Protein–RNA interactions for Protein: Q9D067

Mdm1, Nuclear protein MDM1, mousemouse

Predictions only

Length 708 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mdm1Q9D067 Gtpbp3-208ENSMUST00000168847 2803 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Mdm1Q9D067 Cep83-201ENSMUST00000020212 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Mdm1Q9D067 Mtmr3-202ENSMUST00000109943 5674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Mdm1Q9D067 Ispd-207ENSMUST00000223205 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Mdm1Q9D067 G3bp2-202ENSMUST00000164378 3026 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Mdm1Q9D067 Dio1-202ENSMUST00000106748 396 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Mdm1Q9D067 Il11ra2-201ENSMUST00000108006 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Mdm1Q9D067 Rnf7-202ENSMUST00000071301 334 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Mdm1Q9D067 Farsa-202ENSMUST00000109754 1795 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Mdm1Q9D067 Gm43213-201ENSMUST00000151866 1790 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Mdm1Q9D067 Uso1-204ENSMUST00000202155 3707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Mdm1Q9D067 Fam222a-201ENSMUST00000043650 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Mdm1Q9D067 Fbxo30-201ENSMUST00000070300 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Mdm1Q9D067 Gm2694-204ENSMUST00000181898 1303 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Mdm1Q9D067 Zdhhc6-207ENSMUST00000224897 2168 ntAPPRIS P1 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Mdm1Q9D067 Xpr1-202ENSMUST00000111774 2753 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Mdm1Q9D067 Nkpd1-201ENSMUST00000078908 2753 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Mdm1Q9D067 Chmp6-201ENSMUST00000026434 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Mdm1Q9D067 Prlhr-201ENSMUST00000051277 1572 ntAPPRIS P1 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Mdm1Q9D067 Bpifb4-203ENSMUST00000109759 2115 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Mdm1Q9D067 Mef2d-202ENSMUST00000107558 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Mdm1Q9D067 Psmc4-201ENSMUST00000032824 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Mdm1Q9D067 Dock3-201ENSMUST00000044532 9063 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Mdm1Q9D067 Siva1-202ENSMUST00000109755 333 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Mdm1Q9D067 Gm4459-201ENSMUST00000118750 468 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Mdm1Q9D067 Uba52-203ENSMUST00000125184 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Mdm1Q9D067 Ntpcr-205ENSMUST00000143504 520 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Mdm1Q9D067 AA465934-202ENSMUST00000176545 356 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Mdm1Q9D067 Smdt1-201ENSMUST00000023086 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Mdm1Q9D067 Slc39a1-201ENSMUST00000015467 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Mdm1Q9D067 Slc1a6-201ENSMUST00000005490 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Mdm1Q9D067 Paip2-201ENSMUST00000041314 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Mdm1Q9D067 Nap1l1-201ENSMUST00000065917 1486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Mdm1Q9D067 9330111N05Rik-202ENSMUST00000181043 2449 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Mdm1Q9D067 3110043O21Rik-203ENSMUST00000108127 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Mdm1Q9D067 Prcc-201ENSMUST00000005015 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Mdm1Q9D067 Rasip1-201ENSMUST00000057927 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Mdm1Q9D067 Rftn1-201ENSMUST00000044503 4029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Mdm1Q9D067 Atoh1-201ENSMUST00000101351 2121 ntAPPRIS P1 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Mdm1Q9D067 Mtif3-201ENSMUST00000016654 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Mdm1Q9D067 Fxyd6-203ENSMUST00000217381 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Mdm1Q9D067 Cep68-204ENSMUST00000162811 2788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Mdm1Q9D067 Mapk8ip3-221ENSMUST00000178969 5579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Mdm1Q9D067 Hjurp-202ENSMUST00000065420 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Mdm1Q9D067 Racgap1-213ENSMUST00000171702 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Mdm1Q9D067 Wnt6-201ENSMUST00000006716 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Mdm1Q9D067 Asphd1-202ENSMUST00000106339 518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Mdm1Q9D067 Rpl36-ps8-201ENSMUST00000121187 315 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Mdm1Q9D067 Gm12497-201ENSMUST00000138778 237 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Mdm1Q9D067 1700030N18Rik-201ENSMUST00000202497 966 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Mdm1Q9D067 Gm34397-203ENSMUST00000214991 630 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Mdm1Q9D067 Rab11fip3-202ENSMUST00000120691 5103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Mdm1Q9D067 Pex6-201ENSMUST00000002840 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Mdm1Q9D067 A930012L18Rik-201ENSMUST00000181094 2364 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Mdm1Q9D067 Trim7-201ENSMUST00000046903 2161 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Mdm1Q9D067 Ache-202ENSMUST00000085934 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Mdm1Q9D067 Eif5-201ENSMUST00000050993 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Mdm1Q9D067 Scube2-202ENSMUST00000106728 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Mdm1Q9D067 Coq6-202ENSMUST00000110276 1776 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Mdm1Q9D067 Pacsin1-202ENSMUST00000097360 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Mdm1Q9D067 Dhh-201ENSMUST00000023737 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Mdm1Q9D067 Neurl1a-202ENSMUST00000111808 4157 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Mdm1Q9D067 Map7-201ENSMUST00000020173 4252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Mdm1Q9D067 Lrriq4-203ENSMUST00000172350 1797 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Mdm1Q9D067 Prmt7-203ENSMUST00000109297 1094 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Mdm1Q9D067 1700003M07Rik-202ENSMUST00000147634 564 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Mdm1Q9D067 Caly-202ENSMUST00000166758 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Mdm1Q9D067 Gm44264-201ENSMUST00000203049 742 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Mdm1Q9D067 AC110091.2-202ENSMUST00000216718 1148 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Mdm1Q9D067 Cox7a2l-201ENSMUST00000025095 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Mdm1Q9D067 Lce1b-201ENSMUST00000029531 647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Mdm1Q9D067 Olfr30-201ENSMUST00000055204 1066 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Mdm1Q9D067 Klk14-201ENSMUST00000056329 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Mdm1Q9D067 Glcci1-201ENSMUST00000064285 6200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Mdm1Q9D067 Ing4-201ENSMUST00000032480 1629 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Mdm1Q9D067 Ola1-201ENSMUST00000028517 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Mdm1Q9D067 Syne4-201ENSMUST00000054594 1355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Mdm1Q9D067 Jam2-201ENSMUST00000098407 1998 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Mdm1Q9D067 Atp9a-203ENSMUST00000109176 3691 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Mdm1Q9D067 Elac2-203ENSMUST00000108697 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Mdm1Q9D067 Gm3248-201ENSMUST00000163885 2055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Mdm1Q9D067 Ociad2-202ENSMUST00000200776 2359 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Mdm1Q9D067 Ppp1r3g-203ENSMUST00000225537 2389 ntAPPRIS P1 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Mdm1Q9D067 Eps8-201ENSMUST00000058210 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Mdm1Q9D067 Klhl36-201ENSMUST00000034287 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Mdm1Q9D067 Trim63-202ENSMUST00000105875 1886 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Mdm1Q9D067 Acyp1-203ENSMUST00000117138 735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Mdm1Q9D067 Tsc22d1-208ENSMUST00000142683 797 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Mdm1Q9D067 AA543401-201ENSMUST00000164248 1269 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Mdm1Q9D067 Gm34933-201ENSMUST00000203245 1067 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Mdm1Q9D067 Gm8655-201ENSMUST00000221159 852 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Mdm1Q9D067 AC114585.2-202ENSMUST00000228094 426 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Mdm1Q9D067 Mboat7-201ENSMUST00000038608 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Mdm1Q9D067 Nsg1-201ENSMUST00000031009 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Mdm1Q9D067 Ppm1b-202ENSMUST00000112304 3262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Mdm1Q9D067 Fiz1-208ENSMUST00000208944 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Mdm1Q9D067 Kank3-202ENSMUST00000172649 2652 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Mdm1Q9D067 Gnb1-202ENSMUST00000105616 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Mdm1Q9D067 Col15a1-202ENSMUST00000102917 5172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Mdm1Q9D067 Gm28756-202ENSMUST00000209405 2461 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.6 ms