Protein–RNA interactions for Protein: Q99NH8

Trem2, Triggering receptor expressed on myeloid cells 2, mousemouse

Predictions only

Length 227 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trem2Q99NH8 Tubb4b-201ENSMUST00000043584 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Trem2Q99NH8 Tspoap1-202ENSMUST00000100644 7390 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Trem2Q99NH8 Dohh-201ENSMUST00000072751 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Trem2Q99NH8 Slc13a3-202ENSMUST00000109279 3131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Trem2Q99NH8 Vstm5-201ENSMUST00000034413 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Trem2Q99NH8 Dab2-208ENSMUST00000160134 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Trem2Q99NH8 Lrp5-201ENSMUST00000025856 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Trem2Q99NH8 Slc25a23-201ENSMUST00000040280 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Trem2Q99NH8 Kiss1r-202ENSMUST00000219745 979 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Trem2Q99NH8 Coq7-201ENSMUST00000032887 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Trem2Q99NH8 Gm42473-201ENSMUST00000201056 2291 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Trem2Q99NH8 Slc48a1-201ENSMUST00000117892 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Trem2Q99NH8 Tmtc4-204ENSMUST00000126867 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Trem2Q99NH8 Arrdc1-202ENSMUST00000102935 1574 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Trem2Q99NH8 Snx2-201ENSMUST00000037850 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Trem2Q99NH8 Disc1-206ENSMUST00000118942 2860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Trem2Q99NH8 Plcl2-201ENSMUST00000043938 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Trem2Q99NH8 Gata6-201ENSMUST00000047762 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Trem2Q99NH8 Shroom4-202ENSMUST00000103005 4839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Trem2Q99NH8 Shq1-202ENSMUST00000113312 6816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Trem2Q99NH8 Loxl4-205ENSMUST00000171432 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Trem2Q99NH8 Dnah9-202ENSMUST00000108691 2671 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Trem2Q99NH8 Lrfn1-202ENSMUST00000108288 3060 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Trem2Q99NH8 Trim54-201ENSMUST00000013771 1434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Trem2Q99NH8 Phkg2-202ENSMUST00000121004 1840 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Trem2Q99NH8 Serpine2-201ENSMUST00000027467 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Trem2Q99NH8 Ccdc174-201ENSMUST00000037783 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Trem2Q99NH8 Camsap2-203ENSMUST00000192314 4916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Trem2Q99NH8 Gm9774-202ENSMUST00000192538 1392 ntAPPRIS P1 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Trem2Q99NH8 Rgl3-201ENSMUST00000045726 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Trem2Q99NH8 Psip1-201ENSMUST00000030207 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Trem2Q99NH8 Mir770-201ENSMUST00000103252 94 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Trem2Q99NH8 Arnt-204ENSMUST00000107160 783 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Trem2Q99NH8 4732471J01Rik-202ENSMUST00000205787 991 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Trem2Q99NH8 Prm2-201ENSMUST00000037996 621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Trem2Q99NH8 Gm19684-201ENSMUST00000173128 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Trem2Q99NH8 Bpifb5-201ENSMUST00000045959 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Trem2Q99NH8 Otp-201ENSMUST00000022195 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Trem2Q99NH8 Wscd1-202ENSMUST00000108510 2956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Trem2Q99NH8 Hoxaas2-202ENSMUST00000155922 1567 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Trem2Q99NH8 Wdr41-203ENSMUST00000160115 2851 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Trem2Q99NH8 Oas1b-201ENSMUST00000086377 1832 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Trem2Q99NH8 Pqlc1-205ENSMUST00000131780 2080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Trem2Q99NH8 Gm44729-201ENSMUST00000206759 2052 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Trem2Q99NH8 Adnp-202ENSMUST00000088001 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Trem2Q99NH8 H2-DMb1-201ENSMUST00000114232 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Trem2Q99NH8 Rpp25-201ENSMUST00000080514 1423 ntAPPRIS P1 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Trem2Q99NH8 Cep135-202ENSMUST00000121979 5537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Trem2Q99NH8 Kat5-201ENSMUST00000113641 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Trem2Q99NH8 Gm10516-201ENSMUST00000180598 2615 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Trem2Q99NH8 Ddhd1-201ENSMUST00000051310 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Trem2Q99NH8 Gm26889-201ENSMUST00000181523 2252 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Trem2Q99NH8 Pias4-201ENSMUST00000005064 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Trem2Q99NH8 Syngr2-206ENSMUST00000177131 935 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Trem2Q99NH8 1810010D01Rik-204ENSMUST00000208788 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Trem2Q99NH8 Gm26709-202ENSMUST00000223049 819 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Trem2Q99NH8 Tesc-201ENSMUST00000031304 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Trem2Q99NH8 Spsb2-202ENSMUST00000052727 1219 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Trem2Q99NH8 Specc1-210ENSMUST00000201723 2690 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Trem2Q99NH8 Casp8-204ENSMUST00000191201 1849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Trem2Q99NH8 Snx30-201ENSMUST00000030080 7314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Trem2Q99NH8 Nup98-205ENSMUST00000211022 3132 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Trem2Q99NH8 Taok3-203ENSMUST00000111978 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Trem2Q99NH8 Haghl-201ENSMUST00000077938 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Trem2Q99NH8 Cd164-201ENSMUST00000019962 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Trem2Q99NH8 Fam171a1-203ENSMUST00000091505 3449 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Trem2Q99NH8 Gm16759-201ENSMUST00000126238 1393 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Trem2Q99NH8 Inhbc-201ENSMUST00000026472 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Trem2Q99NH8 Rhobtb2-201ENSMUST00000022665 5322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Trem2Q99NH8 Ttc6-203ENSMUST00000172939 5782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Trem2Q99NH8 Rad23a-202ENSMUST00000109761 1842 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Trem2Q99NH8 Emd-201ENSMUST00000002029 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Trem2Q99NH8 Mfsd10-203ENSMUST00000114331 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Trem2Q99NH8 Iqgap2-201ENSMUST00000068603 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Trem2Q99NH8 Ermp1-203ENSMUST00000159692 7058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Trem2Q99NH8 Tlcd2-202ENSMUST00000108435 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Trem2Q99NH8 Gm38282-201ENSMUST00000192751 695 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Trem2Q99NH8 Gm5587-201ENSMUST00000206270 674 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Trem2Q99NH8 Kctd15-203ENSMUST00000108070 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Trem2Q99NH8 Gstm4-201ENSMUST00000029489 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Trem2Q99NH8 Hipk2-206ENSMUST00000161779 7684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Trem2Q99NH8 Ikzf1-203ENSMUST00000065433 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Trem2Q99NH8 Malsu1-203ENSMUST00000128616 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Trem2Q99NH8 Prrg2-208ENSMUST00000210690 1623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Trem2Q99NH8 Zbtb48-201ENSMUST00000066715 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Trem2Q99NH8 Umad1-202ENSMUST00000159335 2615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Trem2Q99NH8 Lrp8os3-201ENSMUST00000125464 1770 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Trem2Q99NH8 Pax8-201ENSMUST00000028355 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Trem2Q99NH8 Hes6-201ENSMUST00000086851 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Trem2Q99NH8 Hpn-201ENSMUST00000039435 1743 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Trem2Q99NH8 Dctd-201ENSMUST00000033966 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Trem2Q99NH8 Tnnt2-202ENSMUST00000112085 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Trem2Q99NH8 Tnnt2-203ENSMUST00000112086 1094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Trem2Q99NH8 Tnnt2-204ENSMUST00000112087 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Trem2Q99NH8 Oip5-202ENSMUST00000123818 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Trem2Q99NH8 Ccl27a-219ENSMUST00000173865 657 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Trem2Q99NH8 Tnnt2-206ENSMUST00000178854 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Trem2Q99NH8 Tnnt2-211ENSMUST00000189355 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Trem2Q99NH8 Lamtor5-202ENSMUST00000199317 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Trem2Q99NH8 CT009713.7-201ENSMUST00000224689 571 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.2 ms