Protein–RNA interactions for Protein: Q99NF2

Nsmf, NMDA receptor synaptonuclear signaling and neuronal migration factor, mousemouse

Predictions only

Length 532 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NsmfQ99NF2 Amfr-201ENSMUST00000053766 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
NsmfQ99NF2 Pfkfb4-201ENSMUST00000051873 3316 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
NsmfQ99NF2 Zbtb46-202ENSMUST00000087409 2577 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
NsmfQ99NF2 Wdr45-201ENSMUST00000043045 1609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
NsmfQ99NF2 Nek9-201ENSMUST00000040992 5386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
NsmfQ99NF2 Mark3-201ENSMUST00000075281 3321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
NsmfQ99NF2 Elk4-202ENSMUST00000086556 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
NsmfQ99NF2 Gm26752-201ENSMUST00000181086 1537 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
NsmfQ99NF2 Sema6c-214ENSMUST00000202315 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
NsmfQ99NF2 Stk35-202ENSMUST00000166282 5445 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
NsmfQ99NF2 Cidec-202ENSMUST00000113089 1720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
NsmfQ99NF2 Grk6-201ENSMUST00000001115 2994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
NsmfQ99NF2 Gm13418-201ENSMUST00000119097 944 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
NsmfQ99NF2 Gm8349-201ENSMUST00000182720 1003 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
NsmfQ99NF2 Gm18206-201ENSMUST00000207027 926 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
NsmfQ99NF2 1700019N19Rik-201ENSMUST00000028299 970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
NsmfQ99NF2 Gjb3-201ENSMUST00000046532 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
NsmfQ99NF2 Spata6-201ENSMUST00000038868 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
NsmfQ99NF2 Cmtm3-201ENSMUST00000034343 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
NsmfQ99NF2 Gm13446-201ENSMUST00000124555 2033 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
NsmfQ99NF2 Mpped2-202ENSMUST00000111063 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
NsmfQ99NF2 Large1-204ENSMUST00000212459 4746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
NsmfQ99NF2 Ccdc24-201ENSMUST00000106422 1365 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
NsmfQ99NF2 Flot1-209ENSMUST00000174080 1383 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
NsmfQ99NF2 Sfrp1-201ENSMUST00000033952 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
NsmfQ99NF2 Gm27029-201ENSMUST00000107257 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
NsmfQ99NF2 Tmprss5-201ENSMUST00000070390 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
NsmfQ99NF2 Rbck1-202ENSMUST00000109847 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
NsmfQ99NF2 1700008O03Rik-201ENSMUST00000107933 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
NsmfQ99NF2 Mef2b-201ENSMUST00000110140 1223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
NsmfQ99NF2 Mef2b-202ENSMUST00000110141 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
NsmfQ99NF2 Tpt1-201ENSMUST00000110894 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
NsmfQ99NF2 Vti1a-206ENSMUST00000225529 1244 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
NsmfQ99NF2 Eif5a-207ENSMUST00000108610 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
NsmfQ99NF2 Gm32996-201ENSMUST00000199828 1447 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
NsmfQ99NF2 Yipf4-201ENSMUST00000024873 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
NsmfQ99NF2 Plpp7-201ENSMUST00000057423 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
NsmfQ99NF2 Lrrc47-205ENSMUST00000169622 3468 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
NsmfQ99NF2 Slc35e3-201ENSMUST00000079041 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
NsmfQ99NF2 Slain2-201ENSMUST00000143829 4828 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
NsmfQ99NF2 Cmtm4-201ENSMUST00000179802 7734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
NsmfQ99NF2 Tspoap1-202ENSMUST00000100644 7390 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
NsmfQ99NF2 Chst13-201ENSMUST00000070890 1653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.3■□□□□ 0.68
NsmfQ99NF2 4930447C04Rik-202ENSMUST00000110489 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
NsmfQ99NF2 Fip1l1-203ENSMUST00000113535 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
NsmfQ99NF2 2810013P06Rik-201ENSMUST00000186531 2137 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
NsmfQ99NF2 B9d2-201ENSMUST00000108403 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
NsmfQ99NF2 Gm4459-201ENSMUST00000118750 468 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
NsmfQ99NF2 Gm12480-201ENSMUST00000129576 774 ntTSL 3 BASIC19.3■□□□□ 0.68
NsmfQ99NF2 1300002E11Rik-207ENSMUST00000211443 767 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
NsmfQ99NF2 Hbb-bt-201ENSMUST00000098192 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
NsmfQ99NF2 Inip-202ENSMUST00000107526 1438 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
NsmfQ99NF2 Eefsec-201ENSMUST00000165242 2679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
NsmfQ99NF2 Nfe2-208ENSMUST00000149111 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
NsmfQ99NF2 Tox2-201ENSMUST00000099110 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
NsmfQ99NF2 Sec1-201ENSMUST00000040636 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
NsmfQ99NF2 Nsmf-201ENSMUST00000006646 2922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
NsmfQ99NF2 Otud5-202ENSMUST00000115665 3821 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
NsmfQ99NF2 Mir124-2hg-202ENSMUST00000186746 1368 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
NsmfQ99NF2 Coq6-202ENSMUST00000110276 1776 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
NsmfQ99NF2 Olah-203ENSMUST00000194918 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
NsmfQ99NF2 Tubgcp4-203ENSMUST00000110658 4250 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
NsmfQ99NF2 4930528D03Rik-201ENSMUST00000181528 1339 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
NsmfQ99NF2 Klhdc10-201ENSMUST00000068240 3951 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
NsmfQ99NF2 A830018L16Rik-208ENSMUST00000171690 6158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
NsmfQ99NF2 Ptges2-201ENSMUST00000028162 4978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
NsmfQ99NF2 Pbx4-201ENSMUST00000081503 1560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
NsmfQ99NF2 Mcl1-201ENSMUST00000037947 3418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
NsmfQ99NF2 Gm4535-201ENSMUST00000182274 558 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
NsmfQ99NF2 AC148328.1-201ENSMUST00000216448 920 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
NsmfQ99NF2 Rangrf-201ENSMUST00000038644 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
NsmfQ99NF2 Apof-201ENSMUST00000050901 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
NsmfQ99NF2 Chmp2a-201ENSMUST00000005711 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
NsmfQ99NF2 Gm10355-201ENSMUST00000097146 517 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
NsmfQ99NF2 Adnp2-201ENSMUST00000066743 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
NsmfQ99NF2 Dcdc2c-206ENSMUST00000221349 2209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
NsmfQ99NF2 Sgpp1-201ENSMUST00000021450 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
NsmfQ99NF2 Syt3-202ENSMUST00000118962 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
NsmfQ99NF2 Tfap2b-202ENSMUST00000064976 1946 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
NsmfQ99NF2 Il11ra1-204ENSMUST00000108042 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
NsmfQ99NF2 Arpc1a-201ENSMUST00000031625 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
NsmfQ99NF2 Kdm2a-202ENSMUST00000075856 7242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
NsmfQ99NF2 Psip1-201ENSMUST00000030207 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
NsmfQ99NF2 Adamtsl1-201ENSMUST00000048885 1842 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
NsmfQ99NF2 Sertad4-204ENSMUST00000155579 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
NsmfQ99NF2 Hebp2-203ENSMUST00000214548 2083 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
NsmfQ99NF2 Itpkb-201ENSMUST00000070181 6235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
NsmfQ99NF2 Chrm4-201ENSMUST00000045537 1440 ntAPPRIS P1 BASIC19.28■□□□□ 0.68
NsmfQ99NF2 Ankrd17-203ENSMUST00000168058 9311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
NsmfQ99NF2 Gm15690-201ENSMUST00000128728 432 ntTSL 3 BASIC19.28■□□□□ 0.68
NsmfQ99NF2 Gm7616-201ENSMUST00000143112 624 ntTSL 3 BASIC19.28■□□□□ 0.68
NsmfQ99NF2 Gm26756-201ENSMUST00000181689 1294 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
NsmfQ99NF2 Gm27525-201ENSMUST00000184465 107 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
NsmfQ99NF2 Ogfod2-207ENSMUST00000196627 532 ntTSL 3 BASIC19.28■□□□□ 0.68
NsmfQ99NF2 Abhd18-206ENSMUST00000203650 797 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
NsmfQ99NF2 Mtus2-201ENSMUST00000071878 1211 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
NsmfQ99NF2 Ndufs2-202ENSMUST00000111318 1545 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
NsmfQ99NF2 Agpat3-203ENSMUST00000105388 3681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
NsmfQ99NF2 Zbtb22-201ENSMUST00000053429 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
NsmfQ99NF2 Rbm12b2-202ENSMUST00000095143 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.1 ms