Protein–RNA interactions for Protein: Q9D176

Susd3, Sushi domain-containing protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 269 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Susd3Q9D176 Layn-204ENSMUST00000217212 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Susd3Q9D176 Gm11505-201ENSMUST00000130442 737 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Susd3Q9D176 Meg3-208ENSMUST00000143847 706 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Susd3Q9D176 Gm25406-201ENSMUST00000157599 105 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Susd3Q9D176 Polr2m-202ENSMUST00000163972 2138 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Susd3Q9D176 Mpped1-210ENSMUST00000172115 795 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Susd3Q9D176 Mpped1-211ENSMUST00000172398 795 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Susd3Q9D176 Mir7036b-201ENSMUST00000184791 63 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Susd3Q9D176 Prr29-205ENSMUST00000190268 1141 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Susd3Q9D176 Gm37153-201ENSMUST00000193637 231 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Susd3Q9D176 Gm34933-201ENSMUST00000203245 1067 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Susd3Q9D176 Ano10-206ENSMUST00000216670 2108 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Susd3Q9D176 AC155729.1-201ENSMUST00000227758 544 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Susd3Q9D176 Tssk3-201ENSMUST00000000421 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Susd3Q9D176 Crygn-201ENSMUST00000047119 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Susd3Q9D176 Iqcf3-201ENSMUST00000062917 1131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Susd3Q9D176 Rxfp4-201ENSMUST00000063119 1245 ntAPPRIS P1 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Susd3Q9D176 Gm4559-201ENSMUST00000080669 600 ntAPPRIS P1 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Susd3Q9D176 Gm25857-201ENSMUST00000082788 129 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Susd3Q9D176 Ddx39b-203ENSMUST00000173731 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Susd3Q9D176 Ncoa5-203ENSMUST00000122070 3117 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Susd3Q9D176 Foxo3-204ENSMUST00000175881 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Susd3Q9D176 Lca5l-201ENSMUST00000054855 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Susd3Q9D176 Mfsd13a-201ENSMUST00000086969 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Susd3Q9D176 Mark2-202ENSMUST00000032557 4488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Susd3Q9D176 Zfp219-204ENSMUST00000226522 2804 ntAPPRIS P2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Susd3Q9D176 Elf2-212ENSMUST00000194641 5919 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Susd3Q9D176 Gatc-201ENSMUST00000139167 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Susd3Q9D176 Ints6-201ENSMUST00000053959 4993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Susd3Q9D176 Klf16-201ENSMUST00000038558 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Susd3Q9D176 Mff-202ENSMUST00000078332 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Susd3Q9D176 2810004N23Rik-201ENSMUST00000034465 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Susd3Q9D176 Retreg1-201ENSMUST00000022881 3248 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Susd3Q9D176 Lypd1-205ENSMUST00000162899 1511 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Susd3Q9D176 Hunk-201ENSMUST00000065856 5009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Susd3Q9D176 Podxl2-201ENSMUST00000038409 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Susd3Q9D176 Gm6226-201ENSMUST00000117765 1146 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Susd3Q9D176 Mtmr2-209ENSMUST00000156801 617 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Susd3Q9D176 Gm2308-201ENSMUST00000166539 1004 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Susd3Q9D176 Gm29683-202ENSMUST00000208511 720 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Susd3Q9D176 Lce1d-201ENSMUST00000029524 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Susd3Q9D176 Taf1d-201ENSMUST00000034415 1148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Susd3Q9D176 Myoz3-201ENSMUST00000056533 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Susd3Q9D176 Olfr370-201ENSMUST00000058609 1096 ntAPPRIS P1 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Susd3Q9D176 Lancl1-203ENSMUST00000119559 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Susd3Q9D176 Zpbp2-203ENSMUST00000107509 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Susd3Q9D176 Gipc2-201ENSMUST00000046614 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Susd3Q9D176 5031439G07Rik-203ENSMUST00000165743 5032 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Susd3Q9D176 Foxf1-201ENSMUST00000181504 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Susd3Q9D176 Zfpm1-201ENSMUST00000054052 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Susd3Q9D176 Fgf22-202ENSMUST00000219228 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Susd3Q9D176 Marveld3-201ENSMUST00000001722 1330 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Susd3Q9D176 Nt5dc2-201ENSMUST00000090212 1407 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Susd3Q9D176 Sept10-203ENSMUST00000220156 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Susd3Q9D176 Gls-202ENSMUST00000114510 5596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Susd3Q9D176 Rnps1-203ENSMUST00000163717 1920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Susd3Q9D176 Cmip-202ENSMUST00000166750 2408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Susd3Q9D176 Ggt6-203ENSMUST00000108499 874 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Susd3Q9D176 Crem-221ENSMUST00000142690 1256 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Susd3Q9D176 Unkl-205ENSMUST00000161679 1053 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Susd3Q9D176 Gm5819-201ENSMUST00000171469 465 ntAPPRIS P1 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Susd3Q9D176 Sap25-206ENSMUST00000177466 1005 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Susd3Q9D176 Zfp524-202ENSMUST00000207901 1263 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Susd3Q9D176 3830406C13Rik-207ENSMUST00000223927 1010 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Susd3Q9D176 S100a13-201ENSMUST00000048138 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Susd3Q9D176 Tmco1-204ENSMUST00000195015 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Susd3Q9D176 Ctnnbip1-201ENSMUST00000030839 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Susd3Q9D176 Gpat3-203ENSMUST00000112887 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Susd3Q9D176 Nadk2-201ENSMUST00000067760 3731 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Susd3Q9D176 Adam22-205ENSMUST00000115385 2318 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Susd3Q9D176 Ruvbl2-201ENSMUST00000107771 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Susd3Q9D176 Gbgt1-203ENSMUST00000163121 1335 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Susd3Q9D176 Foxs1-201ENSMUST00000099200 1311 ntAPPRIS P1 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Susd3Q9D176 Ncam2-202ENSMUST00000067602 3563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Susd3Q9D176 Dcaf8-206ENSMUST00000192704 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Susd3Q9D176 Gm45844-202ENSMUST00000209325 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Susd3Q9D176 Ocel1-202ENSMUST00000110051 2179 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Susd3Q9D176 Acbd4-201ENSMUST00000024492 2075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Susd3Q9D176 Mprip-203ENSMUST00000108751 4021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Susd3Q9D176 Pth1r-204ENSMUST00000198865 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Susd3Q9D176 Lcn6-202ENSMUST00000114197 635 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Susd3Q9D176 1700060J05Rik-201ENSMUST00000138377 1060 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Susd3Q9D176 Spata3-209ENSMUST00000152501 743 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Susd3Q9D176 Rprl2-201ENSMUST00000157150 290 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Susd3Q9D176 Erdr1-202ENSMUST00000177671 708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Susd3Q9D176 Gm28277-201ENSMUST00000187450 885 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Susd3Q9D176 Cldn25-ps-201ENSMUST00000197641 693 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Susd3Q9D176 Gm8239-201ENSMUST00000204094 444 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Susd3Q9D176 D030044L04Rik-201ENSMUST00000204220 1291 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Susd3Q9D176 Tm2d3-207ENSMUST00000206517 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Susd3Q9D176 0610005C13Rik-201ENSMUST00000209416 856 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Susd3Q9D176 Gm5628-201ENSMUST00000222318 1049 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Susd3Q9D176 Rhox6-201ENSMUST00000006362 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Susd3Q9D176 Wfdc6b-201ENSMUST00000094346 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Susd3Q9D176 Vav3-201ENSMUST00000046864 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Susd3Q9D176 Gm15743-202ENSMUST00000182690 1901 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Susd3Q9D176 Trim68-201ENSMUST00000082175 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Susd3Q9D176 Slc16a3-201ENSMUST00000070653 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Susd3Q9D176 Ube2q2-201ENSMUST00000059555 3456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Susd3Q9D176 Vps53-202ENSMUST00000094015 2645 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.1 ms