Protein–RNA interactions for Protein: Q9CXZ1

Ndufs4, NADH dehydrogenase [ubiquinone] iron-sulfur protein 4, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 175 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ndufs4Q9CXZ1 Sept8-201ENSMUST00000108987 4436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ndufs4Q9CXZ1 Fcgrt-203ENSMUST00000210642 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ndufs4Q9CXZ1 1700025L06Rik-203ENSMUST00000211477 1623 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ndufs4Q9CXZ1 Sh2b3-201ENSMUST00000040308 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ndufs4Q9CXZ1 Zic5-201ENSMUST00000039118 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ndufs4Q9CXZ1 Ssfa2-201ENSMUST00000111784 4999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ndufs4Q9CXZ1 Arl4c-202ENSMUST00000159814 3997 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ndufs4Q9CXZ1 Krt6b-201ENSMUST00000023786 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ndufs4Q9CXZ1 Gpr137b-201ENSMUST00000021738 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ndufs4Q9CXZ1 Hnrnpa1-202ENSMUST00000087351 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ndufs4Q9CXZ1 Raxos1-201ENSMUST00000181100 2547 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ndufs4Q9CXZ1 Was-201ENSMUST00000033505 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ndufs4Q9CXZ1 Kdf1-201ENSMUST00000042919 1708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ndufs4Q9CXZ1 Dlgap1-201ENSMUST00000060072 5420 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ndufs4Q9CXZ1 Gm26803-201ENSMUST00000181705 2011 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ndufs4Q9CXZ1 Smurf2-201ENSMUST00000092517 3125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ndufs4Q9CXZ1 Sap18-202ENSMUST00000111268 662 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ndufs4Q9CXZ1 Hotairm1-202ENSMUST00000132559 713 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ndufs4Q9CXZ1 Apopt1-204ENSMUST00000163220 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ndufs4Q9CXZ1 Gm10052-201ENSMUST00000168019 960 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Ndufs4Q9CXZ1 Gm7729-201ENSMUST00000050143 801 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Ndufs4Q9CXZ1 Rpl27-201ENSMUST00000077856 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ndufs4Q9CXZ1 Tmem128-201ENSMUST00000087511 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ndufs4Q9CXZ1 Zswim1-201ENSMUST00000017908 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ndufs4Q9CXZ1 Gm28265-201ENSMUST00000188201 2319 ntBASIC15.52■□□□□ 0.07
Ndufs4Q9CXZ1 Kat2a-202ENSMUST00000103118 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Ndufs4Q9CXZ1 Plppr5-201ENSMUST00000039564 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Ndufs4Q9CXZ1 Rnf103-201ENSMUST00000064637 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Ndufs4Q9CXZ1 Sbk2-202ENSMUST00000182214 2236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Ndufs4Q9CXZ1 Klhl42-201ENSMUST00000036003 6267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Ndufs4Q9CXZ1 Snx8-204ENSMUST00000196130 2547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Ndufs4Q9CXZ1 Casp8-204ENSMUST00000191201 1849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Ndufs4Q9CXZ1 Klhdc4-201ENSMUST00000045884 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Ndufs4Q9CXZ1 Mrm2-201ENSMUST00000031536 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ndufs4Q9CXZ1 Calb2-201ENSMUST00000003754 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ndufs4Q9CXZ1 Bnipl-201ENSMUST00000098871 1414 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ndufs4Q9CXZ1 Il6st-208ENSMUST00000184311 2985 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ndufs4Q9CXZ1 Celf6-204ENSMUST00000121266 2610 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ndufs4Q9CXZ1 Vmn1r17-201ENSMUST00000227186 2234 ntAPPRIS P2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ndufs4Q9CXZ1 Gm37166-201ENSMUST00000195473 2474 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Ndufs4Q9CXZ1 Rerg-204ENSMUST00000149100 635 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ndufs4Q9CXZ1 Ctsg-201ENSMUST00000015583 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ndufs4Q9CXZ1 Gas5-203ENSMUST00000159119 665 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ndufs4Q9CXZ1 Calu-207ENSMUST00000173216 673 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ndufs4Q9CXZ1 5430416N02Rik-202ENSMUST00000181873 626 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ndufs4Q9CXZ1 Gm28793-201ENSMUST00000190845 413 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ndufs4Q9CXZ1 Gm36967-201ENSMUST00000193814 266 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Ndufs4Q9CXZ1 Rpl18-204ENSMUST00000209693 535 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ndufs4Q9CXZ1 3110040N11Rik-201ENSMUST00000026092 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ndufs4Q9CXZ1 Insl3-201ENSMUST00000034261 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ndufs4Q9CXZ1 Tctex1d4-201ENSMUST00000062206 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ndufs4Q9CXZ1 Prima1-201ENSMUST00000074416 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ndufs4Q9CXZ1 E230025N22Rik-201ENSMUST00000115682 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ndufs4Q9CXZ1 Zdhhc2-201ENSMUST00000049389 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ndufs4Q9CXZ1 Plcl1-201ENSMUST00000042986 6580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ndufs4Q9CXZ1 Fam46b-201ENSMUST00000051676 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ndufs4Q9CXZ1 Adss-201ENSMUST00000016105 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ndufs4Q9CXZ1 Mtfr1l-202ENSMUST00000116279 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ndufs4Q9CXZ1 H2-DMb1-201ENSMUST00000114232 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ndufs4Q9CXZ1 Sh3glb1-205ENSMUST00000199854 1416 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ndufs4Q9CXZ1 Pde5a-204ENSMUST00000200389 7603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ndufs4Q9CXZ1 Ebf1-203ENSMUST00000109268 2864 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ndufs4Q9CXZ1 Atf6b-202ENSMUST00000173984 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ndufs4Q9CXZ1 Ano8-204ENSMUST00000213382 3785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ndufs4Q9CXZ1 AC115863.1-201ENSMUST00000214815 1813 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Ndufs4Q9CXZ1 Kctd12-202ENSMUST00000184744 6057 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ndufs4Q9CXZ1 Slc1a6-201ENSMUST00000005490 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ndufs4Q9CXZ1 Acsl3-205ENSMUST00000142704 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ndufs4Q9CXZ1 Guf1-202ENSMUST00000087228 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ndufs4Q9CXZ1 Ddx51-201ENSMUST00000031478 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ndufs4Q9CXZ1 Mettl21a-201ENSMUST00000053469 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ndufs4Q9CXZ1 Lcn12-202ENSMUST00000114245 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ndufs4Q9CXZ1 Naa10-204ENSMUST00000114389 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ndufs4Q9CXZ1 Ndufb11-201ENSMUST00000116621 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ndufs4Q9CXZ1 Gm14859-201ENSMUST00000117752 357 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Ndufs4Q9CXZ1 Gm7284-201ENSMUST00000131667 944 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Ndufs4Q9CXZ1 Vkorc1-203ENSMUST00000206053 606 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ndufs4Q9CXZ1 1700022H01Rik-201ENSMUST00000219142 387 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ndufs4Q9CXZ1 Chaf1b-201ENSMUST00000023666 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ndufs4Q9CXZ1 9930021J03Rik-204ENSMUST00000177155 6632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ndufs4Q9CXZ1 Fgf17-201ENSMUST00000022697 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ndufs4Q9CXZ1 Gramd4-204ENSMUST00000138134 4292 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ndufs4Q9CXZ1 Capn10-201ENSMUST00000027488 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ndufs4Q9CXZ1 Chmp2b-201ENSMUST00000004965 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ndufs4Q9CXZ1 Met-203ENSMUST00000115443 6809 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ndufs4Q9CXZ1 Vegfa-201ENSMUST00000024747 2765 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ndufs4Q9CXZ1 Lad1-201ENSMUST00000038760 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ndufs4Q9CXZ1 Nit1-202ENSMUST00000111295 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ndufs4Q9CXZ1 Ttbk1-201ENSMUST00000047034 6959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ndufs4Q9CXZ1 Carmil2-201ENSMUST00000062574 2526 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ndufs4Q9CXZ1 Uba52-203ENSMUST00000125184 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ndufs4Q9CXZ1 Gm44973-201ENSMUST00000207050 1003 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ndufs4Q9CXZ1 AC130713.1-201ENSMUST00000228853 1096 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Ndufs4Q9CXZ1 Tsr3-201ENSMUST00000063574 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ndufs4Q9CXZ1 Znfx1-201ENSMUST00000048988 7218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ndufs4Q9CXZ1 Smpd5-202ENSMUST00000163991 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ndufs4Q9CXZ1 Adam33-201ENSMUST00000052104 2795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ndufs4Q9CXZ1 Pgm2l1-202ENSMUST00000084935 8834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ndufs4Q9CXZ1 Ptpn5-201ENSMUST00000033142 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ndufs4Q9CXZ1 Gm10435-202ENSMUST00000162526 2878 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
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