Protein–RNA interactions for Protein: Q99LF4

Rtcb, tRNA-splicing ligase RtcB homolog, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 505 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RtcbQ99LF4 Lypd1-201ENSMUST00000027582 1447 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
RtcbQ99LF4 Ism1-202ENSMUST00000184404 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
RtcbQ99LF4 Camkk2-211ENSMUST00000200109 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
RtcbQ99LF4 Runx1t1-201ENSMUST00000006761 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
RtcbQ99LF4 Cd82-205ENSMUST00000116457 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
RtcbQ99LF4 Camsap3-206ENSMUST00000207533 2584 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
RtcbQ99LF4 Tubb4b-201ENSMUST00000043584 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
RtcbQ99LF4 Ppp2r1b-206ENSMUST00000175645 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
RtcbQ99LF4 Mprip-203ENSMUST00000108751 4021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
RtcbQ99LF4 Dhdds-203ENSMUST00000105886 1015 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
RtcbQ99LF4 Gm27244-201ENSMUST00000184260 380 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
RtcbQ99LF4 Syce1l-204ENSMUST00000212269 753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
RtcbQ99LF4 AC159295.1-201ENSMUST00000225326 940 ntBASIC20■□□□□ 0.79
RtcbQ99LF4 Emg1-201ENSMUST00000004379 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
RtcbQ99LF4 Gm8396-201ENSMUST00000057361 823 ntBASIC20■□□□□ 0.79
RtcbQ99LF4 Hoxb5-201ENSMUST00000049272 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
RtcbQ99LF4 Igfbp1-201ENSMUST00000020704 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
RtcbQ99LF4 Hspa1l-201ENSMUST00000007248 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
RtcbQ99LF4 Gpr150-201ENSMUST00000056130 2146 ntAPPRIS P1 BASIC20■□□□□ 0.79
RtcbQ99LF4 Dcaf8-206ENSMUST00000192704 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
RtcbQ99LF4 Tom1l2-201ENSMUST00000064019 2151 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
RtcbQ99LF4 Prnp-201ENSMUST00000091288 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
RtcbQ99LF4 Ankra2-203ENSMUST00000123924 2328 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
RtcbQ99LF4 Zbtb8a-201ENSMUST00000030610 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
RtcbQ99LF4 Larp1-201ENSMUST00000071487 6614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
RtcbQ99LF4 Ino80e-203ENSMUST00000106343 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
RtcbQ99LF4 Zxdc-203ENSMUST00000113539 4864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
RtcbQ99LF4 Krt12-201ENSMUST00000017741 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
RtcbQ99LF4 Meig1-204ENSMUST00000115083 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
RtcbQ99LF4 Psmb5-ps-201ENSMUST00000119744 798 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
RtcbQ99LF4 Gm28050-201ENSMUST00000124394 449 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
RtcbQ99LF4 Gm16151-201ENSMUST00000129696 639 ntTSL 3 BASIC19.99■□□□□ 0.79
RtcbQ99LF4 Fam241b-208ENSMUST00000142796 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
RtcbQ99LF4 BC022687-202ENSMUST00000177808 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
RtcbQ99LF4 Gm34397-203ENSMUST00000214991 630 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
RtcbQ99LF4 4930428E07Rik-201ENSMUST00000222132 920 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
RtcbQ99LF4 Lce1b-201ENSMUST00000029531 647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
RtcbQ99LF4 Gdpd3-201ENSMUST00000032944 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
RtcbQ99LF4 Sfxn5-202ENSMUST00000059034 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
RtcbQ99LF4 Ndufs8-201ENSMUST00000075092 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
RtcbQ99LF4 Rassf8-203ENSMUST00000111704 5446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
RtcbQ99LF4 Blmh-201ENSMUST00000021197 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
RtcbQ99LF4 Kcnd3-202ENSMUST00000098761 7169 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
RtcbQ99LF4 Iqcd-201ENSMUST00000069259 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
RtcbQ99LF4 Sbf1-201ENSMUST00000123791 6190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
RtcbQ99LF4 Cidec-202ENSMUST00000113089 1720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
RtcbQ99LF4 Atg7-215ENSMUST00000183165 2012 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
RtcbQ99LF4 Stradb-201ENSMUST00000027185 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
RtcbQ99LF4 Timm44-201ENSMUST00000003029 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
RtcbQ99LF4 Tmem97-201ENSMUST00000103242 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
RtcbQ99LF4 Ccdc106-204ENSMUST00000207974 2492 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
RtcbQ99LF4 Gjb1-202ENSMUST00000119080 1513 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.98■□□□□ 0.79
RtcbQ99LF4 Tmem62-201ENSMUST00000067582 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
RtcbQ99LF4 Gm16183-201ENSMUST00000127527 1193 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
RtcbQ99LF4 Thap4-205ENSMUST00000189728 713 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
RtcbQ99LF4 AC159114.1-201ENSMUST00000220349 266 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
RtcbQ99LF4 AC124549.3-201ENSMUST00000225541 367 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
RtcbQ99LF4 Mt3-201ENSMUST00000034211 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
RtcbQ99LF4 Tspo-201ENSMUST00000047419 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
RtcbQ99LF4 Lhfp-201ENSMUST00000059562 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
RtcbQ99LF4 Gm8784-201ENSMUST00000222096 1435 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
RtcbQ99LF4 Spsb4-201ENSMUST00000055433 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
RtcbQ99LF4 Mroh5-201ENSMUST00000071419 2766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
RtcbQ99LF4 Sfxn4-203ENSMUST00000135808 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
RtcbQ99LF4 Ppm1a-201ENSMUST00000021514 7668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
RtcbQ99LF4 Atp5b-201ENSMUST00000026459 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
RtcbQ99LF4 Cacul1-201ENSMUST00000081790 5790 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
RtcbQ99LF4 Rfx7-201ENSMUST00000093820 7988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
RtcbQ99LF4 B4galt5-201ENSMUST00000109221 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
RtcbQ99LF4 Nr1h2-203ENSMUST00000107911 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
RtcbQ99LF4 Epc2-201ENSMUST00000092123 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
RtcbQ99LF4 Irak1-205ENSMUST00000114353 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
RtcbQ99LF4 Chst1-201ENSMUST00000065797 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
RtcbQ99LF4 Raet1e-204ENSMUST00000181645 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
RtcbQ99LF4 Arl5c-201ENSMUST00000042971 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
RtcbQ99LF4 Drd2-201ENSMUST00000075764 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
RtcbQ99LF4 Tmem253-201ENSMUST00000100638 1234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
RtcbQ99LF4 Ern1-202ENSMUST00000106799 660 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
RtcbQ99LF4 Lrrc3c-201ENSMUST00000142268 902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.97■□□□□ 0.79
RtcbQ99LF4 Gm15635-203ENSMUST00000148972 554 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
RtcbQ99LF4 2010010A06Rik-203ENSMUST00000190465 650 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
RtcbQ99LF4 Tomm20l-201ENSMUST00000021482 578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
RtcbQ99LF4 Tfap2a-208ENSMUST00000224999 2058 ntAPPRIS ALT1 BASIC19.97■□□□□ 0.79
RtcbQ99LF4 Gm26798-201ENSMUST00000181384 2837 ntTSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
RtcbQ99LF4 Sytl1-202ENSMUST00000105908 1730 ntTSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
RtcbQ99LF4 Scrib-203ENSMUST00000109946 5545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
RtcbQ99LF4 1600014C10Rik-207ENSMUST00000179503 784 ntTSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
RtcbQ99LF4 4833418N02Rik-202ENSMUST00000146560 1495 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
RtcbQ99LF4 Ccdc30-201ENSMUST00000044781 1464 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
RtcbQ99LF4 Cdc27-202ENSMUST00000106961 1863 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
RtcbQ99LF4 Zfp648-201ENSMUST00000086195 1892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.96■□□□□ 0.79
RtcbQ99LF4 Gstm4-201ENSMUST00000029489 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
RtcbQ99LF4 Chaf1b-201ENSMUST00000023666 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
RtcbQ99LF4 Abhd16a-201ENSMUST00000007251 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
RtcbQ99LF4 Kcns1-201ENSMUST00000045196 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
RtcbQ99LF4 Ocel1-203ENSMUST00000110052 5285 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
RtcbQ99LF4 Ankrd16-201ENSMUST00000056108 1618 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
RtcbQ99LF4 Casp9-201ENSMUST00000030747 3897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
RtcbQ99LF4 Agfg2-202ENSMUST00000100544 2858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
RtcbQ99LF4 2610035D17Rik-201ENSMUST00000127263 1861 ntTSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.7 ms