Protein–RNA interactions for Protein: Q9CTG6

Atp13a2, Cation-transporting ATPase 13A2, mousemouse

Predictions only

Length 1,169 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atp13a2Q9CTG6 Parg-201ENSMUST00000022470 4413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Atp13a2Q9CTG6 AK157302-201ENSMUST00000104942 1924 ntAPPRIS P1 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Atp13a2Q9CTG6 Nfkbid-202ENSMUST00000108175 2000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Atp13a2Q9CTG6 Tm6sf2-202ENSMUST00000110160 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Atp13a2Q9CTG6 Gm14859-201ENSMUST00000117752 357 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
Atp13a2Q9CTG6 Sh3bp2-203ENSMUST00000118545 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Atp13a2Q9CTG6 Tmtc4-204ENSMUST00000126867 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Atp13a2Q9CTG6 Kctd6-202ENSMUST00000170111 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Atp13a2Q9CTG6 Gm26568-201ENSMUST00000180496 1594 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Atp13a2Q9CTG6 Gm16861-201ENSMUST00000181498 1647 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Atp13a2Q9CTG6 Gm7213-201ENSMUST00000215977 950 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
Atp13a2Q9CTG6 Dok5-201ENSMUST00000029075 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Atp13a2Q9CTG6 Nucb2-201ENSMUST00000032895 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Atp13a2Q9CTG6 Spg21-201ENSMUST00000034955 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Atp13a2Q9CTG6 Inppl1-201ENSMUST00000035836 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Atp13a2Q9CTG6 Cldn22-201ENSMUST00000038693 995 ntAPPRIS P1 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Atp13a2Q9CTG6 Sirt6-201ENSMUST00000042923 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Atp13a2Q9CTG6 Fam199x-201ENSMUST00000047852 8299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Atp13a2Q9CTG6 Arpc5-201ENSMUST00000077755 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Atp13a2Q9CTG6 Gzme-201ENSMUST00000089549 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Atp13a2Q9CTG6 Chic2-201ENSMUST00000075452 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Atp13a2Q9CTG6 Wapl-201ENSMUST00000048263 6351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Atp13a2Q9CTG6 Nipa2-201ENSMUST00000032635 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Atp13a2Q9CTG6 Gramd3-201ENSMUST00000070166 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Atp13a2Q9CTG6 Pde8b-201ENSMUST00000022192 2517 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Atp13a2Q9CTG6 Evc-202ENSMUST00000114148 2119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Atp13a2Q9CTG6 Nr1h2-203ENSMUST00000107911 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Atp13a2Q9CTG6 Fam185a-201ENSMUST00000056045 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Atp13a2Q9CTG6 Papd4-201ENSMUST00000048702 2990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Atp13a2Q9CTG6 Gm7854-202ENSMUST00000187409 1433 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Atp13a2Q9CTG6 Hist1h2bj-201ENSMUST00000110452 463 ntAPPRIS P1 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Atp13a2Q9CTG6 Hist1h2bp-202ENSMUST00000110473 621 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Atp13a2Q9CTG6 Ndufb11-201ENSMUST00000116621 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Atp13a2Q9CTG6 Gm13420-201ENSMUST00000129574 1091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Atp13a2Q9CTG6 Gm13025-201ENSMUST00000141469 1163 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Atp13a2Q9CTG6 Hist1h2bm-201ENSMUST00000224651 524 ntAPPRIS P1 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Atp13a2Q9CTG6 Cnbd2-201ENSMUST00000037096 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Atp13a2Q9CTG6 Prkag2-203ENSMUST00000114975 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Atp13a2Q9CTG6 App-201ENSMUST00000005406 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Atp13a2Q9CTG6 Ttll11-202ENSMUST00000112976 3077 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Atp13a2Q9CTG6 Sox1ot-201ENSMUST00000080795 5064 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Atp13a2Q9CTG6 Kbtbd2-201ENSMUST00000114321 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Atp13a2Q9CTG6 Phax-201ENSMUST00000008445 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Atp13a2Q9CTG6 Npffr1-201ENSMUST00000020287 3479 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Atp13a2Q9CTG6 Rab33b-201ENSMUST00000054387 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Atp13a2Q9CTG6 Brpf1-202ENSMUST00000113119 4826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Atp13a2Q9CTG6 Gnas-202ENSMUST00000087871 3903 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Atp13a2Q9CTG6 Ly6e-201ENSMUST00000051698 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Atp13a2Q9CTG6 Naa50-204ENSMUST00000161326 4487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Atp13a2Q9CTG6 Dusp14-205ENSMUST00000164891 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Atp13a2Q9CTG6 Txnrd2-215ENSMUST00000206151 2874 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Atp13a2Q9CTG6 Trim25-202ENSMUST00000100627 1433 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Atp13a2Q9CTG6 Slc32a1-201ENSMUST00000045738 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Atp13a2Q9CTG6 Iars2-201ENSMUST00000027921 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Atp13a2Q9CTG6 Dynlt1c-201ENSMUST00000092966 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Atp13a2Q9CTG6 Gtf3a-204ENSMUST00000146511 1298 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Atp13a2Q9CTG6 Gm18958-201ENSMUST00000174258 762 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Atp13a2Q9CTG6 Gm10819-201ENSMUST00000099988 561 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Atp13a2Q9CTG6 Sgsm2-201ENSMUST00000057631 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Atp13a2Q9CTG6 Nkpd1-202ENSMUST00000207576 2916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Atp13a2Q9CTG6 A130010J15Rik-201ENSMUST00000110831 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Atp13a2Q9CTG6 Slc8a3-202ENSMUST00000085238 4927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Atp13a2Q9CTG6 Cdk9-202ENSMUST00000120105 1565 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Atp13a2Q9CTG6 Zbtb16-202ENSMUST00000216150 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Atp13a2Q9CTG6 Nubpl-201ENSMUST00000040090 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Atp13a2Q9CTG6 Gm14317-201ENSMUST00000151754 1464 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Atp13a2Q9CTG6 Gpd1l-201ENSMUST00000084853 1436 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Atp13a2Q9CTG6 Syn1-201ENSMUST00000081893 3209 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Atp13a2Q9CTG6 Wnt10b-204ENSMUST00000226655 1807 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Atp13a2Q9CTG6 Eif2ak3-201ENSMUST00000034093 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Atp13a2Q9CTG6 Rbfox2-204ENSMUST00000171751 3558 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Atp13a2Q9CTG6 Skp1a-203ENSMUST00000109072 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Atp13a2Q9CTG6 Pde1c-203ENSMUST00000164037 3068 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Atp13a2Q9CTG6 Cacna1h-205ENSMUST00000159610 8230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Atp13a2Q9CTG6 Cacna1h-201ENSMUST00000078496 8220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Atp13a2Q9CTG6 Gm43791-201ENSMUST00000202914 468 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Atp13a2Q9CTG6 Pcyox1-206ENSMUST00000204116 546 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Atp13a2Q9CTG6 Gm4316-202ENSMUST00000212490 1115 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Atp13a2Q9CTG6 Krtap1-5-201ENSMUST00000054532 1041 ntAPPRIS P1 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Atp13a2Q9CTG6 Nkx2-6-201ENSMUST00000062437 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Atp13a2Q9CTG6 Cdkn2c-201ENSMUST00000063531 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Atp13a2Q9CTG6 Rgs6-206ENSMUST00000186309 1693 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Atp13a2Q9CTG6 Mios-201ENSMUST00000040017 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Atp13a2Q9CTG6 Akp-ps1-202ENSMUST00000212812 1959 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Atp13a2Q9CTG6 Zfp318-201ENSMUST00000113481 7850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Atp13a2Q9CTG6 Gm16759-204ENSMUST00000191455 4272 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Atp13a2Q9CTG6 Mesp2-201ENSMUST00000107394 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Atp13a2Q9CTG6 Ccdc84-202ENSMUST00000213813 2675 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Atp13a2Q9CTG6 Rilpl1-201ENSMUST00000062153 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Atp13a2Q9CTG6 Nmt2-203ENSMUST00000102989 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Atp13a2Q9CTG6 Cspp1-203ENSMUST00000118263 2162 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Atp13a2Q9CTG6 Espnl-201ENSMUST00000088904 5445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Atp13a2Q9CTG6 Emc8-201ENSMUST00000034277 4942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Atp13a2Q9CTG6 Chuk-202ENSMUST00000119591 3481 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Atp13a2Q9CTG6 Fam214a-202ENSMUST00000170846 4355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Atp13a2Q9CTG6 Ephb4-201ENSMUST00000061244 4340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Atp13a2Q9CTG6 1300014J16Rik-201ENSMUST00000219015 1337 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Atp13a2Q9CTG6 4933402J07Rik-201ENSMUST00000093342 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Atp13a2Q9CTG6 Fbxl7-201ENSMUST00000059204 4632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Atp13a2Q9CTG6 1700024G13Rik-201ENSMUST00000100723 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 70.3 ms