Protein–RNA interactions for Protein: Q9D1E5

Lmbr1l, Protein LMBR1L, mousemouse

Predictions only

Length 489 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lmbr1lQ9D1E5 Sirt6-202ENSMUST00000119324 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Lmbr1lQ9D1E5 Gm19439-201ENSMUST00000198195 2273 ntBASIC20■□□□□ 0.79
Lmbr1lQ9D1E5 Slc22a16-202ENSMUST00000078314 2269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Lmbr1lQ9D1E5 Cdkn1a-201ENSMUST00000023829 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Lmbr1lQ9D1E5 Gins4-201ENSMUST00000033950 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Lmbr1lQ9D1E5 Comp-201ENSMUST00000003659 2416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Lmbr1lQ9D1E5 Lrch4-201ENSMUST00000031734 3078 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Lmbr1lQ9D1E5 Gstm4-201ENSMUST00000029489 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Lmbr1lQ9D1E5 Ptpre-201ENSMUST00000073961 5410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Lmbr1lQ9D1E5 Fam221a-201ENSMUST00000060561 2730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Lmbr1lQ9D1E5 D430001F17Rik-201ENSMUST00000141344 1858 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Lmbr1lQ9D1E5 Flot1-209ENSMUST00000174080 1383 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Lmbr1lQ9D1E5 Snupn-201ENSMUST00000068856 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Lmbr1lQ9D1E5 Kat5-201ENSMUST00000113641 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Lmbr1lQ9D1E5 Atp8b2-201ENSMUST00000069805 5559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Lmbr1lQ9D1E5 Prrt4-201ENSMUST00000159200 3411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Lmbr1lQ9D1E5 1700008O03Rik-201ENSMUST00000107933 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Lmbr1lQ9D1E5 9430038I01Rik-202ENSMUST00000117404 699 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Lmbr1lQ9D1E5 Slbp-205ENSMUST00000139518 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Lmbr1lQ9D1E5 BC048679-202ENSMUST00000144156 640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Lmbr1lQ9D1E5 Mkln1os-202ENSMUST00000144232 964 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Lmbr1lQ9D1E5 Bpifa3-201ENSMUST00000028984 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Lmbr1lQ9D1E5 Hbb-bt-201ENSMUST00000098192 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Lmbr1lQ9D1E5 Sil1-201ENSMUST00000025215 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Lmbr1lQ9D1E5 Trpc4ap-201ENSMUST00000041059 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Lmbr1lQ9D1E5 Slc25a23-201ENSMUST00000040280 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Lmbr1lQ9D1E5 Sox13-201ENSMUST00000094551 1842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Lmbr1lQ9D1E5 Celf6-204ENSMUST00000121266 2610 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Lmbr1lQ9D1E5 Map4k5-201ENSMUST00000049239 4452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Lmbr1lQ9D1E5 Hpn-201ENSMUST00000039435 1743 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Lmbr1lQ9D1E5 Iqsec2-207ENSMUST00000168786 5993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Lmbr1lQ9D1E5 Cacna1a-202ENSMUST00000122053 7589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Lmbr1lQ9D1E5 Zbtb24-201ENSMUST00000080771 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Lmbr1lQ9D1E5 Cdv3-201ENSMUST00000035484 3387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Lmbr1lQ9D1E5 Grk6-201ENSMUST00000001115 2994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Lmbr1lQ9D1E5 Dvl2-201ENSMUST00000019362 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Lmbr1lQ9D1E5 Gm4459-201ENSMUST00000118750 468 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
Lmbr1lQ9D1E5 Gm7616-201ENSMUST00000143112 624 ntTSL 3 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Lmbr1lQ9D1E5 Smarca5-ps-202ENSMUST00000171805 1284 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
Lmbr1lQ9D1E5 Gm3336-201ENSMUST00000179347 1149 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Lmbr1lQ9D1E5 Gm21887-202ENSMUST00000179760 483 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Lmbr1lQ9D1E5 Bag2-203ENSMUST00000187602 378 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Lmbr1lQ9D1E5 Gm3336-202ENSMUST00000213065 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Lmbr1lQ9D1E5 Lce3f-201ENSMUST00000090863 611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Lmbr1lQ9D1E5 Lrig1-201ENSMUST00000032105 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Lmbr1lQ9D1E5 Nfib-205ENSMUST00000107247 3267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Lmbr1lQ9D1E5 Kcnq2-201ENSMUST00000016491 3067 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Lmbr1lQ9D1E5 Ilvbl-204ENSMUST00000218271 1606 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Lmbr1lQ9D1E5 Coq6-202ENSMUST00000110276 1776 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Lmbr1lQ9D1E5 Cdk17-201ENSMUST00000069965 3615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Lmbr1lQ9D1E5 Relt-201ENSMUST00000008462 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Lmbr1lQ9D1E5 Sco1-201ENSMUST00000092996 2412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Lmbr1lQ9D1E5 Fam171b-201ENSMUST00000051454 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Lmbr1lQ9D1E5 Gm18856-201ENSMUST00000178096 1374 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
Lmbr1lQ9D1E5 Acss2-201ENSMUST00000029135 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Lmbr1lQ9D1E5 Csnk1a1-206ENSMUST00000165721 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Lmbr1lQ9D1E5 Ankra2-204ENSMUST00000150352 2217 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Lmbr1lQ9D1E5 Ndufb6-202ENSMUST00000108108 480 ntTSL 3 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Lmbr1lQ9D1E5 Psmc4-206ENSMUST00000140053 1244 ntTSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Lmbr1lQ9D1E5 Rgp1-201ENSMUST00000030190 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Lmbr1lQ9D1E5 Apopt1-201ENSMUST00000040519 1065 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Lmbr1lQ9D1E5 Olah-202ENSMUST00000115087 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Lmbr1lQ9D1E5 Zfand5-201ENSMUST00000025659 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Lmbr1lQ9D1E5 Gm16867-201ENSMUST00000179116 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Lmbr1lQ9D1E5 Grk3-203ENSMUST00000197776 1570 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Lmbr1lQ9D1E5 Ccni-201ENSMUST00000058550 2804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Lmbr1lQ9D1E5 Sox4-201ENSMUST00000067230 4795 ntAPPRIS P1 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Lmbr1lQ9D1E5 Rab9-202ENSMUST00000112091 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Lmbr1lQ9D1E5 Cdca3-201ENSMUST00000024270 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Lmbr1lQ9D1E5 Tsc22d1-208ENSMUST00000142683 797 ntTSL 3 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Lmbr1lQ9D1E5 Gm28577-201ENSMUST00000176106 741 ntTSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Lmbr1lQ9D1E5 Gm18195-201ENSMUST00000207604 706 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
Lmbr1lQ9D1E5 Timm10b-211ENSMUST00000210350 529 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Lmbr1lQ9D1E5 Pard6a-204ENSMUST00000212352 1234 ntTSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Lmbr1lQ9D1E5 Klhl40-201ENSMUST00000098272 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Lmbr1lQ9D1E5 Krt6b-201ENSMUST00000023786 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Lmbr1lQ9D1E5 Derl3-202ENSMUST00000217811 1316 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Lmbr1lQ9D1E5 Slc2a8-201ENSMUST00000028129 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Lmbr1lQ9D1E5 Psen2-203ENSMUST00000111105 1575 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Lmbr1lQ9D1E5 Spock3-204ENSMUST00000119068 3201 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Lmbr1lQ9D1E5 Cnot9-201ENSMUST00000087215 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Lmbr1lQ9D1E5 Atad2b-201ENSMUST00000045664 8035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Lmbr1lQ9D1E5 Cdc23-201ENSMUST00000025228 2084 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Lmbr1lQ9D1E5 H2-T-ps-201ENSMUST00000172538 1067 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
Lmbr1lQ9D1E5 1300002E11Rik-207ENSMUST00000211443 767 ntTSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Lmbr1lQ9D1E5 Olfr1272-201ENSMUST00000099750 927 ntAPPRIS P1 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Lmbr1lQ9D1E5 Arhgef7-205ENSMUST00000110909 4926 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Lmbr1lQ9D1E5 Inhba-202ENSMUST00000164993 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Lmbr1lQ9D1E5 Gm40773-201ENSMUST00000218113 1502 ntTSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Lmbr1lQ9D1E5 Krt23-201ENSMUST00000006969 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Lmbr1lQ9D1E5 Sctr-202ENSMUST00000189037 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Lmbr1lQ9D1E5 Podnl1-201ENSMUST00000093380 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Lmbr1lQ9D1E5 Adam22-201ENSMUST00000046838 2773 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Lmbr1lQ9D1E5 Scarf2-201ENSMUST00000012161 3302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Lmbr1lQ9D1E5 Nsmf-207ENSMUST00000116574 2863 ntTSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Lmbr1lQ9D1E5 Ddx41-204ENSMUST00000224765 2199 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
Lmbr1lQ9D1E5 Gm45774-201ENSMUST00000211992 2665 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
Lmbr1lQ9D1E5 Lrch3-211ENSMUST00000170899 2752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Lmbr1lQ9D1E5 Gm17200-201ENSMUST00000170214 2022 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Lmbr1lQ9D1E5 Ppif-201ENSMUST00000022419 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.9 ms