Protein–RNA interactions for Protein: Q9CPX6

Atg3, Ubiquitin-like-conjugating enzyme ATG3, mousemouse

Predictions only

Length 314 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atg3Q9CPX6 Gnas-222ENSMUST00000180362 1645 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Atg3Q9CPX6 Vmn1r17-201ENSMUST00000227186 2234 ntAPPRIS P2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Atg3Q9CPX6 B4galt5-201ENSMUST00000109221 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Atg3Q9CPX6 Ece2-202ENSMUST00000122306 2495 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Atg3Q9CPX6 Olah-203ENSMUST00000194918 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Atg3Q9CPX6 Rflna-201ENSMUST00000036109 1681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Atg3Q9CPX6 Gjb1-203ENSMUST00000119190 1585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Atg3Q9CPX6 Cnr1-201ENSMUST00000057188 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Atg3Q9CPX6 Ankrd9-202ENSMUST00000128353 2577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Atg3Q9CPX6 Slc29a1-202ENSMUST00000064889 1988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Atg3Q9CPX6 4930512B01Rik-201ENSMUST00000021378 1856 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Atg3Q9CPX6 Tesk1-201ENSMUST00000060864 3947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Atg3Q9CPX6 Gm15690-201ENSMUST00000128728 432 ntTSL 3 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Atg3Q9CPX6 Gm31545-201ENSMUST00000209358 1219 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Atg3Q9CPX6 Smarca4-201ENSMUST00000034707 6354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Atg3Q9CPX6 Adra2a-201ENSMUST00000036700 3801 ntAPPRIS P1 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Atg3Q9CPX6 Rnf7-202ENSMUST00000071301 334 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Atg3Q9CPX6 Gm15743-202ENSMUST00000182690 1901 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
Atg3Q9CPX6 AC132265.1-201ENSMUST00000219233 1665 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
Atg3Q9CPX6 Cdca3-201ENSMUST00000024270 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Atg3Q9CPX6 Gm26613-201ENSMUST00000180919 1457 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Atg3Q9CPX6 Mpped2-202ENSMUST00000111063 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Atg3Q9CPX6 Fam109a-203ENSMUST00000198271 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Atg3Q9CPX6 Asph-204ENSMUST00000084915 2884 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Atg3Q9CPX6 Csnk1e-201ENSMUST00000117786 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Atg3Q9CPX6 1810008I18Rik-202ENSMUST00000187848 819 ntTSL 3 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Atg3Q9CPX6 Fam71e1-204ENSMUST00000205422 366 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Atg3Q9CPX6 Pmm1-202ENSMUST00000071462 1059 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Atg3Q9CPX6 1110038F14Rik-201ENSMUST00000071792 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Atg3Q9CPX6 Ripor2-202ENSMUST00000058009 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Atg3Q9CPX6 Tmtc4-209ENSMUST00000148661 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Atg3Q9CPX6 Sorcs2-201ENSMUST00000037370 5707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Atg3Q9CPX6 Gm6858-201ENSMUST00000208582 1468 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
Atg3Q9CPX6 Krt28-201ENSMUST00000006963 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Atg3Q9CPX6 Krt83-201ENSMUST00000023718 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Atg3Q9CPX6 Gapvd1-201ENSMUST00000028224 5695 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Atg3Q9CPX6 Cd82-205ENSMUST00000116457 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Atg3Q9CPX6 Rhd-201ENSMUST00000030627 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Atg3Q9CPX6 Ggnbp1-201ENSMUST00000053683 1525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Atg3Q9CPX6 Ttyh3-202ENSMUST00000197452 4576 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Atg3Q9CPX6 Kmt5b-203ENSMUST00000113968 3216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Atg3Q9CPX6 Gm13446-201ENSMUST00000124555 2033 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Atg3Q9CPX6 Bicdl1-204ENSMUST00000121746 1568 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Atg3Q9CPX6 Fcho1-209ENSMUST00000146100 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Atg3Q9CPX6 Etfrf1-204ENSMUST00000111723 842 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Atg3Q9CPX6 Med11-202ENSMUST00000151013 445 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Atg3Q9CPX6 Gm15598-201ENSMUST00000156965 763 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Atg3Q9CPX6 Rab10os-206ENSMUST00000179908 746 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Atg3Q9CPX6 Miox-201ENSMUST00000023282 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Atg3Q9CPX6 Mrgprf-202ENSMUST00000117718 1935 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Atg3Q9CPX6 Negr1-202ENSMUST00000074015 4983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Atg3Q9CPX6 Pqlc1-202ENSMUST00000091798 1989 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Atg3Q9CPX6 Trim67-201ENSMUST00000041106 5694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Atg3Q9CPX6 Tom1l2-201ENSMUST00000064019 2151 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Atg3Q9CPX6 Baiap2-202ENSMUST00000075180 3518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Atg3Q9CPX6 Cdc27-202ENSMUST00000106961 1863 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Atg3Q9CPX6 Itsn2-201ENSMUST00000062580 5987 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Atg3Q9CPX6 Camsap3-206ENSMUST00000207533 2584 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Atg3Q9CPX6 Bean1-203ENSMUST00000167633 3275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Atg3Q9CPX6 Sntg2-201ENSMUST00000021004 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Atg3Q9CPX6 Rmnd1-201ENSMUST00000042251 3139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Atg3Q9CPX6 Tm7sf3-201ENSMUST00000037709 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Atg3Q9CPX6 Smox-203ENSMUST00000110180 1617 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Atg3Q9CPX6 Ccnl1-201ENSMUST00000029416 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Atg3Q9CPX6 Chchd7-203ENSMUST00000119307 889 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Atg3Q9CPX6 Gssos1-201ENSMUST00000142509 716 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Atg3Q9CPX6 Gm5682-201ENSMUST00000173402 505 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
Atg3Q9CPX6 Mir6404-201ENSMUST00000183699 94 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
Atg3Q9CPX6 Gm27646-201ENSMUST00000183989 110 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
Atg3Q9CPX6 Gm10419-203ENSMUST00000197854 653 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Atg3Q9CPX6 1700012D14Rik-201ENSMUST00000209597 605 ntTSL 3 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Atg3Q9CPX6 Cidea-201ENSMUST00000025404 1164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Atg3Q9CPX6 Prdm5-203ENSMUST00000081219 984 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Atg3Q9CPX6 Pacs2-202ENSMUST00000220541 3101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Atg3Q9CPX6 Ccdc30-201ENSMUST00000044781 1464 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Atg3Q9CPX6 Ppif-201ENSMUST00000022419 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Atg3Q9CPX6 Tmem163-203ENSMUST00000160616 2657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Atg3Q9CPX6 Trip10-205ENSMUST00000224885 2136 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Atg3Q9CPX6 Ube2j2-203ENSMUST00000105581 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Atg3Q9CPX6 Fam155a-206ENSMUST00000208933 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Atg3Q9CPX6 Bmi1-201ENSMUST00000028071 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Atg3Q9CPX6 Zbtb10-201ENSMUST00000155203 7414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Atg3Q9CPX6 Nfe2-208ENSMUST00000149111 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Atg3Q9CPX6 Ckb-201ENSMUST00000001304 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Atg3Q9CPX6 Abcd4-201ENSMUST00000021666 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Atg3Q9CPX6 Atp2c1-201ENSMUST00000038118 4876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Atg3Q9CPX6 Klk6-202ENSMUST00000107967 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Atg3Q9CPX6 Gm18622-201ENSMUST00000219361 595 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
Atg3Q9CPX6 Kank3-201ENSMUST00000048560 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Atg3Q9CPX6 Abat-202ENSMUST00000115838 1348 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Atg3Q9CPX6 Gm26580-201ENSMUST00000181002 2095 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Atg3Q9CPX6 Mettl27-202ENSMUST00000068617 1685 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Atg3Q9CPX6 Lonp2-201ENSMUST00000034141 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Atg3Q9CPX6 Chaf1b-201ENSMUST00000023666 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Atg3Q9CPX6 Nrl-202ENSMUST00000111404 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Atg3Q9CPX6 Agk-201ENSMUST00000031977 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Atg3Q9CPX6 Gm26752-201ENSMUST00000181086 1537 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Atg3Q9CPX6 4933434E20Rik-203ENSMUST00000068798 1500 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Atg3Q9CPX6 Rom1-201ENSMUST00000096242 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Atg3Q9CPX6 Fam3a-203ENSMUST00000114139 931 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.4 ms