Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQ07

Lrrc18, Leucine-rich repeat-containing protein 18, mousemouse

Predictions only

Length 262 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrrc18Q9CQ07 Cdc42se2-201ENSMUST00000064104 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Lrrc18Q9CQ07 Nos1ap-207ENSMUST00000161966 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Lrrc18Q9CQ07 Ffar3-201ENSMUST00000094583 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Lrrc18Q9CQ07 Galnt13-204ENSMUST00000112636 7530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Lrrc18Q9CQ07 Btd-201ENSMUST00000090147 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Lrrc18Q9CQ07 Cadps2-205ENSMUST00000115358 4848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Lrrc18Q9CQ07 Timm44-201ENSMUST00000003029 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Lrrc18Q9CQ07 Hnrnpa1-202ENSMUST00000087351 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Lrrc18Q9CQ07 Nat8l-201ENSMUST00000056355 6529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Lrrc18Q9CQ07 Pex5l-206ENSMUST00000108226 2632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Lrrc18Q9CQ07 Aig1-205ENSMUST00000162610 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Lrrc18Q9CQ07 Lsr-202ENSMUST00000098553 1930 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Lrrc18Q9CQ07 Tes-202ENSMUST00000115467 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Lrrc18Q9CQ07 Nipal2-201ENSMUST00000040791 4331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Lrrc18Q9CQ07 Vmn1r17-204ENSMUST00000228294 2084 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Lrrc18Q9CQ07 Galt-202ENSMUST00000108038 1859 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Lrrc18Q9CQ07 Rnf170-209ENSMUST00000209300 1881 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Lrrc18Q9CQ07 Slco3a1-201ENSMUST00000026897 4589 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Lrrc18Q9CQ07 Gjd2-201ENSMUST00000090275 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Lrrc18Q9CQ07 Col13a1-205ENSMUST00000105454 3162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Lrrc18Q9CQ07 Sh3rf3-205ENSMUST00000153031 5682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Lrrc18Q9CQ07 Gm6277-201ENSMUST00000180860 1839 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Lrrc18Q9CQ07 Tfap2a-209ENSMUST00000225180 1828 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Lrrc18Q9CQ07 Mettl4-ps1-202ENSMUST00000130218 1323 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Lrrc18Q9CQ07 Gm26666-201ENSMUST00000180763 2461 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Lrrc18Q9CQ07 Slc25a31-201ENSMUST00000091184 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Lrrc18Q9CQ07 Fdx1-202ENSMUST00000214013 2759 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Lrrc18Q9CQ07 Trim11-201ENSMUST00000093061 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Lrrc18Q9CQ07 Braf-201ENSMUST00000002487 9728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Lrrc18Q9CQ07 Afg3l2-201ENSMUST00000025408 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Lrrc18Q9CQ07 Mvd-201ENSMUST00000006692 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Lrrc18Q9CQ07 Fignl2-202ENSMUST00000213610 4462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Lrrc18Q9CQ07 Zpbp2-205ENSMUST00000107513 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Lrrc18Q9CQ07 Nkx2-2-203ENSMUST00000109970 1053 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Lrrc18Q9CQ07 Epo-203ENSMUST00000111039 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Lrrc18Q9CQ07 Gm1673-203ENSMUST00000114383 511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Lrrc18Q9CQ07 Gm13816-201ENSMUST00000152230 715 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Lrrc18Q9CQ07 Gm26829-201ENSMUST00000180581 934 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Lrrc18Q9CQ07 D330020A13Rik-201ENSMUST00000181956 1069 ntAPPRIS P1 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Lrrc18Q9CQ07 Eloc-203ENSMUST00000185771 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Lrrc18Q9CQ07 Fgf8-202ENSMUST00000026241 1168 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Lrrc18Q9CQ07 Tm2d1-201ENSMUST00000030292 952 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Lrrc18Q9CQ07 Gm5417-201ENSMUST00000079706 384 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Lrrc18Q9CQ07 Fxn-201ENSMUST00000081333 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Lrrc18Q9CQ07 Nnat-201ENSMUST00000088484 458 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Lrrc18Q9CQ07 Zmym3-206ENSMUST00000120107 5882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Lrrc18Q9CQ07 Kbtbd11-201ENSMUST00000069399 6973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Lrrc18Q9CQ07 Cdkn1b-201ENSMUST00000003115 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Lrrc18Q9CQ07 Hspa1a-201ENSMUST00000087328 2967 ntAPPRIS P1 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Lrrc18Q9CQ07 Parp3-203ENSMUST00000123555 2495 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Lrrc18Q9CQ07 Prss33-201ENSMUST00000059906 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Lrrc18Q9CQ07 Asic1-205ENSMUST00000228185 1818 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Lrrc18Q9CQ07 Fip1l1-203ENSMUST00000113535 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Lrrc18Q9CQ07 Kmt5b-213ENSMUST00000176262 3933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Lrrc18Q9CQ07 Fam126a-201ENSMUST00000030849 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Lrrc18Q9CQ07 Vwa8-202ENSMUST00000227255 3406 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Lrrc18Q9CQ07 Ttbk1-201ENSMUST00000047034 6959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Lrrc18Q9CQ07 Cacnb1-204ENSMUST00000107561 1778 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Lrrc18Q9CQ07 Dlk2-202ENSMUST00000166280 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Lrrc18Q9CQ07 Fam222b-202ENSMUST00000100782 2473 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Lrrc18Q9CQ07 Stard5-201ENSMUST00000075418 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Lrrc18Q9CQ07 Dcdc2a-201ENSMUST00000036932 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Lrrc18Q9CQ07 Glis1-202ENSMUST00000106738 2744 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Lrrc18Q9CQ07 Acsl3-201ENSMUST00000035779 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Lrrc18Q9CQ07 D330023K18Rik-201ENSMUST00000133550 920 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Lrrc18Q9CQ07 Gm13647-201ENSMUST00000154654 622 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Lrrc18Q9CQ07 Rcbtb2-217ENSMUST00000167401 868 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Lrrc18Q9CQ07 Cldn14-205ENSMUST00000177648 1266 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Lrrc18Q9CQ07 Plch2-212ENSMUST00000186598 2119 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Lrrc18Q9CQ07 Gm42738-201ENSMUST00000201813 439 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Lrrc18Q9CQ07 Pomc-204ENSMUST00000219543 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Lrrc18Q9CQ07 Cebpg-201ENSMUST00000070191 914 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Lrrc18Q9CQ07 Nme2-202ENSMUST00000072566 734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Lrrc18Q9CQ07 Vps37d-202ENSMUST00000076203 1286 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Lrrc18Q9CQ07 Arf2-202ENSMUST00000063347 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Lrrc18Q9CQ07 Gm37912-201ENSMUST00000191895 3076 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Lrrc18Q9CQ07 Rpf1-201ENSMUST00000029838 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Lrrc18Q9CQ07 Kcna6-204ENSMUST00000185333 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Lrrc18Q9CQ07 Gm10584-201ENSMUST00000207036 2628 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Lrrc18Q9CQ07 Fbxo31-201ENSMUST00000059018 4358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Lrrc18Q9CQ07 Cct6b-201ENSMUST00000021040 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Lrrc18Q9CQ07 F2rl3-201ENSMUST00000058099 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Lrrc18Q9CQ07 Dact1-201ENSMUST00000061273 3650 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Lrrc18Q9CQ07 Pacsin1-203ENSMUST00000114872 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Lrrc18Q9CQ07 Kat5-201ENSMUST00000113641 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Lrrc18Q9CQ07 Amz2-202ENSMUST00000092500 2816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Lrrc18Q9CQ07 Bmp2k-201ENSMUST00000035635 7387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Lrrc18Q9CQ07 Zfp648-201ENSMUST00000086195 1892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Lrrc18Q9CQ07 Fam174b-201ENSMUST00000107456 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Lrrc18Q9CQ07 Fbxo34-201ENSMUST00000043112 2937 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Lrrc18Q9CQ07 Mbp-206ENSMUST00000102812 2108 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Lrrc18Q9CQ07 4430402I18Rik-205ENSMUST00000162110 1559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Lrrc18Q9CQ07 Hr-201ENSMUST00000022691 5487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Lrrc18Q9CQ07 Itsn1-203ENSMUST00000095909 6103 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Lrrc18Q9CQ07 Hnrnpu-201ENSMUST00000037748 7640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Lrrc18Q9CQ07 Pick1-202ENSMUST00000053926 2415 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Lrrc18Q9CQ07 Smim14-202ENSMUST00000121661 1056 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Lrrc18Q9CQ07 Nsl1-203ENSMUST00000139340 837 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Lrrc18Q9CQ07 Sct-202ENSMUST00000167790 507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Lrrc18Q9CQ07 Gm45709-201ENSMUST00000213052 1075 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.8 ms