Protein–RNA interactions for Protein: Q9D0B6

Pbdc1, Protein PBDC1, mousemouse

Predictions only

Length 198 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pbdc1Q9D0B6 Crb2-201ENSMUST00000050372 6372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Pbdc1Q9D0B6 Spon1-202ENSMUST00000084696 5201 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Pbdc1Q9D0B6 Slc23a3-201ENSMUST00000027405 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Pbdc1Q9D0B6 2310001K24Rik-202ENSMUST00000186760 740 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Pbdc1Q9D0B6 Uchl1-201ENSMUST00000031131 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Pbdc1Q9D0B6 Tdg-ps-201ENSMUST00000051363 2968 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Pbdc1Q9D0B6 Hand1-203ENSMUST00000160392 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Pbdc1Q9D0B6 Nmt2-203ENSMUST00000102989 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Pbdc1Q9D0B6 Lncpint-201ENSMUST00000115107 1676 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Pbdc1Q9D0B6 Arhgef12-202ENSMUST00000165665 10752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Pbdc1Q9D0B6 Pip4k2a-201ENSMUST00000006912 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Pbdc1Q9D0B6 Nlk-201ENSMUST00000142739 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Pbdc1Q9D0B6 Ube2d3-208ENSMUST00000197134 2493 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Pbdc1Q9D0B6 Macrod2-201ENSMUST00000043836 3552 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Pbdc1Q9D0B6 Ifitm10-201ENSMUST00000059223 3412 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Pbdc1Q9D0B6 Slbp-203ENSMUST00000101354 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Pbdc1Q9D0B6 Gm26568-201ENSMUST00000180496 1594 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Pbdc1Q9D0B6 Gm6588-201ENSMUST00000100882 2313 ntAPPRIS P1 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Pbdc1Q9D0B6 Pnkp-203ENSMUST00000107876 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Pbdc1Q9D0B6 Olah-203ENSMUST00000194918 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Pbdc1Q9D0B6 Pagr1a-202ENSMUST00000200948 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Pbdc1Q9D0B6 Gm42742-205ENSMUST00000202798 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Pbdc1Q9D0B6 Tprn-201ENSMUST00000114336 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Pbdc1Q9D0B6 Taf6l-206ENSMUST00000176610 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Pbdc1Q9D0B6 Fgf11-202ENSMUST00000102585 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Pbdc1Q9D0B6 Nrg2-203ENSMUST00000115713 3001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Pbdc1Q9D0B6 Tbc1d10b-201ENSMUST00000120705 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Pbdc1Q9D0B6 Fbxo7-203ENSMUST00000120344 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Pbdc1Q9D0B6 Grina-201ENSMUST00000023225 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Pbdc1Q9D0B6 Ntrk2-205ENSMUST00000224402 2284 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Pbdc1Q9D0B6 Cstf2-201ENSMUST00000033609 4502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Pbdc1Q9D0B6 Impdh1-205ENSMUST00000160878 2314 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Pbdc1Q9D0B6 Ruvbl2-205ENSMUST00000211214 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Pbdc1Q9D0B6 Pcsk6-201ENSMUST00000055576 4405 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Pbdc1Q9D0B6 Zfp879-203ENSMUST00000109134 2414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Pbdc1Q9D0B6 Zfp879-201ENSMUST00000049625 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Pbdc1Q9D0B6 Aifm1-202ENSMUST00000114945 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Pbdc1Q9D0B6 Cfap206-201ENSMUST00000029971 2246 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Pbdc1Q9D0B6 Ctage5-213ENSMUST00000176464 4434 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Pbdc1Q9D0B6 Ube2e1-201ENSMUST00000022296 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Pbdc1Q9D0B6 Gm45212-201ENSMUST00000205831 3403 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Pbdc1Q9D0B6 Gm14634-201ENSMUST00000139163 1662 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Pbdc1Q9D0B6 Gk5-201ENSMUST00000085217 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Pbdc1Q9D0B6 Gm45470-202ENSMUST00000210817 2192 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Pbdc1Q9D0B6 Kcnn1-201ENSMUST00000110078 4047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Pbdc1Q9D0B6 Kcnn1-202ENSMUST00000110081 4045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Pbdc1Q9D0B6 Ppm1j-201ENSMUST00000002298 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Pbdc1Q9D0B6 Anks6-201ENSMUST00000084616 3552 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Pbdc1Q9D0B6 Gm20544-201ENSMUST00000174338 690 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Pbdc1Q9D0B6 Gm21863-201ENSMUST00000179133 336 ntAPPRIS P1 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Pbdc1Q9D0B6 AC154649.1-201ENSMUST00000227392 384 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Pbdc1Q9D0B6 Sap30-201ENSMUST00000034022 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Pbdc1Q9D0B6 Tmem205-201ENSMUST00000046831 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Pbdc1Q9D0B6 Rps23-201ENSMUST00000051955 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Pbdc1Q9D0B6 Grhl2-203ENSMUST00000161405 1996 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Pbdc1Q9D0B6 Hip1r-201ENSMUST00000000939 6735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Pbdc1Q9D0B6 Il11ra1-204ENSMUST00000108042 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Pbdc1Q9D0B6 Casp8ap2-201ENSMUST00000029950 6799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Pbdc1Q9D0B6 Mtx2-201ENSMUST00000028511 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Pbdc1Q9D0B6 Tex19.2-201ENSMUST00000039146 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Pbdc1Q9D0B6 A130010J15Rik-201ENSMUST00000110831 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Pbdc1Q9D0B6 Lpin2-213ENSMUST00000156570 1586 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Pbdc1Q9D0B6 Nsmaf-201ENSMUST00000029910 3507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Pbdc1Q9D0B6 Tchh-201ENSMUST00000064257 5823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Pbdc1Q9D0B6 Gm8909-201ENSMUST00000040467 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Pbdc1Q9D0B6 Mbd6-201ENSMUST00000026476 4165 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Pbdc1Q9D0B6 Tcf3-206ENSMUST00000105342 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Pbdc1Q9D0B6 Crem-228ENSMUST00000150235 2662 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Pbdc1Q9D0B6 Cfap20-208ENSMUST00000213086 2544 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Pbdc1Q9D0B6 Mri1-203ENSMUST00000126435 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Pbdc1Q9D0B6 Pmpca-201ENSMUST00000076431 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Pbdc1Q9D0B6 Tfap2d-201ENSMUST00000037294 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Pbdc1Q9D0B6 Bnip2-202ENSMUST00000085393 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Pbdc1Q9D0B6 Cog6-204ENSMUST00000193432 2078 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Pbdc1Q9D0B6 Ephb1-203ENSMUST00000149800 3471 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Pbdc1Q9D0B6 Gm45203-201ENSMUST00000206384 1831 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Pbdc1Q9D0B6 Casp2-201ENSMUST00000031895 3529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Pbdc1Q9D0B6 Rab7-206ENSMUST00000203674 424 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Pbdc1Q9D0B6 4930412O13Rik-201ENSMUST00000026889 1187 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Pbdc1Q9D0B6 Cldn24-201ENSMUST00000079639 663 ntAPPRIS P1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Pbdc1Q9D0B6 Tmem8b-203ENSMUST00000107866 4998 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Pbdc1Q9D0B6 Nkx1-2-201ENSMUST00000054562 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Pbdc1Q9D0B6 Ccdc154-201ENSMUST00000073277 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Pbdc1Q9D0B6 Fyn-201ENSMUST00000063091 3562 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Pbdc1Q9D0B6 Hist1h1c-201ENSMUST00000040914 1560 ntAPPRIS P1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Pbdc1Q9D0B6 Dmc1-201ENSMUST00000023065 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Pbdc1Q9D0B6 Nipal3-201ENSMUST00000102549 5153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Pbdc1Q9D0B6 Cdkn1a-201ENSMUST00000023829 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Pbdc1Q9D0B6 Nrros-201ENSMUST00000099991 2548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Pbdc1Q9D0B6 Nfat5-211ENSMUST00000151114 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Pbdc1Q9D0B6 Washc1-202ENSMUST00000116556 2887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Pbdc1Q9D0B6 Pax8-201ENSMUST00000028355 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Pbdc1Q9D0B6 Slc38a10-203ENSMUST00000076697 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Pbdc1Q9D0B6 Bptf-201ENSMUST00000057892 11488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Pbdc1Q9D0B6 Mib1-201ENSMUST00000052838 10231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Pbdc1Q9D0B6 Fam221a-201ENSMUST00000060561 2730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Pbdc1Q9D0B6 Tmem65-201ENSMUST00000072113 3747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Pbdc1Q9D0B6 Platr31-201ENSMUST00000180653 1466 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Pbdc1Q9D0B6 Lhfpl3-202ENSMUST00000197992 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Pbdc1Q9D0B6 Rnf207-201ENSMUST00000076183 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.5 ms