Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQ73

Pkp2, Plakophilin 2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 795 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pkp2Q9CQ73 Mis18a-201ENSMUST00000099554 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Pkp2Q9CQ73 Mapk7-203ENSMUST00000108714 3069 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Pkp2Q9CQ73 Ppif-201ENSMUST00000022419 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Pkp2Q9CQ73 Gm15743-202ENSMUST00000182690 1901 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
Pkp2Q9CQ73 Hand1-201ENSMUST00000036917 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Pkp2Q9CQ73 Gm12999-201ENSMUST00000124471 485 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Pkp2Q9CQ73 Sox2ot-202ENSMUST00000196058 753 ntTSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Pkp2Q9CQ73 Apoa1-201ENSMUST00000034588 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Pkp2Q9CQ73 Slc38a10-203ENSMUST00000076697 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Pkp2Q9CQ73 Gm26526-201ENSMUST00000181075 2927 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Pkp2Q9CQ73 Syt3-202ENSMUST00000118962 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Pkp2Q9CQ73 Tmem131-201ENSMUST00000027290 6546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Pkp2Q9CQ73 A230072C01Rik-202ENSMUST00000136447 1412 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Pkp2Q9CQ73 Fhdc1-205ENSMUST00000194027 1648 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Pkp2Q9CQ73 Dlx3-201ENSMUST00000092768 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Pkp2Q9CQ73 Smad5-203ENSMUST00000109876 4570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Pkp2Q9CQ73 Tmx1-201ENSMUST00000021471 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Pkp2Q9CQ73 Aptx-203ENSMUST00000108103 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Pkp2Q9CQ73 Mindy2-201ENSMUST00000049031 8081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Pkp2Q9CQ73 Gnao1-201ENSMUST00000034198 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Pkp2Q9CQ73 Wt1-205ENSMUST00000143043 3090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Pkp2Q9CQ73 Dcaf12l2-201ENSMUST00000115057 2885 ntAPPRIS P1 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Pkp2Q9CQ73 Rom1-201ENSMUST00000096242 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Pkp2Q9CQ73 Lcat-201ENSMUST00000038896 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Pkp2Q9CQ73 Nfe2-208ENSMUST00000149111 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Pkp2Q9CQ73 Ckb-201ENSMUST00000001304 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Pkp2Q9CQ73 Gm36858-201ENSMUST00000194501 2391 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
Pkp2Q9CQ73 Higd1b-202ENSMUST00000107072 497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Pkp2Q9CQ73 Higd1b-203ENSMUST00000107073 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Pkp2Q9CQ73 Gm13036-201ENSMUST00000117799 748 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
Pkp2Q9CQ73 1700028B04Rik-202ENSMUST00000190841 971 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Pkp2Q9CQ73 Gm42670-201ENSMUST00000201816 1292 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
Pkp2Q9CQ73 Higd1b-201ENSMUST00000021302 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Pkp2Q9CQ73 4931406C07Rik-209ENSMUST00000217042 691 ntTSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Pkp2Q9CQ73 Lrrc26-201ENSMUST00000028337 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Pkp2Q9CQ73 Eif5a-203ENSMUST00000071026 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Pkp2Q9CQ73 Dnaja3-202ENSMUST00000115854 2505 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Pkp2Q9CQ73 Zfp622-201ENSMUST00000061875 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Pkp2Q9CQ73 Nsmf-202ENSMUST00000074422 2824 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Pkp2Q9CQ73 Coq8b-202ENSMUST00000108378 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Pkp2Q9CQ73 Gnb2-212ENSMUST00000150063 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Pkp2Q9CQ73 Senp3-202ENSMUST00000066760 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Pkp2Q9CQ73 Dock9-202ENSMUST00000100299 6476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Pkp2Q9CQ73 Pofut1-204ENSMUST00000109794 1688 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Pkp2Q9CQ73 Fam72a-201ENSMUST00000068613 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Pkp2Q9CQ73 Crebbp-201ENSMUST00000023165 10820 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Pkp2Q9CQ73 Mark3-201ENSMUST00000075281 3321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Pkp2Q9CQ73 Gm3928-201ENSMUST00000121141 1307 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
Pkp2Q9CQ73 Rpl39l-202ENSMUST00000121292 550 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Pkp2Q9CQ73 Ptpa-208ENSMUST00000131476 989 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Pkp2Q9CQ73 Gm17114-201ENSMUST00000164716 511 ntTSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Pkp2Q9CQ73 Ccnd3-208ENSMUST00000182539 931 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Pkp2Q9CQ73 Gm27628-201ENSMUST00000184911 107 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
Pkp2Q9CQ73 Cela3a-201ENSMUST00000024200 958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Pkp2Q9CQ73 Rbpms-202ENSMUST00000033995 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Pkp2Q9CQ73 BC031181-201ENSMUST00000040284 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Pkp2Q9CQ73 Khsrp-201ENSMUST00000007814 3990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Pkp2Q9CQ73 Rbck1-202ENSMUST00000109847 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Pkp2Q9CQ73 Klhl33-202ENSMUST00000170855 1422 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Pkp2Q9CQ73 1700066B19Rik-201ENSMUST00000097617 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Pkp2Q9CQ73 Chga-201ENSMUST00000021610 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Pkp2Q9CQ73 Cpeb2-204ENSMUST00000166713 6846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
Pkp2Q9CQ73 Arrb1-210ENSMUST00000179755 7135 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
Pkp2Q9CQ73 Arrb1-202ENSMUST00000098266 7132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Pkp2Q9CQ73 Scube2-202ENSMUST00000106728 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
Pkp2Q9CQ73 Stk39-201ENSMUST00000102715 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Pkp2Q9CQ73 Ginm1-201ENSMUST00000039763 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Pkp2Q9CQ73 Zbtb46-202ENSMUST00000087409 2577 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Pkp2Q9CQ73 Nt5c-202ENSMUST00000106530 836 ntTSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Pkp2Q9CQ73 Gm15467-201ENSMUST00000120582 445 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
Pkp2Q9CQ73 Gm11536-201ENSMUST00000130733 535 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Pkp2Q9CQ73 Sirpa-213ENSMUST00000163034 677 ntTSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Pkp2Q9CQ73 Fahd2a-201ENSMUST00000028848 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Pkp2Q9CQ73 Glcci1-201ENSMUST00000064285 6200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Pkp2Q9CQ73 Col4a3bp-201ENSMUST00000077672 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Pkp2Q9CQ73 March8-202ENSMUST00000101032 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Pkp2Q9CQ73 Homer2-206ENSMUST00000207983 1634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Pkp2Q9CQ73 Rapsn-201ENSMUST00000050323 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Pkp2Q9CQ73 Tm4sf4-201ENSMUST00000029377 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Pkp2Q9CQ73 Dlgap4-205ENSMUST00000109567 4840 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Pkp2Q9CQ73 Bend4-204ENSMUST00000201972 8268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Pkp2Q9CQ73 Esrrb-201ENSMUST00000021680 2136 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Pkp2Q9CQ73 Gstm4-201ENSMUST00000029489 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Pkp2Q9CQ73 Aatk-203ENSMUST00000103020 5687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Pkp2Q9CQ73 Fam155a-206ENSMUST00000208933 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Pkp2Q9CQ73 Adamtsl1-201ENSMUST00000048885 1842 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Pkp2Q9CQ73 Kifc3-203ENSMUST00000169748 3384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Pkp2Q9CQ73 Lncpint-201ENSMUST00000115107 1676 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Pkp2Q9CQ73 Hs3st1-201ENSMUST00000053116 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Pkp2Q9CQ73 Zbtb45-201ENSMUST00000051390 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Pkp2Q9CQ73 Gm13830-202ENSMUST00000144202 381 ntTSL 3 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Pkp2Q9CQ73 Gm15246-201ENSMUST00000149873 540 ntTSL 3 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Pkp2Q9CQ73 Banf1-202ENSMUST00000170010 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Pkp2Q9CQ73 1700012D14Rik-201ENSMUST00000209597 605 ntTSL 3 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Pkp2Q9CQ73 Csrp2-207ENSMUST00000220409 780 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Pkp2Q9CQ73 AC164441.1-201ENSMUST00000221369 1004 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Pkp2Q9CQ73 Igflr1-201ENSMUST00000043850 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Pkp2Q9CQ73 Lsmem1-201ENSMUST00000095760 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Pkp2Q9CQ73 Zmynd19-201ENSMUST00000028350 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Pkp2Q9CQ73 Arhgef10-201ENSMUST00000084207 5528 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30 ms