Protein–RNA interactions for Protein: Q9CWX4

Rpusd4, Mitochondrial RNA pseudouridine synthase Rpusd4, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 377 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpusd4Q9CWX4 Krt13-201ENSMUST00000007275 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Rpusd4Q9CWX4 Ablim1-204ENSMUST00000111524 1251 ntTSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Rpusd4Q9CWX4 Gm13836-201ENSMUST00000121159 501 ntBASIC13.8□□□□□ -0.2
Rpusd4Q9CWX4 Gm26938-201ENSMUST00000182839 744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.8□□□□□ -0.2
Rpusd4Q9CWX4 Gm7889-201ENSMUST00000185591 958 ntBASIC13.8□□□□□ -0.2
Rpusd4Q9CWX4 Tacc1-202ENSMUST00000084512 6471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Rpusd4Q9CWX4 Zkscan3-203ENSMUST00000116434 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Rpusd4Q9CWX4 Acaa1a-201ENSMUST00000039784 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Rpusd4Q9CWX4 H2-Q4-201ENSMUST00000081435 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Rpusd4Q9CWX4 Zscan25-201ENSMUST00000094116 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Rpusd4Q9CWX4 Dusp12-201ENSMUST00000027970 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Rpusd4Q9CWX4 Tfeb-204ENSMUST00000113288 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Rpusd4Q9CWX4 Wscd1-203ENSMUST00000108511 2866 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.8□□□□□ -0.2
Rpusd4Q9CWX4 9930012K11Rik-205ENSMUST00000153871 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Rpusd4Q9CWX4 Spi1-201ENSMUST00000002180 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Rpusd4Q9CWX4 Serac1-201ENSMUST00000024570 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Rpusd4Q9CWX4 Pias4-201ENSMUST00000005064 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Rpusd4Q9CWX4 Zbtb45-201ENSMUST00000051390 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Rpusd4Q9CWX4 Dgkq-201ENSMUST00000053913 4938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Rpusd4Q9CWX4 Ccdc105-201ENSMUST00000105383 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Rpusd4Q9CWX4 Rccd1-202ENSMUST00000121882 2324 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.79□□□□□ -0.2
Rpusd4Q9CWX4 Mapk14-201ENSMUST00000004990 3547 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Rpusd4Q9CWX4 Mapk14-202ENSMUST00000062694 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Rpusd4Q9CWX4 Mapk14-204ENSMUST00000114754 3592 ntTSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Rpusd4Q9CWX4 Pde8b-201ENSMUST00000022192 2517 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.79□□□□□ -0.2
Rpusd4Q9CWX4 Dcxr-202ENSMUST00000106148 830 ntTSL 2 BASIC13.79□□□□□ -0.2
Rpusd4Q9CWX4 Cab39-202ENSMUST00000113360 3805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Rpusd4Q9CWX4 Gm2431-201ENSMUST00000171531 519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.79□□□□□ -0.2
Rpusd4Q9CWX4 Cmc1-202ENSMUST00000215799 531 ntTSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Rpusd4Q9CWX4 Gng11-201ENSMUST00000031670 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Rpusd4Q9CWX4 BC048679-201ENSMUST00000073406 522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Rpusd4Q9CWX4 Kdm7a-201ENSMUST00000002305 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Rpusd4Q9CWX4 Tmem2-201ENSMUST00000025663 6585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Rpusd4Q9CWX4 Specc1-210ENSMUST00000201723 2690 ntTSL 5 BASIC13.79□□□□□ -0.2
Rpusd4Q9CWX4 Fem1a-201ENSMUST00000060253 6816 ntAPPRIS P1 BASIC13.79□□□□□ -0.2
Rpusd4Q9CWX4 Crem-203ENSMUST00000082141 2820 ntTSL 5 BASIC13.79□□□□□ -0.2
Rpusd4Q9CWX4 Tm2d3-202ENSMUST00000065574 1478 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Rpusd4Q9CWX4 Scin-201ENSMUST00000002640 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Rpusd4Q9CWX4 Rnpep-202ENSMUST00000077340 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Rpusd4Q9CWX4 Cand2-201ENSMUST00000075995 5474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Rpusd4Q9CWX4 Kcnh1-202ENSMUST00000110844 7161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Rpusd4Q9CWX4 Rab37-202ENSMUST00000067754 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Rpusd4Q9CWX4 Bend5-201ENSMUST00000030274 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Rpusd4Q9CWX4 Pi4kb-202ENSMUST00000107251 2895 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Rpusd4Q9CWX4 Acsl3-201ENSMUST00000035779 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Rpusd4Q9CWX4 Slc23a4-205ENSMUST00000201355 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
Rpusd4Q9CWX4 Svip-201ENSMUST00000098414 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Rpusd4Q9CWX4 Higd1a-201ENSMUST00000060251 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Rpusd4Q9CWX4 Rflnb-201ENSMUST00000021207 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Rpusd4Q9CWX4 B3gnt6-201ENSMUST00000098278 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Rpusd4Q9CWX4 Zfp879-203ENSMUST00000109134 2414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
Rpusd4Q9CWX4 Cmip-202ENSMUST00000166750 2408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
Rpusd4Q9CWX4 Zfp879-201ENSMUST00000049625 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Rpusd4Q9CWX4 Zbtb16-202ENSMUST00000216150 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Rpusd4Q9CWX4 Syt8-202ENSMUST00000105976 1289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Rpusd4Q9CWX4 Izumo1r-204ENSMUST00000121116 726 ntTSL 2 BASIC13.78□□□□□ -0.2
Rpusd4Q9CWX4 Gm16061-201ENSMUST00000122167 857 ntBASIC13.78□□□□□ -0.2
Rpusd4Q9CWX4 Syt8-205ENSMUST00000122393 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Rpusd4Q9CWX4 Slc2a8-204ENSMUST00000153484 1168 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Rpusd4Q9CWX4 Ccl27a-219ENSMUST00000173865 657 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Rpusd4Q9CWX4 Gm45058-201ENSMUST00000205810 766 ntBASIC13.78□□□□□ -0.2
Rpusd4Q9CWX4 Gm17949-201ENSMUST00000210548 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
Rpusd4Q9CWX4 Fkbp3-201ENSMUST00000021332 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Rpusd4Q9CWX4 Atp23-201ENSMUST00000026504 903 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Rpusd4Q9CWX4 Casc4-204ENSMUST00000110586 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Rpusd4Q9CWX4 Mmp23-201ENSMUST00000030937 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Rpusd4Q9CWX4 Pdlim5-211ENSMUST00000198381 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
Rpusd4Q9CWX4 Prss53-202ENSMUST00000205300 1662 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Rpusd4Q9CWX4 Chchd4-201ENSMUST00000040835 3472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Rpusd4Q9CWX4 Fam81a-201ENSMUST00000034749 3703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Rpusd4Q9CWX4 2810425M01Rik-201ENSMUST00000180790 1850 ntTSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
Rpusd4Q9CWX4 Trp73-203ENSMUST00000105643 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
Rpusd4Q9CWX4 Dlg5-203ENSMUST00000090398 7851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Rpusd4Q9CWX4 Prkab1-202ENSMUST00000111999 2026 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.78□□□□□ -0.2
Rpusd4Q9CWX4 Naa15-201ENSMUST00000029303 6090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Rpusd4Q9CWX4 Kif21a-201ENSMUST00000067205 6307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Rpusd4Q9CWX4 Ift74-201ENSMUST00000030311 2139 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
Rpusd4Q9CWX4 Gas2-201ENSMUST00000051912 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Rpusd4Q9CWX4 Relb-201ENSMUST00000049912 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Rpusd4Q9CWX4 Tsnax-201ENSMUST00000075896 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Rpusd4Q9CWX4 Eif4g3-203ENSMUST00000084215 8134 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.2
Rpusd4Q9CWX4 Tmem117-201ENSMUST00000080141 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
Rpusd4Q9CWX4 Nadk-203ENSMUST00000105613 3152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
Rpusd4Q9CWX4 Adarb1-202ENSMUST00000098374 6584 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
Rpusd4Q9CWX4 Trank1-201ENSMUST00000078626 10520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.2
Rpusd4Q9CWX4 Tmem28-201ENSMUST00000096363 3909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.2
Rpusd4Q9CWX4 Tal1-201ENSMUST00000030489 4213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
Rpusd4Q9CWX4 Tor1aip2-205ENSMUST00000111757 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
Rpusd4Q9CWX4 Slc35e4-202ENSMUST00000109995 3063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Rpusd4Q9CWX4 Gm13474-201ENSMUST00000122466 815 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
Rpusd4Q9CWX4 1810062O18Rik-202ENSMUST00000128848 745 ntTSL 3 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Rpusd4Q9CWX4 Pick1-206ENSMUST00000166155 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Rpusd4Q9CWX4 Gm10231-201ENSMUST00000181584 441 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
Rpusd4Q9CWX4 Atp5g2-202ENSMUST00000185641 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Rpusd4Q9CWX4 Gm10175-202ENSMUST00000208752 441 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
Rpusd4Q9CWX4 Gm18959-201ENSMUST00000208954 655 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
Rpusd4Q9CWX4 Chmp2a-203ENSMUST00000210587 930 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Rpusd4Q9CWX4 Gm26709-202ENSMUST00000223049 819 ntTSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Rpusd4Q9CWX4 AC158538.1-201ENSMUST00000225870 294 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
Rpusd4Q9CWX4 AC121577.1-201ENSMUST00000227302 707 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
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