Protein–RNA interactions for Protein: Q9CPR6

Krt88, Keratin 88, mousemouse

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Length 171 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Krt88Q9CPR6 Adgrl1-210ENSMUST00000152978 5734 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Krt88Q9CPR6 Gm5421-201ENSMUST00000181698 2354 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
Krt88Q9CPR6 Ptch1-201ENSMUST00000021921 7725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Krt88Q9CPR6 Rnf139-201ENSMUST00000036904 4348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Krt88Q9CPR6 Uxs1-202ENSMUST00000126008 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Krt88Q9CPR6 Acox1-201ENSMUST00000066587 3987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Krt88Q9CPR6 Erg-207ENSMUST00000171646 1519 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Krt88Q9CPR6 Ogg1-201ENSMUST00000032406 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Krt88Q9CPR6 Ush1c-208ENSMUST00000177212 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.06
Krt88Q9CPR6 Kctd20-208ENSMUST00000168507 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Krt88Q9CPR6 Fgf11-202ENSMUST00000102585 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
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Krt88Q9CPR6 Wee1-201ENSMUST00000033326 3419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
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Krt88Q9CPR6 Asic4-202ENSMUST00000113577 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Krt88Q9CPR6 Rft1-201ENSMUST00000064230 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
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Krt88Q9CPR6 Tnfrsf1a-201ENSMUST00000032491 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
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Krt88Q9CPR6 Cdk9-202ENSMUST00000120105 1565 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
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Krt88Q9CPR6 Ctsh-201ENSMUST00000034915 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
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Krt88Q9CPR6 Tmem65-201ENSMUST00000072113 3747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Krt88Q9CPR6 Hnrnph1-202ENSMUST00000077817 2126 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
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Krt88Q9CPR6 Mrpl13-205ENSMUST00000172387 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
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Krt88Q9CPR6 Sgta-201ENSMUST00000005067 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Krt88Q9CPR6 Tnip2-202ENSMUST00000087737 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
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Krt88Q9CPR6 Fam50b-201ENSMUST00000039605 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Krt88Q9CPR6 Fnbp1-208ENSMUST00000113560 4726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Krt88Q9CPR6 Runx2-202ENSMUST00000113571 5898 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Krt88Q9CPR6 Rdx-201ENSMUST00000000590 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Krt88Q9CPR6 Mdfi-202ENSMUST00000066368 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Krt88Q9CPR6 Tpm3-202ENSMUST00000118566 2190 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Krt88Q9CPR6 Pitpna-203ENSMUST00000143219 3761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Krt88Q9CPR6 Tyro3-201ENSMUST00000028763 3989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Krt88Q9CPR6 Stpg1-201ENSMUST00000063707 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Krt88Q9CPR6 Erich2-203ENSMUST00000134607 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Krt88Q9CPR6 Eva1c-201ENSMUST00000037539 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Krt88Q9CPR6 Gja4-201ENSMUST00000053753 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Krt88Q9CPR6 Crem-228ENSMUST00000150235 2662 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Krt88Q9CPR6 Hsd17b4-201ENSMUST00000025385 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Krt88Q9CPR6 Il11ra1-204ENSMUST00000108042 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Krt88Q9CPR6 Olah-203ENSMUST00000194918 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Krt88Q9CPR6 Disc1-206ENSMUST00000118942 2860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
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