Protein–RNA interactions for Protein: Q99L28

Rsl24d1, Probable ribosome biogenesis protein RLP24, mousemouse

Predictions only

Length 163 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rsl24d1Q99L28 Cfl1-201ENSMUST00000116560 1148 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rsl24d1Q99L28 Nt5c-201ENSMUST00000021082 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rsl24d1Q99L28 Rtn4rl2-201ENSMUST00000054514 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rsl24d1Q99L28 D930007J09Rik-201ENSMUST00000057911 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rsl24d1Q99L28 D430001F17Rik-201ENSMUST00000141344 1858 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rsl24d1Q99L28 Clcn2-201ENSMUST00000007207 3128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rsl24d1Q99L28 Pygo2-201ENSMUST00000060061 3198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rsl24d1Q99L28 Arhgef9-219ENSMUST00000199920 1976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rsl24d1Q99L28 Cep170b-211ENSMUST00000222711 6566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rsl24d1Q99L28 Dzip3-201ENSMUST00000114516 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rsl24d1Q99L28 Btbd3-202ENSMUST00000091556 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Rsl24d1Q99L28 Eif1a-202ENSMUST00000168382 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Rsl24d1Q99L28 Unc5d-202ENSMUST00000209401 3081 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Rsl24d1Q99L28 Unc5d-203ENSMUST00000210298 3060 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Rsl24d1Q99L28 Unc5d-205ENSMUST00000211448 3087 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Rsl24d1Q99L28 Gm45605-201ENSMUST00000210265 4269 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Rsl24d1Q99L28 Mast3-201ENSMUST00000166004 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Rsl24d1Q99L28 Crb2-201ENSMUST00000050372 6372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Rsl24d1Q99L28 Ppp1r3d-201ENSMUST00000058678 3267 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
Rsl24d1Q99L28 Asb2-204ENSMUST00000149431 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Rsl24d1Q99L28 Nkain2-203ENSMUST00000191234 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Rsl24d1Q99L28 Hmga1-205ENSMUST00000118599 529 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
Rsl24d1Q99L28 Gm13441-201ENSMUST00000140104 1168 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Rsl24d1Q99L28 Pianp-204ENSMUST00000160704 1116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Rsl24d1Q99L28 Rian-206ENSMUST00000182119 329 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
Rsl24d1Q99L28 Nabp2-201ENSMUST00000026439 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Rsl24d1Q99L28 Fgfr1op2-203ENSMUST00000067404 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Rsl24d1Q99L28 Gnas-211ENSMUST00000109096 2465 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Rsl24d1Q99L28 Slc4a1ap-206ENSMUST00000201858 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Rsl24d1Q99L28 Cacna2d3-201ENSMUST00000022567 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Rsl24d1Q99L28 Nupl2-201ENSMUST00000049887 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Rsl24d1Q99L28 Pptc7-202ENSMUST00000119015 2233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Rsl24d1Q99L28 Usp35-201ENSMUST00000139582 4262 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Rsl24d1Q99L28 Edem3-202ENSMUST00000187951 3115 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Rsl24d1Q99L28 Men1-204ENSMUST00000113500 2742 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Rsl24d1Q99L28 Pcdha7-201ENSMUST00000192631 5337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rsl24d1Q99L28 Ambra1-205ENSMUST00000111317 4929 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Rsl24d1Q99L28 Tomm70a-201ENSMUST00000166897 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rsl24d1Q99L28 G2e3-202ENSMUST00000119211 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rsl24d1Q99L28 Rnf114-202ENSMUST00000109214 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rsl24d1Q99L28 Ddi2-201ENSMUST00000102484 9553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rsl24d1Q99L28 Safb-201ENSMUST00000095224 3106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Rsl24d1Q99L28 Med14-202ENSMUST00000096495 6963 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Rsl24d1Q99L28 Spock1-203ENSMUST00000185905 2794 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rsl24d1Q99L28 Aldh2-202ENSMUST00000129753 1799 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rsl24d1Q99L28 Rgs20-201ENSMUST00000002533 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rsl24d1Q99L28 Gm29394-204ENSMUST00000177504 448 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
Rsl24d1Q99L28 Rpl18a-206ENSMUST00000212709 700 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Rsl24d1Q99L28 AC140930.3-201ENSMUST00000222935 274 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Rsl24d1Q99L28 H2-Ke6-201ENSMUST00000045467 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rsl24d1Q99L28 Prickle1-201ENSMUST00000048982 4085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rsl24d1Q99L28 Zfp12-201ENSMUST00000032591 5265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rsl24d1Q99L28 Tns1-222ENSMUST00000212888 5643 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Rsl24d1Q99L28 Nfs1-201ENSMUST00000029147 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rsl24d1Q99L28 Npnt-206ENSMUST00000117811 4532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Rsl24d1Q99L28 Plekha4-207ENSMUST00000211227 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rsl24d1Q99L28 Shox2-202ENSMUST00000162060 1537 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
Rsl24d1Q99L28 Intu-201ENSMUST00000061590 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Rsl24d1Q99L28 Slc46a3-202ENSMUST00000118527 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rsl24d1Q99L28 Fam124a-201ENSMUST00000039064 3558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Rsl24d1Q99L28 Mrpl9-202ENSMUST00000196143 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Rsl24d1Q99L28 Miip-206ENSMUST00000172710 1769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Rsl24d1Q99L28 Hand1-203ENSMUST00000160392 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Rsl24d1Q99L28 Micall2-201ENSMUST00000044642 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Rsl24d1Q99L28 Plpp7-201ENSMUST00000057423 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Rsl24d1Q99L28 Txnrd1-206ENSMUST00000219442 3531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Rsl24d1Q99L28 Matn1-201ENSMUST00000102576 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Rsl24d1Q99L28 Gm26578-201ENSMUST00000181702 4611 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Rsl24d1Q99L28 Sema3b-204ENSMUST00000102531 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Rsl24d1Q99L28 Igfbp7-202ENSMUST00000163898 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Rsl24d1Q99L28 Stard6-203ENSMUST00000168249 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Rsl24d1Q99L28 E130116L18Rik-201ENSMUST00000066954 306 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
Rsl24d1Q99L28 Adarb1-202ENSMUST00000098374 6584 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Rsl24d1Q99L28 Lhx3-201ENSMUST00000028302 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Rsl24d1Q99L28 Aifm1-201ENSMUST00000037349 2237 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Rsl24d1Q99L28 Smox-204ENSMUST00000110181 2299 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Rsl24d1Q99L28 Atp5d-203ENSMUST00000105367 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Rsl24d1Q99L28 Gm26674-201ENSMUST00000180770 1446 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Rsl24d1Q99L28 Prss54-201ENSMUST00000052690 1438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Rsl24d1Q99L28 Ablim2-205ENSMUST00000114205 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Rsl24d1Q99L28 Ttc22-201ENSMUST00000047922 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Rsl24d1Q99L28 Tradd-201ENSMUST00000034359 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Rsl24d1Q99L28 Eva1c-201ENSMUST00000037539 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Rsl24d1Q99L28 Dusp15-203ENSMUST00000123121 2993 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
Rsl24d1Q99L28 Slc22a15-207ENSMUST00000190824 3010 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Rsl24d1Q99L28 Lurap1l-201ENSMUST00000055922 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Rsl24d1Q99L28 Anks1-203ENSMUST00000114842 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Rsl24d1Q99L28 Keap1-201ENSMUST00000049567 3172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Rsl24d1Q99L28 Tulp3-201ENSMUST00000001562 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Rsl24d1Q99L28 Klf15-204ENSMUST00000203607 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Rsl24d1Q99L28 Rspo4-201ENSMUST00000042217 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Rsl24d1Q99L28 R74862-202ENSMUST00000133630 2482 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Rsl24d1Q99L28 Synm-204ENSMUST00000208231 4457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Rsl24d1Q99L28 Klhl26-202ENSMUST00000166976 2734 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
Rsl24d1Q99L28 Tango6-202ENSMUST00000211979 2722 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Rsl24d1Q99L28 Pspc1-202ENSMUST00000163924 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Rsl24d1Q99L28 Ss18-203ENSMUST00000092041 2997 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Rsl24d1Q99L28 Patz1-201ENSMUST00000057089 3118 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Rsl24d1Q99L28 Ube2j1-202ENSMUST00000124992 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Rsl24d1Q99L28 Nfat5-203ENSMUST00000125721 5899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.2 ms