Protein–RNA interactions for Protein: Q99LJ7

Rcbtb2, RCC1 and BTB domain-containing protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 551 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rcbtb2Q99LJ7 Jph4-201ENSMUST00000022819 4489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Rcbtb2Q99LJ7 Fhl1-201ENSMUST00000023854 2356 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Rcbtb2Q99LJ7 Spock3-204ENSMUST00000119068 3201 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Rcbtb2Q99LJ7 Tle3-218ENSMUST00000178113 5205 ntTSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Rcbtb2Q99LJ7 Tbx3-202ENSMUST00000079719 4982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Rcbtb2Q99LJ7 Dnajb11-204ENSMUST00000166487 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Rcbtb2Q99LJ7 Fam221a-201ENSMUST00000060561 2730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Rcbtb2Q99LJ7 Tenm3-204ENSMUST00000110346 2267 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Rcbtb2Q99LJ7 Smad1-203ENSMUST00000109885 3775 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Rcbtb2Q99LJ7 Zfp384-208ENSMUST00000112428 3132 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Rcbtb2Q99LJ7 Mccc1-201ENSMUST00000029259 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Rcbtb2Q99LJ7 Pcolce-202ENSMUST00000054564 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Rcbtb2Q99LJ7 Pnkp-202ENSMUST00000098478 1550 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Rcbtb2Q99LJ7 Arhgef10l-201ENSMUST00000039204 4493 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Rcbtb2Q99LJ7 Ogg1-201ENSMUST00000032406 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Rcbtb2Q99LJ7 Ptprs-211ENSMUST00000223859 5588 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
Rcbtb2Q99LJ7 Wdr12-202ENSMUST00000117438 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Rcbtb2Q99LJ7 Sf1-203ENSMUST00000113488 2282 ntTSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Rcbtb2Q99LJ7 Gm26889-201ENSMUST00000181523 2252 ntTSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Rcbtb2Q99LJ7 Nkx2-2-203ENSMUST00000109970 1053 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Rcbtb2Q99LJ7 Ptf1aos-201ENSMUST00000122978 916 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Rcbtb2Q99LJ7 Gm14114-201ENSMUST00000139345 287 ntTSL 3 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Rcbtb2Q99LJ7 Gm16998-201ENSMUST00000181899 1230 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Rcbtb2Q99LJ7 Pdxk-ps-203ENSMUST00000183934 680 ntTSL 3 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Rcbtb2Q99LJ7 Arhgef4-208ENSMUST00000211073 171 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
Rcbtb2Q99LJ7 AL731706.1-201ENSMUST00000227806 944 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Rcbtb2Q99LJ7 Lat-201ENSMUST00000032997 1235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Rcbtb2Q99LJ7 Polr2f-201ENSMUST00000040077 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Rcbtb2Q99LJ7 Olfr1411-201ENSMUST00000073748 972 ntAPPRIS P1 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Rcbtb2Q99LJ7 Hsdl2-201ENSMUST00000030078 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Rcbtb2Q99LJ7 Lcmt2-201ENSMUST00000099486 2047 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Rcbtb2Q99LJ7 Mtg2-202ENSMUST00000108901 1444 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Rcbtb2Q99LJ7 Trim7-202ENSMUST00000109213 2356 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Rcbtb2Q99LJ7 Ipo8-201ENSMUST00000048418 5360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Rcbtb2Q99LJ7 Ssfa2-202ENSMUST00000111785 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Rcbtb2Q99LJ7 AC093043.3-201ENSMUST00000226531 2273 ntBASIC14.97□□□□□ -0.01
Rcbtb2Q99LJ7 Gm16754-201ENSMUST00000181222 2077 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Rcbtb2Q99LJ7 Skap1-203ENSMUST00000100521 1539 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Rcbtb2Q99LJ7 Skap1-204ENSMUST00000103154 1507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Rcbtb2Q99LJ7 Sucla2-203ENSMUST00000160507 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Rcbtb2Q99LJ7 Polr1c-201ENSMUST00000087026 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Rcbtb2Q99LJ7 Irf5-205ENSMUST00000167252 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Rcbtb2Q99LJ7 Mvk-201ENSMUST00000043760 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Rcbtb2Q99LJ7 Pkn2-201ENSMUST00000043812 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Rcbtb2Q99LJ7 Ndufaf3-201ENSMUST00000074208 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Rcbtb2Q99LJ7 Sh2b1-201ENSMUST00000032978 3393 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Rcbtb2Q99LJ7 Phf7-203ENSMUST00000226565 1971 ntBASIC14.97□□□□□ -0.01
Rcbtb2Q99LJ7 Lamtor5-201ENSMUST00000145735 881 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
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Rcbtb2Q99LJ7 Mir5122-201ENSMUST00000175004 89 ntBASIC14.97□□□□□ -0.01
Rcbtb2Q99LJ7 Gm5091-201ENSMUST00000181658 1179 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Rcbtb2Q99LJ7 Tekt1-202ENSMUST00000108502 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Rcbtb2Q99LJ7 Secisbp2-202ENSMUST00000110044 1915 ntTSL 2 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Rcbtb2Q99LJ7 Klhl42-201ENSMUST00000036003 6267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Rcbtb2Q99LJ7 Rps6ka1-201ENSMUST00000003741 3085 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Rcbtb2Q99LJ7 Pqlc1-205ENSMUST00000131780 2080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Rcbtb2Q99LJ7 Hmgb3-202ENSMUST00000072699 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Rcbtb2Q99LJ7 Disc1-206ENSMUST00000118942 2860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Rcbtb2Q99LJ7 Tapt1-201ENSMUST00000055128 3513 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Rcbtb2Q99LJ7 Pde8b-201ENSMUST00000022192 2517 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Rcbtb2Q99LJ7 Malsu1-203ENSMUST00000128616 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
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Rcbtb2Q99LJ7 Eif4h-201ENSMUST00000036125 2367 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
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Rcbtb2Q99LJ7 Ppm1h-206ENSMUST00000161487 2931 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Rcbtb2Q99LJ7 AL672049.1-201ENSMUST00000197943 91 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
Rcbtb2Q99LJ7 2310033P09Rik-201ENSMUST00000020719 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Rcbtb2Q99LJ7 4930554C24Rik-202ENSMUST00000216019 1159 ntTSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Rcbtb2Q99LJ7 Mars-201ENSMUST00000037290 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Rcbtb2Q99LJ7 Purg-201ENSMUST00000070340 1064 ntAPPRIS P1 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Rcbtb2Q99LJ7 Adck1-204ENSMUST00000222695 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Rcbtb2Q99LJ7 Ehmt2-202ENSMUST00000078061 3746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Rcbtb2Q99LJ7 Anks1b-219ENSMUST00000182600 1697 ntTSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Rcbtb2Q99LJ7 Slc25a39-201ENSMUST00000018821 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Rcbtb2Q99LJ7 Hnrnpll-201ENSMUST00000061331 3116 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.02
Rcbtb2Q99LJ7 Gm40773-201ENSMUST00000218113 1502 ntTSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.02
Rcbtb2Q99LJ7 Cldn6-201ENSMUST00000024699 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
Rcbtb2Q99LJ7 Cfap20-208ENSMUST00000213086 2544 ntTSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.02
Rcbtb2Q99LJ7 Senp7-211ENSMUST00000202000 3218 ntTSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.02
Rcbtb2Q99LJ7 Ankra2-201ENSMUST00000022164 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
Rcbtb2Q99LJ7 Slc25a20-201ENSMUST00000035222 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
Rcbtb2Q99LJ7 Wdr55-201ENSMUST00000049323 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Rcbtb2Q99LJ7 Nepro-201ENSMUST00000048788 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Rcbtb2Q99LJ7 Anks6-201ENSMUST00000084616 3552 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Rcbtb2Q99LJ7 Ripk1-201ENSMUST00000021844 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Rcbtb2Q99LJ7 Mapk14-201ENSMUST00000004990 3547 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Rcbtb2Q99LJ7 Mapk14-202ENSMUST00000062694 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Rcbtb2Q99LJ7 Pdcl3-201ENSMUST00000027247 3914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Rcbtb2Q99LJ7 Pi4k2a-201ENSMUST00000066778 3771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Rcbtb2Q99LJ7 Zfp264-201ENSMUST00000208656 1563 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
Rcbtb2Q99LJ7 Cux2-201ENSMUST00000086317 5113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Rcbtb2Q99LJ7 Ddx50-201ENSMUST00000020270 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Rcbtb2Q99LJ7 Tgfb1i1-205ENSMUST00000165667 1812 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
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