Protein–RNA interactions for Protein: Q9CZW4

Acsl3, Long-chain-fatty-acid--CoA ligase 3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 720 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Acsl3Q9CZW4 Crhbp-201ENSMUST00000045583 1701 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Acsl3Q9CZW4 Irf5-205ENSMUST00000167252 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Acsl3Q9CZW4 Ccdc30-201ENSMUST00000044781 1464 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Acsl3Q9CZW4 C1qtnf5-202ENSMUST00000114816 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Acsl3Q9CZW4 Pabpc1l2b-ps-201ENSMUST00000124538 690 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
Acsl3Q9CZW4 Gm14453-201ENSMUST00000139677 553 ntTSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Acsl3Q9CZW4 Gm21057-201ENSMUST00000206022 670 ntTSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Acsl3Q9CZW4 Myl6-206ENSMUST00000218127 691 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Acsl3Q9CZW4 Gm30025-201ENSMUST00000218555 728 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
Acsl3Q9CZW4 Angptl8-201ENSMUST00000058777 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Acsl3Q9CZW4 Mccc1-201ENSMUST00000029259 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Acsl3Q9CZW4 Gpc5-202ENSMUST00000175665 2187 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Acsl3Q9CZW4 Mbd6-201ENSMUST00000026476 4165 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Acsl3Q9CZW4 Slc29a1-222ENSMUST00000171847 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Acsl3Q9CZW4 Lcmt2-201ENSMUST00000099486 2047 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Acsl3Q9CZW4 Fgf11-202ENSMUST00000102585 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Acsl3Q9CZW4 Zdhhc18-201ENSMUST00000084238 4580 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Acsl3Q9CZW4 Jph4-201ENSMUST00000022819 4489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Acsl3Q9CZW4 Olah-203ENSMUST00000194918 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Acsl3Q9CZW4 Gja4-201ENSMUST00000053753 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Acsl3Q9CZW4 Nptn-212ENSMUST00000177292 1390 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Acsl3Q9CZW4 Rrp15-201ENSMUST00000001339 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Acsl3Q9CZW4 Tmed3-201ENSMUST00000058488 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Acsl3Q9CZW4 Ppp2r2a-204ENSMUST00000225380 1988 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
Acsl3Q9CZW4 Isyna1-204ENSMUST00000210005 1914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Acsl3Q9CZW4 Syt8-202ENSMUST00000105976 1289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Acsl3Q9CZW4 Bad-202ENSMUST00000113423 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Acsl3Q9CZW4 Dnajb3-201ENSMUST00000119972 1051 ntAPPRIS P1 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Acsl3Q9CZW4 Syt8-205ENSMUST00000122393 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Acsl3Q9CZW4 Pgpep1-208ENSMUST00000211715 676 ntTSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Acsl3Q9CZW4 Lce1m-201ENSMUST00000029520 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Acsl3Q9CZW4 Cmtm7-201ENSMUST00000035009 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Acsl3Q9CZW4 Prok1-201ENSMUST00000049852 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Acsl3Q9CZW4 Wdr33-202ENSMUST00000082319 1152 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Acsl3Q9CZW4 Bpifb3-201ENSMUST00000088950 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Acsl3Q9CZW4 Fubp1-205ENSMUST00000196695 2374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Acsl3Q9CZW4 Slc35b2-202ENSMUST00000223987 1766 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
Acsl3Q9CZW4 Galnt13-202ENSMUST00000112634 7639 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Acsl3Q9CZW4 Rbmxl1-201ENSMUST00000049245 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Acsl3Q9CZW4 Cap1-203ENSMUST00000106257 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Acsl3Q9CZW4 Vegfa-201ENSMUST00000024747 2765 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Acsl3Q9CZW4 Zbtb11-201ENSMUST00000050248 4920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Acsl3Q9CZW4 Ankrd44-201ENSMUST00000044359 6192 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Acsl3Q9CZW4 Cenpw-201ENSMUST00000099985 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Acsl3Q9CZW4 Dnajb11-204ENSMUST00000166487 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Acsl3Q9CZW4 Secisbp2-202ENSMUST00000110044 1915 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Acsl3Q9CZW4 Gm7854-202ENSMUST00000187409 1433 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Acsl3Q9CZW4 Madcam1-201ENSMUST00000020554 1436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Acsl3Q9CZW4 Git2-204ENSMUST00000112185 5032 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Acsl3Q9CZW4 AC093043.3-201ENSMUST00000226531 2273 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
Acsl3Q9CZW4 Casp8ap2-201ENSMUST00000029950 6799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Acsl3Q9CZW4 Otp-201ENSMUST00000022195 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Acsl3Q9CZW4 Jade1-203ENSMUST00000168086 4790 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Acsl3Q9CZW4 4930526A20Rik-201ENSMUST00000134228 941 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
Acsl3Q9CZW4 2210408F21Rik-211ENSMUST00000151800 750 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Acsl3Q9CZW4 Gm15889-201ENSMUST00000159142 1083 ntTSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Acsl3Q9CZW4 Creb1-203ENSMUST00000171164 1287 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Acsl3Q9CZW4 Gm2479-201ENSMUST00000173312 1053 ntTSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Acsl3Q9CZW4 Gm20403-201ENSMUST00000173803 372 ntAPPRIS P1 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Acsl3Q9CZW4 C430014B12Rik-202ENSMUST00000186858 657 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Acsl3Q9CZW4 Lncpint-201ENSMUST00000115107 1676 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Acsl3Q9CZW4 Ush1c-208ENSMUST00000177212 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Acsl3Q9CZW4 Eda-205ENSMUST00000113778 4942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Acsl3Q9CZW4 Eda-207ENSMUST00000113780 4915 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Acsl3Q9CZW4 Eda-208ENSMUST00000113781 4915 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Acsl3Q9CZW4 Zfp264-201ENSMUST00000208656 1563 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
Acsl3Q9CZW4 Helt-201ENSMUST00000058636 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Acsl3Q9CZW4 2810474O19Rik-209ENSMUST00000189932 5269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Acsl3Q9CZW4 Pxn-201ENSMUST00000067268 3706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Acsl3Q9CZW4 Wscd1-202ENSMUST00000108510 2956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Acsl3Q9CZW4 C77080-201ENSMUST00000052602 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Acsl3Q9CZW4 Washc1-202ENSMUST00000116556 2887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Acsl3Q9CZW4 Rassf1-204ENSMUST00000122225 1783 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Acsl3Q9CZW4 Bend6-204ENSMUST00000129464 1750 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Acsl3Q9CZW4 Cyp46a1-201ENSMUST00000021684 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Acsl3Q9CZW4 Kctd15-203ENSMUST00000108070 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Acsl3Q9CZW4 Rasgef1b-205ENSMUST00000161148 2430 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Acsl3Q9CZW4 Gclc-201ENSMUST00000034905 3423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Acsl3Q9CZW4 Dpm1-209ENSMUST00000154111 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Acsl3Q9CZW4 Gpha2-202ENSMUST00000113526 762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Acsl3Q9CZW4 Ndufb2-202ENSMUST00000119379 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Acsl3Q9CZW4 Dohh-202ENSMUST00000121047 946 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Acsl3Q9CZW4 Ramp1-203ENSMUST00000188475 711 ntTSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Acsl3Q9CZW4 Gm9484-201ENSMUST00000195892 1159 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
Acsl3Q9CZW4 AL672049.1-201ENSMUST00000197943 91 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
Acsl3Q9CZW4 Gm18115-201ENSMUST00000221209 621 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
Acsl3Q9CZW4 Gpha2-201ENSMUST00000025698 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Acsl3Q9CZW4 Irak1bp1-201ENSMUST00000034783 1159 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Acsl3Q9CZW4 4930448E22Rik-201ENSMUST00000181712 1581 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Acsl3Q9CZW4 Evpl-201ENSMUST00000037007 6384 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Acsl3Q9CZW4 B4galt7-201ENSMUST00000064701 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Acsl3Q9CZW4 Mapk8ip2-201ENSMUST00000023291 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Acsl3Q9CZW4 Nes-203ENSMUST00000160694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Acsl3Q9CZW4 Lefty2-201ENSMUST00000085797 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Acsl3Q9CZW4 Fam72a-201ENSMUST00000068613 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Acsl3Q9CZW4 Tox2-201ENSMUST00000099110 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Acsl3Q9CZW4 Agap1-204ENSMUST00000190096 4078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Acsl3Q9CZW4 Ppp3cb-206ENSMUST00000161989 2322 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Acsl3Q9CZW4 Zswim4-201ENSMUST00000039480 4625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Acsl3Q9CZW4 Miga1-205ENSMUST00000199397 2842 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30 ms