Protein–RNA interactions for Protein: Q9CTN4

Rhobtb3, Rho-related BTB domain-containing protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 611 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rhobtb3Q9CTN4 Gfod2-203ENSMUST00000155038 951 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Rhobtb3Q9CTN4 Tnnt2-206ENSMUST00000178854 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Rhobtb3Q9CTN4 Rnf26-208ENSMUST00000185479 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Rhobtb3Q9CTN4 Tnnt2-211ENSMUST00000189355 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Rhobtb3Q9CTN4 Grtp1-204ENSMUST00000209691 1030 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Rhobtb3Q9CTN4 Kiss1r-202ENSMUST00000219745 979 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Rhobtb3Q9CTN4 3110040N11Rik-201ENSMUST00000026092 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Rhobtb3Q9CTN4 Atp23-201ENSMUST00000026504 903 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Rhobtb3Q9CTN4 Cdkn2c-201ENSMUST00000063531 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Rhobtb3Q9CTN4 Ewsr1-204ENSMUST00000093365 1290 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Rhobtb3Q9CTN4 Pde8b-208ENSMUST00000162292 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Rhobtb3Q9CTN4 Men1-204ENSMUST00000113500 2742 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Rhobtb3Q9CTN4 4930524O07Rik-203ENSMUST00000193135 2289 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
Rhobtb3Q9CTN4 Hoxa10-201ENSMUST00000121043 1436 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Rhobtb3Q9CTN4 Snx2-201ENSMUST00000037850 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Rhobtb3Q9CTN4 Umad1-202ENSMUST00000159335 2615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Rhobtb3Q9CTN4 Kifc3-203ENSMUST00000169748 3384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Rhobtb3Q9CTN4 Fam72a-201ENSMUST00000068613 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Rhobtb3Q9CTN4 Ero1lb-203ENSMUST00000221560 1964 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Rhobtb3Q9CTN4 Dab2-208ENSMUST00000160134 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Rhobtb3Q9CTN4 Pgc-201ENSMUST00000024782 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Rhobtb3Q9CTN4 Map1s-201ENSMUST00000019405 3314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Rhobtb3Q9CTN4 Smtn-201ENSMUST00000020718 1747 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Rhobtb3Q9CTN4 Dpm1-209ENSMUST00000154111 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Rhobtb3Q9CTN4 Cd2bp2-201ENSMUST00000035771 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Rhobtb3Q9CTN4 Chga-201ENSMUST00000021610 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Rhobtb3Q9CTN4 Tap1-201ENSMUST00000041633 2614 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Rhobtb3Q9CTN4 Taz-201ENSMUST00000069722 1851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Rhobtb3Q9CTN4 Casp8-204ENSMUST00000191201 1849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Rhobtb3Q9CTN4 Mir770-201ENSMUST00000103252 94 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
Rhobtb3Q9CTN4 Psme2-208ENSMUST00000161807 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Rhobtb3Q9CTN4 Arl5b-206ENSMUST00000193836 481 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Rhobtb3Q9CTN4 Gm44430-201ENSMUST00000203376 995 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
Rhobtb3Q9CTN4 Gm44965-201ENSMUST00000204121 360 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Rhobtb3Q9CTN4 Sftpb-201ENSMUST00000070437 1131 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Rhobtb3Q9CTN4 Nkx2-9-201ENSMUST00000072631 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Rhobtb3Q9CTN4 Fads3-201ENSMUST00000115995 3269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Rhobtb3Q9CTN4 Otp-201ENSMUST00000022195 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Rhobtb3Q9CTN4 Dohh-201ENSMUST00000072751 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Rhobtb3Q9CTN4 Zfp862-ps-203ENSMUST00000203848 1776 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Rhobtb3Q9CTN4 Tfap2d-201ENSMUST00000037294 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Rhobtb3Q9CTN4 Loxl4-205ENSMUST00000171432 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Rhobtb3Q9CTN4 Igdcc4-205ENSMUST00000213533 6220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Rhobtb3Q9CTN4 Igdcc4-201ENSMUST00000035499 6223 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Rhobtb3Q9CTN4 Cldn6-201ENSMUST00000024699 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Rhobtb3Q9CTN4 Sh2b1-201ENSMUST00000032978 3393 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Rhobtb3Q9CTN4 Ephb4-203ENSMUST00000111055 4296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Rhobtb3Q9CTN4 Plbd2-201ENSMUST00000031597 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Rhobtb3Q9CTN4 Irak1-201ENSMUST00000033769 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Rhobtb3Q9CTN4 Gm9013-201ENSMUST00000132939 882 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
Rhobtb3Q9CTN4 Ccl27a-219ENSMUST00000173865 657 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Rhobtb3Q9CTN4 Olfr1272-201ENSMUST00000099750 927 ntAPPRIS P1 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Rhobtb3Q9CTN4 Zbtb48-201ENSMUST00000066715 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Rhobtb3Q9CTN4 Haghl-201ENSMUST00000077938 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Rhobtb3Q9CTN4 Rpp25-201ENSMUST00000080514 1423 ntAPPRIS P1 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Rhobtb3Q9CTN4 Gm9889-202ENSMUST00000206983 1577 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
Rhobtb3Q9CTN4 Rimbp3-201ENSMUST00000169803 5787 ntAPPRIS P1 BASIC17.77■□□□□ 0.43
Rhobtb3Q9CTN4 Cyp4f13-204ENSMUST00000139353 1389 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Rhobtb3Q9CTN4 Rad23a-202ENSMUST00000109761 1842 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Rhobtb3Q9CTN4 Pax8-201ENSMUST00000028355 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Rhobtb3Q9CTN4 Agfg1-204ENSMUST00000186302 2352 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Rhobtb3Q9CTN4 Gm6858-201ENSMUST00000208582 1468 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
Rhobtb3Q9CTN4 Zpbp2-202ENSMUST00000081033 1300 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Rhobtb3Q9CTN4 Itpkb-201ENSMUST00000070181 6235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Rhobtb3Q9CTN4 Psen2-203ENSMUST00000111105 1575 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Rhobtb3Q9CTN4 Man2a2-201ENSMUST00000098346 6554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Rhobtb3Q9CTN4 Kctd15-203ENSMUST00000108070 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Rhobtb3Q9CTN4 Gm10052-201ENSMUST00000168019 960 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
Rhobtb3Q9CTN4 Imp3-201ENSMUST00000034827 924 ntAPPRIS P1 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Rhobtb3Q9CTN4 Prm2-201ENSMUST00000037996 621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Rhobtb3Q9CTN4 Gm7729-201ENSMUST00000050143 801 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
Rhobtb3Q9CTN4 Nt5c1a-201ENSMUST00000068262 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Rhobtb3Q9CTN4 Ina-201ENSMUST00000037636 3240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Rhobtb3Q9CTN4 AC132265.1-201ENSMUST00000219233 1665 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
Rhobtb3Q9CTN4 Gm6583-201ENSMUST00000051117 2233 ntAPPRIS P1 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Rhobtb3Q9CTN4 Igf2-205ENSMUST00000121128 4722 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Rhobtb3Q9CTN4 Ehmt2-204ENSMUST00000114033 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Rhobtb3Q9CTN4 Mccc1-201ENSMUST00000029259 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Rhobtb3Q9CTN4 Ccdc174-201ENSMUST00000037783 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Rhobtb3Q9CTN4 Pnpla2-202ENSMUST00000064151 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Rhobtb3Q9CTN4 Nup98-205ENSMUST00000211022 3132 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Rhobtb3Q9CTN4 Mamstr-201ENSMUST00000148532 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Rhobtb3Q9CTN4 Olah-202ENSMUST00000115087 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Rhobtb3Q9CTN4 Gm26889-201ENSMUST00000181523 2252 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Rhobtb3Q9CTN4 Cap1-203ENSMUST00000106257 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Rhobtb3Q9CTN4 Hoxaas2-202ENSMUST00000155922 1567 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Rhobtb3Q9CTN4 Cant1-204ENSMUST00000106288 2873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Rhobtb3Q9CTN4 Txnrd2-215ENSMUST00000206151 2874 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Rhobtb3Q9CTN4 H2-DMb1-201ENSMUST00000114232 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Rhobtb3Q9CTN4 Tlcd2-202ENSMUST00000108435 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Rhobtb3Q9CTN4 Apopt1-204ENSMUST00000163220 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Rhobtb3Q9CTN4 Gm38282-201ENSMUST00000192751 695 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Rhobtb3Q9CTN4 1810010D01Rik-204ENSMUST00000208788 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Rhobtb3Q9CTN4 Myoz1-201ENSMUST00000090469 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Rhobtb3Q9CTN4 Specc1-210ENSMUST00000201723 2690 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Rhobtb3Q9CTN4 Erg-207ENSMUST00000171646 1519 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Rhobtb3Q9CTN4 Agbl5-208ENSMUST00000201168 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Rhobtb3Q9CTN4 Brpf1-202ENSMUST00000113119 4826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Rhobtb3Q9CTN4 Ldha-201ENSMUST00000005051 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Rhobtb3Q9CTN4 Cds2-202ENSMUST00000103181 8396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.8 ms