Protein–RNA interactions for Protein: Q9D1D1

Tspan11, Tetraspanin-11, mousemouse

Predictions only

Length 253 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tspan11Q9D1D1 Rgs9-202ENSMUST00000103062 1743 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Tspan11Q9D1D1 Ogfr-201ENSMUST00000029087 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Tspan11Q9D1D1 Zscan10-204ENSMUST00000118369 1006 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Tspan11Q9D1D1 Mrps6-201ENSMUST00000047429 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Tspan11Q9D1D1 Tmem131-201ENSMUST00000027290 6546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Tspan11Q9D1D1 Agfg1-208ENSMUST00000190052 2991 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Tspan11Q9D1D1 Bicdl1-204ENSMUST00000121746 1568 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Tspan11Q9D1D1 Emd-201ENSMUST00000002029 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Tspan11Q9D1D1 Gm29455-202ENSMUST00000186697 1369 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Tspan11Q9D1D1 Aaed1-202ENSMUST00000220895 2858 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Tspan11Q9D1D1 4933434E20Rik-209ENSMUST00000162114 1411 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Tspan11Q9D1D1 Lcorl-202ENSMUST00000045586 5708 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Tspan11Q9D1D1 Uso1-201ENSMUST00000031355 3898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Tspan11Q9D1D1 Borcs5-201ENSMUST00000062755 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Tspan11Q9D1D1 2810410L24Rik-202ENSMUST00000155681 2615 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Tspan11Q9D1D1 Lrig3-201ENSMUST00000074807 4016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Tspan11Q9D1D1 Man2a2-201ENSMUST00000098346 6554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Tspan11Q9D1D1 Mier2-203ENSMUST00000165028 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Tspan11Q9D1D1 Mycl-201ENSMUST00000030407 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Tspan11Q9D1D1 Ppp1r2-202ENSMUST00000115233 958 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Tspan11Q9D1D1 Gm13312-201ENSMUST00000119631 718 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Tspan11Q9D1D1 Gm7284-201ENSMUST00000131667 944 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Tspan11Q9D1D1 Gm12973-201ENSMUST00000143967 607 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Tspan11Q9D1D1 Gm38119-201ENSMUST00000192027 755 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Tspan11Q9D1D1 Dmc1-201ENSMUST00000023065 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Tspan11Q9D1D1 Trip6-201ENSMUST00000024119 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Tspan11Q9D1D1 Nit1-202ENSMUST00000111295 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Tspan11Q9D1D1 Ogfod3-201ENSMUST00000026169 1308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Tspan11Q9D1D1 Sorbs1-225ENSMUST00000226047 2582 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Tspan11Q9D1D1 Hs3st1-201ENSMUST00000053116 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Tspan11Q9D1D1 Ubl7-201ENSMUST00000163329 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Tspan11Q9D1D1 Dmgdh-201ENSMUST00000048001 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Tspan11Q9D1D1 Smtn-201ENSMUST00000020718 1747 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Tspan11Q9D1D1 Gstm4-201ENSMUST00000029489 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Tspan11Q9D1D1 Hpn-201ENSMUST00000039435 1743 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Tspan11Q9D1D1 Pld2-201ENSMUST00000018429 3659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Tspan11Q9D1D1 9530085L11Rik-201ENSMUST00000203963 2115 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Tspan11Q9D1D1 2810039B14Rik-201ENSMUST00000183928 1459 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Tspan11Q9D1D1 Mepce-201ENSMUST00000031740 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Tspan11Q9D1D1 Sort1-201ENSMUST00000102632 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Tspan11Q9D1D1 Sucla2-203ENSMUST00000160507 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Tspan11Q9D1D1 Slc22a16-202ENSMUST00000078314 2269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Tspan11Q9D1D1 Pla2g2c-201ENSMUST00000030530 1618 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Tspan11Q9D1D1 Tle2-213ENSMUST00000146358 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Tspan11Q9D1D1 Zfp133-ps-202ENSMUST00000124788 1079 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Tspan11Q9D1D1 Lce1k-201ENSMUST00000179917 663 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Tspan11Q9D1D1 Ak6-201ENSMUST00000022135 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Tspan11Q9D1D1 AC114585.2-202ENSMUST00000228094 426 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Tspan11Q9D1D1 Gmnn-201ENSMUST00000006898 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Tspan11Q9D1D1 Ankib1-201ENSMUST00000043551 6426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Tspan11Q9D1D1 Seh1l-201ENSMUST00000025421 3516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Tspan11Q9D1D1 Fam159b-201ENSMUST00000043061 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Tspan11Q9D1D1 Zfp862-ps-203ENSMUST00000203848 1776 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Tspan11Q9D1D1 Hsdl2-201ENSMUST00000030078 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Tspan11Q9D1D1 Rbfox2-206ENSMUST00000227314 1810 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Tspan11Q9D1D1 Prss54-201ENSMUST00000052690 1438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Tspan11Q9D1D1 Tmem132e-201ENSMUST00000054245 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Tspan11Q9D1D1 Mfsd12-201ENSMUST00000044844 3971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Tspan11Q9D1D1 Slain2-201ENSMUST00000143829 4828 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Tspan11Q9D1D1 Cd40-202ENSMUST00000073707 1596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tspan11Q9D1D1 Taf5l-201ENSMUST00000093039 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tspan11Q9D1D1 Trappc11-202ENSMUST00000120987 2060 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tspan11Q9D1D1 Hs3st2-201ENSMUST00000084628 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tspan11Q9D1D1 Rnf181-203ENSMUST00000114095 869 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tspan11Q9D1D1 Aicda-202ENSMUST00000160685 1292 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tspan11Q9D1D1 1110065P20Rik-204ENSMUST00000163946 762 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tspan11Q9D1D1 Lmo1-203ENSMUST00000208136 772 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tspan11Q9D1D1 Gm35154-202ENSMUST00000217008 1093 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tspan11Q9D1D1 Otx2os1-206ENSMUST00000228153 787 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Tspan11Q9D1D1 Large1-202ENSMUST00000119826 4647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tspan11Q9D1D1 Fam219b-202ENSMUST00000114200 3017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tspan11Q9D1D1 Cmtm3-201ENSMUST00000034343 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Tspan11Q9D1D1 Abcb10-201ENSMUST00000075578 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Tspan11Q9D1D1 Lrrc45-201ENSMUST00000026139 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Tspan11Q9D1D1 H2-Q4-201ENSMUST00000081435 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Tspan11Q9D1D1 Ttc39b-202ENSMUST00000048274 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Tspan11Q9D1D1 March2-201ENSMUST00000066121 3400 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Tspan11Q9D1D1 Cdh24-201ENSMUST00000067784 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Tspan11Q9D1D1 Ppp2r2a-204ENSMUST00000225380 1988 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Tspan11Q9D1D1 Haspin-201ENSMUST00000052140 2810 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Tspan11Q9D1D1 Kcnd3-202ENSMUST00000098761 7169 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Tspan11Q9D1D1 Cd82-204ENSMUST00000111257 1003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Tspan11Q9D1D1 Gm16272-201ENSMUST00000128218 388 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Tspan11Q9D1D1 Ctsd-202ENSMUST00000151120 2127 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Tspan11Q9D1D1 AC153794.1-201ENSMUST00000169148 126 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Tspan11Q9D1D1 Celrr-203ENSMUST00000185678 937 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Tspan11Q9D1D1 Tsr3-201ENSMUST00000063574 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Tspan11Q9D1D1 Gfra4-202ENSMUST00000066958 783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Tspan11Q9D1D1 Ankrd13b-201ENSMUST00000037593 3105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Tspan11Q9D1D1 Pofut2-201ENSMUST00000020493 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Tspan11Q9D1D1 Ccnyl1-202ENSMUST00000114077 3281 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Tspan11Q9D1D1 Trim37-201ENSMUST00000041282 5632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Tspan11Q9D1D1 Pias4-201ENSMUST00000005064 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Tspan11Q9D1D1 Jdp2-202ENSMUST00000171754 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Tspan11Q9D1D1 BC030336-201ENSMUST00000060175 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Tspan11Q9D1D1 Mirt1-201ENSMUST00000180489 5292 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Tspan11Q9D1D1 Tpm1-215ENSMUST00000113705 1759 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Tspan11Q9D1D1 Gm45723-201ENSMUST00000212135 1783 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Tspan11Q9D1D1 Rnf170-209ENSMUST00000209300 1881 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Tspan11Q9D1D1 Dhx30-224ENSMUST00000200066 4623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 166.5 ms