12-201ENSMUST00000020309 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Bcas2Q9D287 Ccdc13-202ENSMUST00000135986 2640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Bcas2Q9D287 Eml3-202ENSMUST00000224272 2978 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Bcas2Q9D287 Pnkp-203ENSMUST00000107876 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Bcas2Q9D287 9430015G10Rik-208ENSMUST00000169550 2660 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Bcas2Q9D287 P2ry2-206ENSMUST00000208340 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Bcas2Q9D287 Adgrl1-205ENSMUST00000132500 5719 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Bcas2Q9D287 Ogg1-201ENSMUST00000032406 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Bcas2Q9D287 Fgf13-201ENSMUST00000033473 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Bcas2Q9D287 Rnf207-201ENSMUST00000076183 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Bcas2Q9D287 Slc23a3-201ENSMUST00000027405 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Bcas2Q9D287 Mtx2-201ENSMUST00000028511 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Bcas2Q9D287 Adam15-202ENSMUST00000074582 2799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Bcas2Q9D287 Spout1-201ENSMUST00000100220 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Bcas2Q9D287 Itga5-201ENSMUST00000023128 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Bcas2Q9D287 Npm3-ps1-201ENSMUST00000119728 528 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Bcas2Q9D287 Calu-208ENSMUST00000173694 611 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Bcas2Q9D287 Ddah2-204ENSMUST00000174493 1254 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Bcas2Q9D287 Npm3-201ENSMUST00000070215 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Bcas2Q9D287 Nnat-201ENSMUST00000088484 458 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Bcas2Q9D287 Wipi2-201ENSMUST00000036872 5171 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Bcas2Q9D287 Endov-203ENSMUST00000106245 5126 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Bcas2Q9D287 Tmem260-201ENSMUST00000111735 5485 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Bcas2Q9D287 P3h1-203ENSMUST00000102662 2977 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Bcas2Q9D287 Rmnd5b-201ENSMUST00000001081 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Bcas2Q9D287 Tpm2-202ENSMUST00000107913 2098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Bcas2Q9D287 Gm17501-201ENSMUST00000181247 1700 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Bcas2Q9D287 Fndc11-201ENSMUST00000050026 1387 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Bcas2Q9D287 Eme2-202ENSMUST00000121542 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Bcas2Q9D287 Smad3-201ENSMUST00000034973 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Bcas2Q9D287 Eva1c-201ENSMUST00000037539 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Bcas2Q9D287 Trappc3-201ENSMUST00000030660 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Bcas2Q9D287 Gm42473-201ENSMUST00000201056 2291 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Bcas2Q9D287 Rfx5-201ENSMUST00000029772 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Bcas2Q9D287 P2ry6-201ENSMUST00000060174 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Bcas2Q9D287 Nectin2-201ENSMUST00000075447 2735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Bcas2Q9D287 Rasgrp1-207ENSMUST00000178884 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Bcas2Q9D287 Gm13474-201ENSMUST00000122466 815 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Bcas2Q9D287 Gm20472-201ENSMUST00000174403 1240 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Bcas2Q9D287 Snrnp48-202ENSMUST00000178564 847 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Bcas2Q9D287 Ripply2-201ENSMUST00000058846 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Bcas2Q9D287 Serinc2-203ENSMUST00000122374 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Bcas2Q9D287 Hdac2-202ENSMUST00000105510 3250 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Bcas2Q9D287 Nmt2-203ENSMUST00000102989 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Bcas2Q9D287 Dmc1-201ENSMUST00000023065 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Bcas2Q9D287 Grhl2-203ENSMUST00000161405 1996 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Bcas2Q9D287 Rnf138-202ENSMUST00000072847 3002 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Bcas2Q9D287 Nrxn1-206ENSMUST00000160800 5683 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Bcas2Q9D287 Cep152-201ENSMUST00000089776 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Bcas2Q9D287 Zfp553-201ENSMUST00000056232 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Bcas2Q9D287 Edem2-201ENSMUST00000040833 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Bcas2Q9D287 App-202ENSMUST00000226232 3120 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Bcas2Q9D287 Bad-202ENSMUST00000113423 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Bcas2Q9D287 Pdxk-ps-203ENSMUST00000183934 680 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Bcas2Q9D287 Cacna2d1-207ENSMUST00000196750 1272 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Bcas2Q9D287 Cfap20-208ENSMUST00000213086 2544 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Bcas2Q9D287 Tm9sf1-204ENSMUST00000121937 2398 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Bcas2Q9D287 Cfap206-201ENSMUST00000029971 2246 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Bcas2Q9D287 Elp6-201ENSMUST00000068071 2219 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.9 ms