Protein–RNA interactions for Protein: Q9D1F3

Uncharacterized protein CXorf40 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 157 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q9D1F3 1700021F07Rik-201ENSMUST00000029023 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Q9D1F3 Mdk-202ENSMUST00000069423 773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Q9D1F3 Acyp2-201ENSMUST00000074613 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Q9D1F3 Pik3ip1-202ENSMUST00000093399 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Q9D1F3 Slc25a47-202ENSMUST00000221080 1890 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Q9D1F3 Il11ra1-202ENSMUST00000108040 1837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
Q9D1F3 Mettl27-204ENSMUST00000111219 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Q9D1F3 E330011M16Rik-201ENSMUST00000193614 1794 ntBASIC16.77■□□□□ 0.27
Q9D1F3 Prlhr-201ENSMUST00000051277 1572 ntAPPRIS P1 BASIC16.77■□□□□ 0.27
Q9D1F3 Fosl1-201ENSMUST00000025850 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Q9D1F3 Mtmr12-201ENSMUST00000038172 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Q9D1F3 Gne-202ENSMUST00000102936 2920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Q9D1F3 Bhlhe41-202ENSMUST00000111703 744 ntTSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Q9D1F3 Gm6184-201ENSMUST00000120403 1261 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Q9D1F3 Gm16194-203ENSMUST00000141239 362 ntTSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Q9D1F3 Tsc22d1-208ENSMUST00000142683 797 ntTSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Q9D1F3 Dpf3-205ENSMUST00000177801 1092 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Q9D1F3 Gm42670-201ENSMUST00000201816 1292 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Q9D1F3 Gm43935-201ENSMUST00000203569 1050 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Q9D1F3 Gm20383-201ENSMUST00000203799 1227 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Q9D1F3 Ap2s1-204ENSMUST00000205607 372 ntTSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Q9D1F3 Gm36584-201ENSMUST00000209046 708 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Q9D1F3 Tnp2-201ENSMUST00000051297 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Q9D1F3 Hist1h2bg-201ENSMUST00000079251 618 ntAPPRIS P1 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Q9D1F3 Hist1h2bn-201ENSMUST00000091709 381 ntAPPRIS P1 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Q9D1F3 Spata2l-202ENSMUST00000166768 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Q9D1F3 Tmem56-203ENSMUST00000128909 6696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Q9D1F3 Dcaf8-206ENSMUST00000192704 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Q9D1F3 Tekt1-202ENSMUST00000108502 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Q9D1F3 Ddx39b-203ENSMUST00000173731 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Q9D1F3 Baz1a-205ENSMUST00000173433 5788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Q9D1F3 Nsmce3-201ENSMUST00000094331 5946 ntAPPRIS P1 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Q9D1F3 Tdh-201ENSMUST00000022522 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Q9D1F3 Mvk-201ENSMUST00000043760 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Q9D1F3 Zdhhc15-201ENSMUST00000042070 5509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Q9D1F3 Pigw-201ENSMUST00000067058 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Q9D1F3 Gm26608-201ENSMUST00000180740 1954 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Q9D1F3 Tubgcp4-203ENSMUST00000110658 4250 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Q9D1F3 Hmgb1-208ENSMUST00000139443 923 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Q9D1F3 AC154222.1-201ENSMUST00000223882 475 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Q9D1F3 Dcps-201ENSMUST00000034539 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Q9D1F3 A830031A19Rik-201ENSMUST00000068360 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Q9D1F3 Slbp-202ENSMUST00000075670 1027 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Q9D1F3 Relb-201ENSMUST00000049912 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Q9D1F3 Cyb5d2-201ENSMUST00000079681 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Q9D1F3 Mif4gd-201ENSMUST00000021087 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Q9D1F3 Nadk2-202ENSMUST00000100789 3578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Q9D1F3 Tfap2a-208ENSMUST00000224999 2058 ntAPPRIS ALT1 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Q9D1F3 Fam104a-201ENSMUST00000120194 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Q9D1F3 Fbxo24-202ENSMUST00000111002 2306 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Q9D1F3 Pacsin1-204ENSMUST00000114873 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Q9D1F3 Arhgef9-208ENSMUST00000128565 2285 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Q9D1F3 Slit1-203ENSMUST00000169141 5673 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Q9D1F3 Ndufs7-202ENSMUST00000105364 983 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Q9D1F3 Aig1-202ENSMUST00000105534 617 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Q9D1F3 Gm7222-201ENSMUST00000117512 906 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Q9D1F3 Pgam1-ps1-201ENSMUST00000119107 749 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Q9D1F3 Mpc1-205ENSMUST00000142594 961 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Q9D1F3 CT943659.1-201ENSMUST00000215459 326 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Q9D1F3 Gins1-201ENSMUST00000028948 1087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Q9D1F3 Ing1-202ENSMUST00000209565 1971 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Q9D1F3 Usp21-201ENSMUST00000065941 2219 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Q9D1F3 Dpy19l1-203ENSMUST00000142064 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Q9D1F3 Layn-204ENSMUST00000217212 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Q9D1F3 Prdm11-201ENSMUST00000111272 3012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Q9D1F3 Gm5837-201ENSMUST00000191844 1369 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Q9D1F3 9330111N05Rik-202ENSMUST00000181043 2449 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Q9D1F3 Eps8-201ENSMUST00000058210 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Q9D1F3 Rhobtb1-202ENSMUST00000067908 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Q9D1F3 Nxnl1-201ENSMUST00000048243 2285 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Q9D1F3 Trim68-201ENSMUST00000082175 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Q9D1F3 Nagpa-203ENSMUST00000147567 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Q9D1F3 Phkg2-202ENSMUST00000121004 1840 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Q9D1F3 Ctbp2-201ENSMUST00000033269 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Q9D1F3 Nmt2-203ENSMUST00000102989 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Q9D1F3 Gm14140-201ENSMUST00000119999 995 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Q9D1F3 Tex30-206ENSMUST00000133677 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Q9D1F3 Mcub-204ENSMUST00000153506 1005 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Q9D1F3 Pmf1-205ENSMUST00000193338 795 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Q9D1F3 D530014G21Rik-201ENSMUST00000208416 587 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Q9D1F3 2010003K11Rik-201ENSMUST00000048482 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Q9D1F3 Coq10b-202ENSMUST00000087617 834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Q9D1F3 Klc1-202ENSMUST00000118471 2272 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Q9D1F3 Pea15a-201ENSMUST00000013842 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Q9D1F3 Gm26718-201ENSMUST00000181048 1378 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Q9D1F3 Map1lc3b-204ENSMUST00000181826 2633 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Q9D1F3 Gm28111-201ENSMUST00000187786 1393 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Q9D1F3 Cbx2-201ENSMUST00000026662 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Q9D1F3 Ttyh1-217ENSMUST00000206869 1491 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Q9D1F3 Nkapl-201ENSMUST00000068235 1463 ntAPPRIS P1 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Q9D1F3 Arid4b-204ENSMUST00000110536 5783 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Q9D1F3 Ext2-212ENSMUST00000184931 2629 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Q9D1F3 Blmh-201ENSMUST00000021197 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Q9D1F3 Shox2-202ENSMUST00000162060 1537 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Q9D1F3 Schip1-201ENSMUST00000029346 2201 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Q9D1F3 Adnp2-201ENSMUST00000066743 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Q9D1F3 Strn-203ENSMUST00000145910 8629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Q9D1F3 Ankra2-203ENSMUST00000123924 2328 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Q9D1F3 Trap1-201ENSMUST00000006137 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Q9D1F3 Rpl39l-202ENSMUST00000121292 550 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.3 ms