Protein–RNA interactions for Protein: Q9CY28

Gtpbp8, GTP-binding protein 8, mousemouse

Predictions only

Length 285 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gtpbp8Q9CY28 Zkscan3-204ENSMUST00000117721 5788 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gtpbp8Q9CY28 Jam2-201ENSMUST00000098407 1998 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gtpbp8Q9CY28 Sash1-201ENSMUST00000015449 7183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gtpbp8Q9CY28 Pbx4-201ENSMUST00000081503 1560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gtpbp8Q9CY28 Stxbp6-201ENSMUST00000053768 4553 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gtpbp8Q9CY28 Dancr-204ENSMUST00000132389 2347 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Gtpbp8Q9CY28 Gm37166-201ENSMUST00000195473 2474 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Gtpbp8Q9CY28 Tbc1d9-201ENSMUST00000034145 4631 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gtpbp8Q9CY28 Dennd4b-202ENSMUST00000129564 5647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
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Gtpbp8Q9CY28 Gm20628-201ENSMUST00000177363 3215 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Gtpbp8Q9CY28 Nsmf-203ENSMUST00000100334 2957 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gtpbp8Q9CY28 Tekt1-202ENSMUST00000108502 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gtpbp8Q9CY28 Znhit1-203ENSMUST00000111090 698 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gtpbp8Q9CY28 Tekt5-202ENSMUST00000115831 1277 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gtpbp8Q9CY28 Ramp2-204ENSMUST00000129680 1178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gtpbp8Q9CY28 Gm15295-201ENSMUST00000139874 488 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
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Gtpbp8Q9CY28 Mrps12-204ENSMUST00000171183 883 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gtpbp8Q9CY28 Casc3-201ENSMUST00000017384 3963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gtpbp8Q9CY28 Ak6-201ENSMUST00000022135 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gtpbp8Q9CY28 3110040N11Rik-201ENSMUST00000026092 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gtpbp8Q9CY28 Mid1ip1-201ENSMUST00000008179 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gtpbp8Q9CY28 Rtn3-201ENSMUST00000025667 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gtpbp8Q9CY28 Dnaaf3-201ENSMUST00000094897 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gtpbp8Q9CY28 Tbp-202ENSMUST00000117593 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gtpbp8Q9CY28 Stxbp3-205ENSMUST00000138552 1789 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gtpbp8Q9CY28 Slc35b2-202ENSMUST00000223987 1766 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Gtpbp8Q9CY28 Krt83-201ENSMUST00000023718 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gtpbp8Q9CY28 Slc25a20-201ENSMUST00000035222 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gtpbp8Q9CY28 Coq6-201ENSMUST00000021661 1602 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gtpbp8Q9CY28 Mapk7-201ENSMUST00000079080 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gtpbp8Q9CY28 Pqlc1-202ENSMUST00000091798 1989 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gtpbp8Q9CY28 Dhfr-201ENSMUST00000022218 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gtpbp8Q9CY28 Sf1-202ENSMUST00000113487 2649 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gtpbp8Q9CY28 Zpbp-201ENSMUST00000020413 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gtpbp8Q9CY28 D16Ertd472e-203ENSMUST00000114220 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gtpbp8Q9CY28 Pdgfa-203ENSMUST00000110896 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gtpbp8Q9CY28 Ppt2-205ENSMUST00000169067 1392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gtpbp8Q9CY28 Kcnh2-202ENSMUST00000115098 3193 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gtpbp8Q9CY28 Agk-201ENSMUST00000031977 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gtpbp8Q9CY28 Kcng4-202ENSMUST00000164382 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gtpbp8Q9CY28 Sh2b1-202ENSMUST00000205340 3366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gtpbp8Q9CY28 Slc44a1-201ENSMUST00000102911 3102 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gtpbp8Q9CY28 Lcn12-202ENSMUST00000114245 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gtpbp8Q9CY28 Naa10-204ENSMUST00000114389 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gtpbp8Q9CY28 Gm14641-201ENSMUST00000136486 452 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gtpbp8Q9CY28 Gm12781-201ENSMUST00000146269 395 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gtpbp8Q9CY28 Gm21362-201ENSMUST00000194272 928 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Gtpbp8Q9CY28 Gpr137b-201ENSMUST00000021738 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
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Gtpbp8Q9CY28 Hist1h2af-201ENSMUST00000073261 399 ntAPPRIS P1 BASIC15.12■□□□□ 0.01
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Gtpbp8Q9CY28 Rabep1-201ENSMUST00000076270 5408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gtpbp8Q9CY28 Cacna1i-202ENSMUST00000160424 9781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gtpbp8Q9CY28 Fgf17-201ENSMUST00000022697 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gtpbp8Q9CY28 Cend1-201ENSMUST00000084436 1672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gtpbp8Q9CY28 Rab7-203ENSMUST00000113597 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gtpbp8Q9CY28 Gm26580-201ENSMUST00000181002 2095 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gtpbp8Q9CY28 Cd5-201ENSMUST00000025571 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gtpbp8Q9CY28 Mff-211ENSMUST00000161648 1715 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gtpbp8Q9CY28 Zfp219-212ENSMUST00000228580 2812 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gtpbp8Q9CY28 Atp6v1b2-201ENSMUST00000006435 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gtpbp8Q9CY28 Col4a3bp-203ENSMUST00000179226 3040 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gtpbp8Q9CY28 Spata6-201ENSMUST00000038868 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gtpbp8Q9CY28 Csnk1e-201ENSMUST00000117786 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gtpbp8Q9CY28 Itgb4-201ENSMUST00000021107 6014 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gtpbp8Q9CY28 Fubp3-202ENSMUST00000113482 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gtpbp8Q9CY28 Slc16a3-202ENSMUST00000100130 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gtpbp8Q9CY28 Aptx-203ENSMUST00000108103 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gtpbp8Q9CY28 Rgp1-203ENSMUST00000117140 1635 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gtpbp8Q9CY28 Mid1ip1-202ENSMUST00000115524 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gtpbp8Q9CY28 Rps27a-202ENSMUST00000102845 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
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Gtpbp8Q9CY28 Aicda-202ENSMUST00000160685 1292 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gtpbp8Q9CY28 Gm15890-201ENSMUST00000161024 770 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
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Gtpbp8Q9CY28 Gm44430-201ENSMUST00000203376 995 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Gtpbp8Q9CY28 Ppp1r27-201ENSMUST00000026121 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gtpbp8Q9CY28 Rflna-201ENSMUST00000036109 1681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gtpbp8Q9CY28 E230001N04Rik-202ENSMUST00000181029 2091 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Gtpbp8Q9CY28 Antxr2-202ENSMUST00000199088 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gtpbp8Q9CY28 Gm10532-201ENSMUST00000181913 2301 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gtpbp8Q9CY28 Simc1-201ENSMUST00000118072 2116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gtpbp8Q9CY28 Vegfa-201ENSMUST00000024747 2765 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gtpbp8Q9CY28 Rftn1-201ENSMUST00000044503 4029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gtpbp8Q9CY28 Rab6a-201ENSMUST00000032946 3214 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gtpbp8Q9CY28 Rab35-201ENSMUST00000031492 2820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gtpbp8Q9CY28 Ppp2r5e-201ENSMUST00000021447 4810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gtpbp8Q9CY28 Kbtbd11-201ENSMUST00000069399 6973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gtpbp8Q9CY28 Chsy3-201ENSMUST00000080721 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gtpbp8Q9CY28 Mrm2-201ENSMUST00000031536 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gtpbp8Q9CY28 Tm9sf1-205ENSMUST00000122358 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gtpbp8Q9CY28 Nfe2-208ENSMUST00000149111 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gtpbp8Q9CY28 Gm17509-201ENSMUST00000165680 2375 ntAPPRIS P1 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gtpbp8Q9CY28 Hand1-201ENSMUST00000036917 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gtpbp8Q9CY28 Ccdc30-201ENSMUST00000044781 1464 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gtpbp8Q9CY28 Gnaz-201ENSMUST00000037813 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
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