Protein–RNA interactions for Protein: Q9CZ28

Snf8, Vacuolar-sorting protein SNF8, mousemouse

Predictions only

Length 258 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snf8Q9CZ28 Mfap2-201ENSMUST00000071977 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Snf8Q9CZ28 Mtg2-202ENSMUST00000108901 1444 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Snf8Q9CZ28 Capn15-205ENSMUST00000212520 5216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Snf8Q9CZ28 Stx7-201ENSMUST00000020174 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Snf8Q9CZ28 Tnfrsf1a-201ENSMUST00000032491 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Snf8Q9CZ28 Vps51-201ENSMUST00000025711 2489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Snf8Q9CZ28 Nlk-201ENSMUST00000142739 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Snf8Q9CZ28 Sirt6-202ENSMUST00000119324 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Snf8Q9CZ28 Anks1b-219ENSMUST00000182600 1697 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Snf8Q9CZ28 Kctd8-201ENSMUST00000054095 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Snf8Q9CZ28 Cstf2-201ENSMUST00000033609 4502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Snf8Q9CZ28 Wdr26-207ENSMUST00000162819 6619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Snf8Q9CZ28 Plcl1-201ENSMUST00000042986 6580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Snf8Q9CZ28 Fgf2-208ENSMUST00000200585 5973 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Snf8Q9CZ28 Cd164-201ENSMUST00000019962 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Snf8Q9CZ28 Foxc2-201ENSMUST00000054691 2725 ntAPPRIS P1 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Snf8Q9CZ28 Hist1h1c-201ENSMUST00000040914 1560 ntAPPRIS P1 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Snf8Q9CZ28 4931440P22Rik-202ENSMUST00000147424 2430 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Snf8Q9CZ28 Gm14464-201ENSMUST00000119658 1254 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Snf8Q9CZ28 Gm20695-202ENSMUST00000176233 1012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Snf8Q9CZ28 Ccnd2-204ENSMUST00000201637 1006 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Snf8Q9CZ28 Gm18115-201ENSMUST00000221209 621 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Snf8Q9CZ28 Rgcc-201ENSMUST00000022595 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Snf8Q9CZ28 Polr2f-201ENSMUST00000040077 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Snf8Q9CZ28 Rundc3b-201ENSMUST00000047485 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Snf8Q9CZ28 Slc38a10-203ENSMUST00000076697 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Snf8Q9CZ28 Trmt2a-202ENSMUST00000100099 2235 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Snf8Q9CZ28 Camk2d-221ENSMUST00000171289 2217 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Snf8Q9CZ28 Mindy4-203ENSMUST00000204842 2211 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Snf8Q9CZ28 Mapk8ip3-201ENSMUST00000088345 5543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Snf8Q9CZ28 Pde4b-208ENSMUST00000106911 3020 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Snf8Q9CZ28 Slc9a3r1-201ENSMUST00000021077 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Snf8Q9CZ28 Chaf1b-201ENSMUST00000023666 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Snf8Q9CZ28 Gatc-201ENSMUST00000139167 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Snf8Q9CZ28 App-203ENSMUST00000226801 3299 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Snf8Q9CZ28 F2rl1-201ENSMUST00000022185 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Snf8Q9CZ28 Papd4-205ENSMUST00000225868 3081 ntAPPRIS ALT1 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Snf8Q9CZ28 Rabggta-203ENSMUST00000169237 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Snf8Q9CZ28 Nagpa-201ENSMUST00000023911 2143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Snf8Q9CZ28 Papola-202ENSMUST00000109901 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Snf8Q9CZ28 Sec31a-201ENSMUST00000094578 4228 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Snf8Q9CZ28 Rassf7-208ENSMUST00000209500 1560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Snf8Q9CZ28 Zfp385b-202ENSMUST00000111829 2073 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Snf8Q9CZ28 Kcnj6-202ENSMUST00000099508 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Snf8Q9CZ28 Ankrd44-210ENSMUST00000179030 6140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Snf8Q9CZ28 Dohh-206ENSMUST00000131968 672 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Snf8Q9CZ28 Zfp629-207ENSMUST00000134446 670 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Snf8Q9CZ28 Slc25a41-202ENSMUST00000169012 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Snf8Q9CZ28 2510002D24Rik-204ENSMUST00000191388 995 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Snf8Q9CZ28 Cfap20-201ENSMUST00000034249 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Snf8Q9CZ28 Gdf15-201ENSMUST00000003808 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Snf8Q9CZ28 Tfap2d-201ENSMUST00000037294 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Snf8Q9CZ28 Mfsd4b3-201ENSMUST00000095749 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Snf8Q9CZ28 Fam214b-204ENSMUST00000107958 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Snf8Q9CZ28 Tmem5-205ENSMUST00000140299 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Snf8Q9CZ28 Naxd-201ENSMUST00000033901 1359 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Snf8Q9CZ28 Elp6-201ENSMUST00000068071 2219 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Snf8Q9CZ28 Mapk8ip3-205ENSMUST00000119115 4173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Snf8Q9CZ28 Gm6588-201ENSMUST00000100882 2313 ntAPPRIS P1 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Snf8Q9CZ28 Ruvbl2-205ENSMUST00000211214 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Snf8Q9CZ28 Cuedc1-201ENSMUST00000018522 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Snf8Q9CZ28 Zfp264-201ENSMUST00000208656 1563 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Snf8Q9CZ28 Fgf11-202ENSMUST00000102585 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Snf8Q9CZ28 Nes-201ENSMUST00000090973 6126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Snf8Q9CZ28 Mapk9-205ENSMUST00000109179 4682 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Snf8Q9CZ28 Mapk9-209ENSMUST00000164643 4682 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Snf8Q9CZ28 Tenm3-204ENSMUST00000110346 2267 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Snf8Q9CZ28 Irf5-205ENSMUST00000167252 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Snf8Q9CZ28 1700001O22Rik-201ENSMUST00000050003 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Snf8Q9CZ28 Klhl33-202ENSMUST00000170855 1422 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Snf8Q9CZ28 Men1-204ENSMUST00000113500 2742 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Snf8Q9CZ28 Slc35b2-202ENSMUST00000223987 1766 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Snf8Q9CZ28 Fam110a-201ENSMUST00000062047 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Snf8Q9CZ28 Skap1-203ENSMUST00000100521 1539 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Snf8Q9CZ28 Skap1-204ENSMUST00000103154 1507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Snf8Q9CZ28 Ern1-203ENSMUST00000106800 654 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Snf8Q9CZ28 Rgs19-207ENSMUST00000108779 642 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Snf8Q9CZ28 Cutc-202ENSMUST00000112047 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Snf8Q9CZ28 Lamtor5-201ENSMUST00000145735 881 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Snf8Q9CZ28 Gm3375-201ENSMUST00000203929 796 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Snf8Q9CZ28 AC153881.1-201ENSMUST00000214448 284 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Snf8Q9CZ28 Bmyc-201ENSMUST00000061483 983 ntAPPRIS P1 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Snf8Q9CZ28 Rex1bd-201ENSMUST00000075175 671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Snf8Q9CZ28 Ltbp1-201ENSMUST00000001927 6671 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Snf8Q9CZ28 Rmdn1-201ENSMUST00000029888 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Snf8Q9CZ28 4933428P19Rik-201ENSMUST00000199616 1376 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Snf8Q9CZ28 Map3k6-201ENSMUST00000030677 4334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Snf8Q9CZ28 Sh2d4a-201ENSMUST00000066594 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Snf8Q9CZ28 Ccdc166-201ENSMUST00000182172 2584 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Snf8Q9CZ28 2810013P06Rik-201ENSMUST00000186531 2137 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Snf8Q9CZ28 Vangl2-202ENSMUST00000111263 6528 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Snf8Q9CZ28 Nrg1-218ENSMUST00000209107 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Snf8Q9CZ28 Agbl4-205ENSMUST00000106591 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Snf8Q9CZ28 Brap-201ENSMUST00000031414 3744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Snf8Q9CZ28 Rhcg-201ENSMUST00000032766 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Snf8Q9CZ28 Gk5-201ENSMUST00000085217 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Snf8Q9CZ28 Homer2-206ENSMUST00000207983 1634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Snf8Q9CZ28 Mbd6-201ENSMUST00000026476 4165 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Snf8Q9CZ28 Slc29a1-222ENSMUST00000171847 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Snf8Q9CZ28 Fam81a-201ENSMUST00000034749 3703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.9 ms