Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQJ1

Higd2a, HIG1 domain family member 2A, mousemouse

Predictions only

Length 106 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Higd2aQ9CQJ1 Jagn1-202ENSMUST00000204254 1147 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Higd2aQ9CQJ1 Abcc5-203ENSMUST00000096199 1136 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Higd2aQ9CQJ1 Cstf2-201ENSMUST00000033609 4502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Higd2aQ9CQJ1 Adcy1-201ENSMUST00000020706 12259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Higd2aQ9CQJ1 Dtx3-202ENSMUST00000116229 1994 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Higd2aQ9CQJ1 Nr1h2-204ENSMUST00000107912 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Higd2aQ9CQJ1 A930017K11Rik-201ENSMUST00000162431 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Higd2aQ9CQJ1 Erich2-203ENSMUST00000134607 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Higd2aQ9CQJ1 AC013548.1-201ENSMUST00000228850 4738 ntAPPRIS P1 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Higd2aQ9CQJ1 Enah-202ENSMUST00000111024 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Higd2aQ9CQJ1 Mapk8ip3-203ENSMUST00000115229 5603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Higd2aQ9CQJ1 Rb1cc1-201ENSMUST00000027040 7607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Higd2aQ9CQJ1 Lcmt2-201ENSMUST00000099486 2047 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Higd2aQ9CQJ1 Whrn-207ENSMUST00000107393 4028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Higd2aQ9CQJ1 Whrn-201ENSMUST00000063650 4016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Higd2aQ9CQJ1 Whrn-203ENSMUST00000084510 4049 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Higd2aQ9CQJ1 Sh3gl2-203ENSMUST00000107188 2286 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Higd2aQ9CQJ1 Gabrb3-201ENSMUST00000039697 5579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Higd2aQ9CQJ1 Dlgap1-206ENSMUST00000133717 2355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Higd2aQ9CQJ1 Appl2-201ENSMUST00000020500 3020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Higd2aQ9CQJ1 Gm26568-201ENSMUST00000180496 1594 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Higd2aQ9CQJ1 Irak1-201ENSMUST00000033769 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Higd2aQ9CQJ1 Vsig10l-204ENSMUST00000203769 2473 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Higd2aQ9CQJ1 H2-DMb1-201ENSMUST00000114232 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Higd2aQ9CQJ1 Ccdc69-201ENSMUST00000055040 1402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Higd2aQ9CQJ1 Sdk1-202ENSMUST00000085774 10352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Higd2aQ9CQJ1 Mterf1a-202ENSMUST00000117463 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Higd2aQ9CQJ1 Zkscan8-202ENSMUST00000110481 728 ntTSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Higd2aQ9CQJ1 2310009B15Rik-201ENSMUST00000112025 565 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Higd2aQ9CQJ1 Apopt1-204ENSMUST00000163220 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Higd2aQ9CQJ1 Gm10052-201ENSMUST00000168019 960 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Higd2aQ9CQJ1 C130032M10Rik-201ENSMUST00000180393 728 ntAPPRIS P1 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Higd2aQ9CQJ1 Celrr-203ENSMUST00000185678 937 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Higd2aQ9CQJ1 Gm7729-201ENSMUST00000050143 801 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Higd2aQ9CQJ1 Itgb7-201ENSMUST00000001327 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Higd2aQ9CQJ1 Smpdl3b-201ENSMUST00000030709 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Higd2aQ9CQJ1 A130010J15Rik-201ENSMUST00000110831 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Higd2aQ9CQJ1 Polr3e-203ENSMUST00000207481 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Higd2aQ9CQJ1 Kbtbd2-201ENSMUST00000114321 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Higd2aQ9CQJ1 Jam2-201ENSMUST00000098407 1998 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Higd2aQ9CQJ1 Lrch4-201ENSMUST00000031734 3078 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Higd2aQ9CQJ1 Paip2-201ENSMUST00000041314 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Higd2aQ9CQJ1 Mpped2-202ENSMUST00000111063 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Higd2aQ9CQJ1 Endov-203ENSMUST00000106245 5126 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Higd2aQ9CQJ1 Dscc1-201ENSMUST00000023059 1324 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Higd2aQ9CQJ1 Gpsm3-201ENSMUST00000038244 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Higd2aQ9CQJ1 Pgm3-202ENSMUST00000072585 1920 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Higd2aQ9CQJ1 Gm15635-204ENSMUST00000208024 2539 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
Higd2aQ9CQJ1 Ykt6-201ENSMUST00000002818 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Higd2aQ9CQJ1 Cyr61-201ENSMUST00000029846 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Higd2aQ9CQJ1 Stradb-201ENSMUST00000027185 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Higd2aQ9CQJ1 Babam1-201ENSMUST00000002473 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Higd2aQ9CQJ1 Mettl27-205ENSMUST00000111221 1796 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Higd2aQ9CQJ1 Gatc-201ENSMUST00000139167 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Higd2aQ9CQJ1 Dph1-201ENSMUST00000044949 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Higd2aQ9CQJ1 Fmnl3-201ENSMUST00000081224 4137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Higd2aQ9CQJ1 Fcho1-209ENSMUST00000146100 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Higd2aQ9CQJ1 Ewsr1-203ENSMUST00000079949 2588 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Higd2aQ9CQJ1 Diaph2-201ENSMUST00000037854 3742 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Higd2aQ9CQJ1 1700025L06Rik-203ENSMUST00000211477 1623 ntTSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Higd2aQ9CQJ1 Sirt7-202ENSMUST00000106183 427 ntTSL 3 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Higd2aQ9CQJ1 Smim1-210ENSMUST00000146054 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Higd2aQ9CQJ1 Gm38973-201ENSMUST00000206810 878 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Higd2aQ9CQJ1 Gm18669-201ENSMUST00000216049 778 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
Higd2aQ9CQJ1 Mrpl36-202ENSMUST00000221730 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Higd2aQ9CQJ1 Gm26709-203ENSMUST00000223260 715 ntTSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Higd2aQ9CQJ1 AC125350.1-201ENSMUST00000225115 903 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
Higd2aQ9CQJ1 AL731706.1-201ENSMUST00000227806 944 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Higd2aQ9CQJ1 3110040N11Rik-201ENSMUST00000026092 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Higd2aQ9CQJ1 Ifi27l2b-201ENSMUST00000044687 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Higd2aQ9CQJ1 Gmnn-201ENSMUST00000006898 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Higd2aQ9CQJ1 Tmem128-201ENSMUST00000087511 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Higd2aQ9CQJ1 Fezf1-201ENSMUST00000031709 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Higd2aQ9CQJ1 Zfp764-201ENSMUST00000059199 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Higd2aQ9CQJ1 Lrrfip1-212ENSMUST00000189617 2155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Higd2aQ9CQJ1 Casp8-204ENSMUST00000191201 1849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Higd2aQ9CQJ1 Mapkapk3-201ENSMUST00000035194 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Higd2aQ9CQJ1 Erlin1-201ENSMUST00000071698 3228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Higd2aQ9CQJ1 Dok5-201ENSMUST00000029075 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Higd2aQ9CQJ1 Hsd17b1-201ENSMUST00000019445 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Higd2aQ9CQJ1 Gm11841-201ENSMUST00000117060 1963 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
Higd2aQ9CQJ1 Tmem241-205ENSMUST00000209859 1426 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Higd2aQ9CQJ1 Zfp423-202ENSMUST00000109655 4907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Higd2aQ9CQJ1 Nmt2-203ENSMUST00000102989 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Higd2aQ9CQJ1 Nlk-201ENSMUST00000142739 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Higd2aQ9CQJ1 Itgav-202ENSMUST00000111740 6788 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Higd2aQ9CQJ1 Zfp865-201ENSMUST00000076251 7503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Higd2aQ9CQJ1 Nefh-201ENSMUST00000093369 3994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Higd2aQ9CQJ1 Wbp2-202ENSMUST00000106444 1012 ntTSL 2 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Higd2aQ9CQJ1 Bpifa3-202ENSMUST00000109746 1102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Higd2aQ9CQJ1 Cd82-204ENSMUST00000111257 1003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Higd2aQ9CQJ1 Gm15794-201ENSMUST00000120182 631 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
Higd2aQ9CQJ1 Olfr129-201ENSMUST00000122318 993 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
Higd2aQ9CQJ1 Gm19345-201ENSMUST00000172815 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Higd2aQ9CQJ1 Gm43077-201ENSMUST00000200602 491 ntTSL 3 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Higd2aQ9CQJ1 Pdcd2l-201ENSMUST00000002710 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Higd2aQ9CQJ1 Calm2-201ENSMUST00000040440 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Higd2aQ9CQJ1 Spem1-201ENSMUST00000045771 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Higd2aQ9CQJ1 Lce1a1-201ENSMUST00000074142 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Higd2aQ9CQJ1 Msl2-201ENSMUST00000085177 4889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.2 ms