Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQJ4

Rnf2, E3 ubiquitin-protein ligase RING2, mousemouse

Predictions only

Length 336 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf2Q9CQJ4 Cpsf4-207ENSMUST00000162244 1387 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Rnf2Q9CQJ4 Celf3-208ENSMUST00000198316 2505 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Rnf2Q9CQJ4 Zbtb16-202ENSMUST00000216150 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Rnf2Q9CQJ4 Tle3-205ENSMUST00000159630 4065 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Rnf2Q9CQJ4 Fndc3a-201ENSMUST00000089017 6143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Rnf2Q9CQJ4 Ctsd-202ENSMUST00000151120 2127 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Rnf2Q9CQJ4 Mtif3-201ENSMUST00000016654 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Rnf2Q9CQJ4 Tjap1-214ENSMUST00000225413 2189 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Rnf2Q9CQJ4 Atp5c1-203ENSMUST00000114897 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Rnf2Q9CQJ4 Lypla1-208ENSMUST00000150971 877 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Rnf2Q9CQJ4 Vps51-209ENSMUST00000160590 840 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Rnf2Q9CQJ4 2310001K24Rik-202ENSMUST00000186760 740 ntTSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Rnf2Q9CQJ4 Myl6-206ENSMUST00000218127 691 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Rnf2Q9CQJ4 Ppic-201ENSMUST00000025419 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Rnf2Q9CQJ4 Ntpcr-201ENSMUST00000034313 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Rnf2Q9CQJ4 Fam167b-201ENSMUST00000052835 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Rnf2Q9CQJ4 2510002D24Rik-201ENSMUST00000055413 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Rnf2Q9CQJ4 Mier2-203ENSMUST00000165028 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Rnf2Q9CQJ4 Mbtps2-201ENSMUST00000058098 4797 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Rnf2Q9CQJ4 Capn10-201ENSMUST00000027488 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Rnf2Q9CQJ4 Crybg1-201ENSMUST00000020017 6608 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Rnf2Q9CQJ4 Eif4g3-203ENSMUST00000084215 8134 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Rnf2Q9CQJ4 Papd4-205ENSMUST00000225868 3081 ntAPPRIS ALT1 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Rnf2Q9CQJ4 Tmem2-201ENSMUST00000025663 6585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Rnf2Q9CQJ4 Tnfrsf25-202ENSMUST00000035275 1603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Rnf2Q9CQJ4 Sirt6-201ENSMUST00000042923 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Rnf2Q9CQJ4 Ccdc126-201ENSMUST00000055559 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Rnf2Q9CQJ4 Gigyf1-201ENSMUST00000031727 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Rnf2Q9CQJ4 Arhgef10l-201ENSMUST00000039204 4493 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Rnf2Q9CQJ4 Espn-204ENSMUST00000080042 1402 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Rnf2Q9CQJ4 Sesn1-202ENSMUST00000099931 3809 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Rnf2Q9CQJ4 Gm26592-201ENSMUST00000180870 1730 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Rnf2Q9CQJ4 Lhx8-205ENSMUST00000205251 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Rnf2Q9CQJ4 Gm9917-202ENSMUST00000181099 1499 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Rnf2Q9CQJ4 Plekha4-206ENSMUST00000211155 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Rnf2Q9CQJ4 Disc1-201ENSMUST00000074562 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Rnf2Q9CQJ4 Disc1-203ENSMUST00000098311 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Rnf2Q9CQJ4 Phb-204ENSMUST00000125172 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Rnf2Q9CQJ4 Vmn1r17-204ENSMUST00000228294 2084 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Rnf2Q9CQJ4 Gm14321-201ENSMUST00000127441 632 ntTSL 3 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Rnf2Q9CQJ4 Tex30-204ENSMUST00000128190 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Rnf2Q9CQJ4 Gm24841-201ENSMUST00000158676 357 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Rnf2Q9CQJ4 Gm16042-201ENSMUST00000204813 1247 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Rnf2Q9CQJ4 Smim15-206ENSMUST00000226042 1092 ntAPPRIS P1 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Rnf2Q9CQJ4 1700020N01Rik-201ENSMUST00000057341 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Rnf2Q9CQJ4 Ocrl-201ENSMUST00000001202 5253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Rnf2Q9CQJ4 Prpf3-207ENSMUST00000161476 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Rnf2Q9CQJ4 Tox2-201ENSMUST00000099110 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Rnf2Q9CQJ4 Slc38a10-202ENSMUST00000053692 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Rnf2Q9CQJ4 Sbk2-202ENSMUST00000182214 2236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Rnf2Q9CQJ4 Mlec-201ENSMUST00000112121 5955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Rnf2Q9CQJ4 Map4-201ENSMUST00000035055 6091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Rnf2Q9CQJ4 Fzd10-201ENSMUST00000117102 3250 ntAPPRIS P1 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Rnf2Q9CQJ4 Pola2-202ENSMUST00000165143 2397 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Rnf2Q9CQJ4 Fbxl3-206ENSMUST00000145693 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Rnf2Q9CQJ4 Tcp1-209ENSMUST00000151287 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Rnf2Q9CQJ4 Cgn-202ENSMUST00000107273 5016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Rnf2Q9CQJ4 Kifc3-212ENSMUST00000213004 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Rnf2Q9CQJ4 Pde8b-201ENSMUST00000022192 2517 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Rnf2Q9CQJ4 Atp1a1-201ENSMUST00000036493 3679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Rnf2Q9CQJ4 Dap-201ENSMUST00000044524 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Rnf2Q9CQJ4 Tmem33-204ENSMUST00000161369 6164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Rnf2Q9CQJ4 Diras2-201ENSMUST00000057442 4786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Rnf2Q9CQJ4 Patz1-205ENSMUST00000110043 3702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Rnf2Q9CQJ4 Tfap2a-206ENSMUST00000224665 1958 ntAPPRIS ALT1 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Rnf2Q9CQJ4 Spata18-202ENSMUST00000071077 1978 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Rnf2Q9CQJ4 Kit-204ENSMUST00000144270 5241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Rnf2Q9CQJ4 Sema6d-201ENSMUST00000051419 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Rnf2Q9CQJ4 Cenps-202ENSMUST00000105695 544 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Rnf2Q9CQJ4 Gm715-201ENSMUST00000117865 831 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Rnf2Q9CQJ4 Gm12085-201ENSMUST00000119263 940 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Rnf2Q9CQJ4 1110046J04Rik-201ENSMUST00000147622 397 ntTSL 3 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Rnf2Q9CQJ4 Gng2-202ENSMUST00000159028 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Rnf2Q9CQJ4 Gm26829-201ENSMUST00000180581 934 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Rnf2Q9CQJ4 Ramp1-203ENSMUST00000188475 711 ntTSL 3 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Rnf2Q9CQJ4 Gm42738-201ENSMUST00000201813 439 ntTSL 3 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Rnf2Q9CQJ4 Gm7579-201ENSMUST00000097943 732 ntAPPRIS P1 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Rnf2Q9CQJ4 Med7-209ENSMUST00000170928 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Rnf2Q9CQJ4 Sctr-201ENSMUST00000072886 2012 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Rnf2Q9CQJ4 Ogfr-201ENSMUST00000029087 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Rnf2Q9CQJ4 Gm19430-201ENSMUST00000193847 2137 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Rnf2Q9CQJ4 Pdss2-201ENSMUST00000095725 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Rnf2Q9CQJ4 Prss33-201ENSMUST00000059906 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Rnf2Q9CQJ4 Nrg2-203ENSMUST00000115713 3001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Rnf2Q9CQJ4 Ankrd10-202ENSMUST00000169782 5156 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Rnf2Q9CQJ4 Kirrel-202ENSMUST00000107618 7278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Rnf2Q9CQJ4 Stx18-201ENSMUST00000031008 1471 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Rnf2Q9CQJ4 Jph4-201ENSMUST00000022819 4489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Rnf2Q9CQJ4 Tatdn2-202ENSMUST00000113022 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Rnf2Q9CQJ4 Slc35a1-201ENSMUST00000029970 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Rnf2Q9CQJ4 Foxo3-203ENSMUST00000105502 6848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Rnf2Q9CQJ4 Faf1-201ENSMUST00000102724 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Rnf2Q9CQJ4 Slc35e4-202ENSMUST00000109995 3063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Rnf2Q9CQJ4 Slc35e4-201ENSMUST00000051207 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Rnf2Q9CQJ4 Dpysl3-204ENSMUST00000121805 5484 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Rnf2Q9CQJ4 Gramd3-201ENSMUST00000070166 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Rnf2Q9CQJ4 Pacs2-202ENSMUST00000220541 3101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Rnf2Q9CQJ4 Spg21-201ENSMUST00000034955 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Rnf2Q9CQJ4 Dbnl-202ENSMUST00000102928 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Rnf2Q9CQJ4 Bend6-204ENSMUST00000129464 1750 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.1 ms