Protein–RNA interactions for Protein: Q9D1Q5

Serpinb3b, MCG21235, mousemouse

Predictions only

Length 387 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Serpinb3bQ9D1Q5 Cpd-201ENSMUST00000021201 7946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Serpinb3bQ9D1Q5 Mterf1a-202ENSMUST00000117463 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Serpinb3bQ9D1Q5 Rab7-203ENSMUST00000113597 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Serpinb3bQ9D1Q5 Gal3st1-201ENSMUST00000063004 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Serpinb3bQ9D1Q5 Mid1ip1-202ENSMUST00000115524 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Serpinb3bQ9D1Q5 Glra1-201ENSMUST00000075603 2037 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Serpinb3bQ9D1Q5 Eif2b4-201ENSMUST00000077693 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Serpinb3bQ9D1Q5 Mid1ip1-201ENSMUST00000008179 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Serpinb3bQ9D1Q5 Ndufaf3-201ENSMUST00000074208 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Serpinb3bQ9D1Q5 Dnajc19-201ENSMUST00000011029 2499 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Serpinb3bQ9D1Q5 Tmem267-205ENSMUST00000223912 1789 ntAPPRIS P1 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Serpinb3bQ9D1Q5 Ccdc24-201ENSMUST00000106422 1365 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Serpinb3bQ9D1Q5 Atat1-214ENSMUST00000149277 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Serpinb3bQ9D1Q5 Xrcc6-202ENSMUST00000100399 3296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Serpinb3bQ9D1Q5 Fip1l1-203ENSMUST00000113535 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Serpinb3bQ9D1Q5 Wnt4-201ENSMUST00000045747 4194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Serpinb3bQ9D1Q5 Dbnl-202ENSMUST00000102928 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Serpinb3bQ9D1Q5 Nrxn1-217ENSMUST00000174337 3021 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Serpinb3bQ9D1Q5 Sdhb-201ENSMUST00000010007 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Serpinb3bQ9D1Q5 Gm25990-201ENSMUST00000102440 86 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
Serpinb3bQ9D1Q5 Psen2-203ENSMUST00000111105 1575 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Serpinb3bQ9D1Q5 Gm13418-201ENSMUST00000119097 944 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
Serpinb3bQ9D1Q5 Gm28626-201ENSMUST00000187004 520 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Serpinb3bQ9D1Q5 AC148328.1-201ENSMUST00000216448 920 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Serpinb3bQ9D1Q5 Hpn-201ENSMUST00000039435 1743 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Serpinb3bQ9D1Q5 Chmp2a-201ENSMUST00000005711 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Serpinb3bQ9D1Q5 Aqp12-201ENSMUST00000059676 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Serpinb3bQ9D1Q5 Atp8b1-201ENSMUST00000025482 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Serpinb3bQ9D1Q5 Scly-201ENSMUST00000027532 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Serpinb3bQ9D1Q5 Hcn2-202ENSMUST00000099513 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Serpinb3bQ9D1Q5 Tspoap1-202ENSMUST00000100644 7390 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Serpinb3bQ9D1Q5 Pofut2-201ENSMUST00000020493 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Serpinb3bQ9D1Q5 Sh2b1-203ENSMUST00000205440 3089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Serpinb3bQ9D1Q5 B020017C02Rik-201ENSMUST00000197444 1688 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
Serpinb3bQ9D1Q5 Rom1-201ENSMUST00000096242 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Serpinb3bQ9D1Q5 Hps4-201ENSMUST00000035279 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Serpinb3bQ9D1Q5 Naprt-201ENSMUST00000023237 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Serpinb3bQ9D1Q5 9530059O14Rik-202ENSMUST00000181682 2093 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Serpinb3bQ9D1Q5 Podnl1-201ENSMUST00000093380 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Serpinb3bQ9D1Q5 Gm26526-201ENSMUST00000181075 2927 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Serpinb3bQ9D1Q5 Rab9-202ENSMUST00000112091 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Serpinb3bQ9D1Q5 Stxbp3-205ENSMUST00000138552 1789 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Serpinb3bQ9D1Q5 Lhx1os-201ENSMUST00000126072 589 ntTSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Serpinb3bQ9D1Q5 Gm12480-201ENSMUST00000129576 774 ntTSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Serpinb3bQ9D1Q5 Fbxo17-205ENSMUST00000167118 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Serpinb3bQ9D1Q5 Smarca5-ps-202ENSMUST00000171805 1284 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
Serpinb3bQ9D1Q5 H2-Bl-201ENSMUST00000173080 1138 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Serpinb3bQ9D1Q5 H2-Bl-204ENSMUST00000184502 862 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Serpinb3bQ9D1Q5 Pmf1-205ENSMUST00000193338 795 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Serpinb3bQ9D1Q5 Gm37584-201ENSMUST00000193595 1290 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
Serpinb3bQ9D1Q5 Fosb-206ENSMUST00000208446 1090 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Serpinb3bQ9D1Q5 Timm13-204ENSMUST00000219896 542 ntTSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Serpinb3bQ9D1Q5 Bex3-201ENSMUST00000053540 930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Serpinb3bQ9D1Q5 Isg15-201ENSMUST00000085425 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Serpinb3bQ9D1Q5 Jmy-201ENSMUST00000065537 8776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Serpinb3bQ9D1Q5 Asph-204ENSMUST00000084915 2884 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Serpinb3bQ9D1Q5 Ppif-201ENSMUST00000022419 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Serpinb3bQ9D1Q5 Bean1-201ENSMUST00000093245 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Serpinb3bQ9D1Q5 Rgs9-202ENSMUST00000103062 1743 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Serpinb3bQ9D1Q5 Kifc3-203ENSMUST00000169748 3384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Serpinb3bQ9D1Q5 Xpo4-209ENSMUST00000174545 8680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Serpinb3bQ9D1Q5 Tmem198-201ENSMUST00000050899 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Serpinb3bQ9D1Q5 Gm10505-201ENSMUST00000151398 1587 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Serpinb3bQ9D1Q5 Bcor-202ENSMUST00000065143 6839 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Serpinb3bQ9D1Q5 Tpt1-201ENSMUST00000110894 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Serpinb3bQ9D1Q5 Gm15510-201ENSMUST00000123644 1172 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Serpinb3bQ9D1Q5 Mir5131-201ENSMUST00000175426 93 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
Serpinb3bQ9D1Q5 A830052D11Rik-201ENSMUST00000181729 1130 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Serpinb3bQ9D1Q5 Gm42413-201ENSMUST00000196216 338 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Serpinb3bQ9D1Q5 Olfr572-203ENSMUST00000215782 1233 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Serpinb3bQ9D1Q5 Prm1-201ENSMUST00000023144 469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Serpinb3bQ9D1Q5 Dars-202ENSMUST00000064309 645 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Serpinb3bQ9D1Q5 Hs3st1-201ENSMUST00000053116 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Serpinb3bQ9D1Q5 D430001F17Rik-201ENSMUST00000141344 1858 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Serpinb3bQ9D1Q5 Stk39-201ENSMUST00000102715 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Serpinb3bQ9D1Q5 Cdkn1a-201ENSMUST00000023829 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Serpinb3bQ9D1Q5 4930528D03Rik-201ENSMUST00000181528 1339 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Serpinb3bQ9D1Q5 Fam72a-201ENSMUST00000068613 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Serpinb3bQ9D1Q5 Coq6-202ENSMUST00000110276 1776 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Serpinb3bQ9D1Q5 Syt3-202ENSMUST00000118962 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Serpinb3bQ9D1Q5 4930512B01Rik-201ENSMUST00000021378 1856 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Serpinb3bQ9D1Q5 Gabpa-201ENSMUST00000009120 4987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Serpinb3bQ9D1Q5 Ccnl1-201ENSMUST00000029416 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Serpinb3bQ9D1Q5 Nnat-202ENSMUST00000109526 1213 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Serpinb3bQ9D1Q5 Timm23-201ENSMUST00000013845 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Serpinb3bQ9D1Q5 Gm15246-201ENSMUST00000149873 540 ntTSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Serpinb3bQ9D1Q5 Rps13-ps1-201ENSMUST00000183478 538 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
Serpinb3bQ9D1Q5 AC138767.1-201ENSMUST00000222661 415 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
Serpinb3bQ9D1Q5 AC154757.1-201ENSMUST00000228289 336 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
Serpinb3bQ9D1Q5 Aurkaip1-201ENSMUST00000084097 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Serpinb3bQ9D1Q5 Ythdf2-201ENSMUST00000085181 955 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Serpinb3bQ9D1Q5 Slc29a1-202ENSMUST00000064889 1988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Serpinb3bQ9D1Q5 Rhof-201ENSMUST00000031401 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Serpinb3bQ9D1Q5 Lhx6-205ENSMUST00000112967 3378 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Serpinb3bQ9D1Q5 Ncoa5-201ENSMUST00000040381 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Serpinb3bQ9D1Q5 Sec1-201ENSMUST00000040636 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Serpinb3bQ9D1Q5 Tcp11-202ENSMUST00000043925 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Serpinb3bQ9D1Q5 Cmc2-205ENSMUST00000148235 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Serpinb3bQ9D1Q5 Sctr-201ENSMUST00000072886 2012 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Serpinb3bQ9D1Q5 Fignl2-201ENSMUST00000178140 4206 ntAPPRIS P1 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.9 ms