Protein–RNA interactions for Protein: Q99PS0

Krt23, Keratin, type I cytoskeletal 23, mousemouse

Predictions only

Length 422 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Krt23Q99PS0 BC048679-203ENSMUST00000207871 567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Krt23Q99PS0 Gm18032-201ENSMUST00000222541 538 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
Krt23Q99PS0 Efcab11-207ENSMUST00000223114 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Krt23Q99PS0 Krtap1-5-201ENSMUST00000054532 1041 ntAPPRIS P1 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Krt23Q99PS0 Eda-201ENSMUST00000071453 1152 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Krt23Q99PS0 Hist3h2ba-201ENSMUST00000078267 614 ntAPPRIS P1 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Krt23Q99PS0 Mrpl43-201ENSMUST00000097715 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Krt23Q99PS0 Ankrd10-201ENSMUST00000033905 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Krt23Q99PS0 Dlx1-201ENSMUST00000037119 4111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Krt23Q99PS0 Fam171a1-203ENSMUST00000091505 3449 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Krt23Q99PS0 Dand5-201ENSMUST00000065539 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Krt23Q99PS0 Slain1-201ENSMUST00000069443 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Krt23Q99PS0 Dars-201ENSMUST00000027602 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Krt23Q99PS0 Neu1-201ENSMUST00000007253 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Krt23Q99PS0 Dnajc25-201ENSMUST00000095070 4023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Krt23Q99PS0 Plppr5-201ENSMUST00000039564 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Krt23Q99PS0 Mrpl57-201ENSMUST00000022538 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Krt23Q99PS0 Ppp2r2a-204ENSMUST00000225380 1988 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Krt23Q99PS0 Jam2-201ENSMUST00000098407 1998 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Krt23Q99PS0 Stxbp5l-202ENSMUST00000114775 1691 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Krt23Q99PS0 Hnrnpu-201ENSMUST00000037748 7640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Krt23Q99PS0 Psmd6-201ENSMUST00000022256 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Krt23Q99PS0 Rabep1-201ENSMUST00000076270 5408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Krt23Q99PS0 Nfkbid-201ENSMUST00000046177 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Krt23Q99PS0 Gm32996-201ENSMUST00000199828 1447 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Krt23Q99PS0 Gm20878-202ENSMUST00000108028 339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Krt23Q99PS0 Cldn18-203ENSMUST00000131922 860 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Krt23Q99PS0 Serf1-205ENSMUST00000152286 465 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Krt23Q99PS0 1810012K08Rik-201ENSMUST00000155199 574 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Krt23Q99PS0 Ccdc125-202ENSMUST00000170347 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Krt23Q99PS0 Gm19553-201ENSMUST00000175723 494 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Krt23Q99PS0 Gm19426-201ENSMUST00000181711 726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Krt23Q99PS0 Rwdd1-201ENSMUST00000019917 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Krt23Q99PS0 Rpl13a-204ENSMUST00000209711 495 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Krt23Q99PS0 3110070M22Rik-201ENSMUST00000099148 1123 ntAPPRIS P1 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Krt23Q99PS0 Bcor-203ENSMUST00000115512 6887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Krt23Q99PS0 Kptn-201ENSMUST00000006178 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Krt23Q99PS0 Ctsd-202ENSMUST00000151120 2127 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Krt23Q99PS0 Cryl1-201ENSMUST00000022517 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Krt23Q99PS0 Gm14634-201ENSMUST00000139163 1662 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Krt23Q99PS0 Dok3-201ENSMUST00000047877 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Krt23Q99PS0 Podnl1-201ENSMUST00000093380 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Krt23Q99PS0 Rassf7-208ENSMUST00000209500 1560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Krt23Q99PS0 Hs3st2-201ENSMUST00000084628 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Krt23Q99PS0 Pnkp-202ENSMUST00000098478 1550 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Krt23Q99PS0 Cfap20-208ENSMUST00000213086 2544 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Krt23Q99PS0 Trip6-201ENSMUST00000024119 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Krt23Q99PS0 Coq8b-201ENSMUST00000003860 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Krt23Q99PS0 Prickle4-201ENSMUST00000113299 990 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Krt23Q99PS0 Prickle4-202ENSMUST00000113300 1110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Krt23Q99PS0 Atp6v1g2-203ENSMUST00000130992 524 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Krt23Q99PS0 Gm13025-201ENSMUST00000141469 1163 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Krt23Q99PS0 Utp23-204ENSMUST00000161651 582 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Krt23Q99PS0 Coa6-201ENSMUST00000059093 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Krt23Q99PS0 Snapc3-202ENSMUST00000071544 942 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Krt23Q99PS0 Hey2-201ENSMUST00000019924 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Krt23Q99PS0 Disc1-208ENSMUST00000122389 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Krt23Q99PS0 Il6st-206ENSMUST00000183886 3004 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Krt23Q99PS0 Tssc4-206ENSMUST00000177841 1364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Krt23Q99PS0 Wipf3-204ENSMUST00000132855 4516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Krt23Q99PS0 Ankra2-201ENSMUST00000022164 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Krt23Q99PS0 H2-Q4-201ENSMUST00000081435 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Krt23Q99PS0 Rasgef1b-205ENSMUST00000161148 2430 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Krt23Q99PS0 Fcgrt-203ENSMUST00000210642 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Krt23Q99PS0 Snapc3-201ENSMUST00000030206 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Krt23Q99PS0 Sf1-203ENSMUST00000113488 2282 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Krt23Q99PS0 Snx27-202ENSMUST00000107283 3531 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Krt23Q99PS0 Aste1-202ENSMUST00000123807 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Krt23Q99PS0 Pdxdc1-203ENSMUST00000115803 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Krt23Q99PS0 Rab3d-202ENSMUST00000119055 694 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Krt23Q99PS0 Uba52-203ENSMUST00000125184 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Krt23Q99PS0 Sytl3-204ENSMUST00000159880 1296 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Krt23Q99PS0 Nudt21-204ENSMUST00000212981 1184 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Krt23Q99PS0 AC122465.1-201ENSMUST00000220813 1209 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Krt23Q99PS0 Nagpa-201ENSMUST00000023911 2143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Krt23Q99PS0 Srrd-201ENSMUST00000031289 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Krt23Q99PS0 Rpl27-201ENSMUST00000077856 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Krt23Q99PS0 0610009B22Rik-201ENSMUST00000007921 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Krt23Q99PS0 Tfap2b-202ENSMUST00000064976 1946 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Krt23Q99PS0 Patz1-205ENSMUST00000110043 3702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Krt23Q99PS0 Ccdc84-202ENSMUST00000213813 2675 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Krt23Q99PS0 Gm13446-201ENSMUST00000124555 2033 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Krt23Q99PS0 Cpne6-207ENSMUST00000171643 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Krt23Q99PS0 Taf5l-201ENSMUST00000093039 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Krt23Q99PS0 Ehmt2-204ENSMUST00000114033 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Krt23Q99PS0 Rnf26-208ENSMUST00000185479 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Krt23Q99PS0 Dusp12-201ENSMUST00000027970 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Krt23Q99PS0 Socs4-201ENSMUST00000065562 6877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Krt23Q99PS0 Atxn7l3-201ENSMUST00000073234 3688 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Krt23Q99PS0 Gramd4-204ENSMUST00000138134 4292 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Krt23Q99PS0 Ppm1d-201ENSMUST00000020835 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Krt23Q99PS0 Gm13283-201ENSMUST00000191112 1463 ntAPPRIS P1 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Krt23Q99PS0 Chgb-201ENSMUST00000028826 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Krt23Q99PS0 Nrip1-201ENSMUST00000054178 4529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Krt23Q99PS0 Rd3-203ENSMUST00000181512 1760 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Krt23Q99PS0 Gm15690-201ENSMUST00000128728 432 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Krt23Q99PS0 Gm13420-201ENSMUST00000129574 1091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Krt23Q99PS0 Dcps-201ENSMUST00000034539 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Krt23Q99PS0 Nudt1-201ENSMUST00000050205 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Krt23Q99PS0 Gm9987-201ENSMUST00000069768 567 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.6 ms