Protein–RNA interactions for Protein: Q99KU0

Vmp1, Vacuole membrane protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 406 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vmp1Q99KU0 Alx4-201ENSMUST00000042078 5253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Vmp1Q99KU0 Gm17509-201ENSMUST00000165680 2375 ntAPPRIS P1 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Vmp1Q99KU0 Cnbd2-201ENSMUST00000037096 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Vmp1Q99KU0 Fam149b-216ENSMUST00000225942 2151 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Vmp1Q99KU0 March3-202ENSMUST00000102912 1754 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Vmp1Q99KU0 Emc8-201ENSMUST00000034277 4942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Vmp1Q99KU0 Gm15582-201ENSMUST00000132849 1581 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Vmp1Q99KU0 AA467197-202ENSMUST00000110512 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Vmp1Q99KU0 Sap18-203ENSMUST00000111269 459 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Vmp1Q99KU0 Gpha2-202ENSMUST00000113526 762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Vmp1Q99KU0 Arrdc4-202ENSMUST00000118110 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Vmp1Q99KU0 4930526A20Rik-201ENSMUST00000134228 941 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
Vmp1Q99KU0 Gm27389-201ENSMUST00000183622 195 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
Vmp1Q99KU0 Mrpl28-201ENSMUST00000025014 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Vmp1Q99KU0 Gpha2-201ENSMUST00000025698 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Vmp1Q99KU0 Hectd3-201ENSMUST00000050067 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Vmp1Q99KU0 Csk-201ENSMUST00000034863 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Vmp1Q99KU0 Atp8b2-210ENSMUST00000168276 4265 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Vmp1Q99KU0 Golim4-201ENSMUST00000038563 5546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Vmp1Q99KU0 Zfp995-205ENSMUST00000190066 2221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Vmp1Q99KU0 Cacna1g-201ENSMUST00000021234 8139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Vmp1Q99KU0 Kcnt1-213ENSMUST00000198204 4714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Vmp1Q99KU0 Car9-201ENSMUST00000030183 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Vmp1Q99KU0 Stam2-202ENSMUST00000127316 1928 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Vmp1Q99KU0 Abhd16a-201ENSMUST00000007251 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Vmp1Q99KU0 Lrrfip2-207ENSMUST00000197256 1819 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Vmp1Q99KU0 Rubcn-201ENSMUST00000040986 5257 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Vmp1Q99KU0 Esrp1-202ENSMUST00000108310 2781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Vmp1Q99KU0 Dbndd2-201ENSMUST00000017878 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Vmp1Q99KU0 Kirrel-202ENSMUST00000107618 7278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Vmp1Q99KU0 Smim3-201ENSMUST00000042710 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Vmp1Q99KU0 Rarg-202ENSMUST00000063339 2718 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Vmp1Q99KU0 Taf5-201ENSMUST00000026027 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Vmp1Q99KU0 Cct6b-201ENSMUST00000021040 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Vmp1Q99KU0 Prkag2-203ENSMUST00000114975 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Vmp1Q99KU0 Malt1-201ENSMUST00000049248 5073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Vmp1Q99KU0 Gm26755-201ENSMUST00000180703 2657 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Vmp1Q99KU0 Mid1ip1-202ENSMUST00000115524 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Vmp1Q99KU0 Adnp2-201ENSMUST00000066743 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Vmp1Q99KU0 Bola2-203ENSMUST00000130498 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Vmp1Q99KU0 Lamtor5-201ENSMUST00000145735 881 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Vmp1Q99KU0 Bcl7c-205ENSMUST00000205977 891 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Vmp1Q99KU0 Efcab11-207ENSMUST00000223114 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Vmp1Q99KU0 Tmem270-201ENSMUST00000047305 932 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Vmp1Q99KU0 Fam92a-201ENSMUST00000087052 1292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Vmp1Q99KU0 Zbtb2-201ENSMUST00000100077 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Vmp1Q99KU0 Mff-212ENSMUST00000162003 2087 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Vmp1Q99KU0 Scin-201ENSMUST00000002640 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Vmp1Q99KU0 Kctd8-201ENSMUST00000054095 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Vmp1Q99KU0 Rasgef1b-205ENSMUST00000161148 2430 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Vmp1Q99KU0 Adamts2-201ENSMUST00000040523 7266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Vmp1Q99KU0 Ankrd23-201ENSMUST00000054665 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Vmp1Q99KU0 Nrsn1-204ENSMUST00000167305 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Vmp1Q99KU0 Adamts14-201ENSMUST00000092486 5188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Vmp1Q99KU0 Pex11a-201ENSMUST00000032761 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Vmp1Q99KU0 Dtx2-201ENSMUST00000005072 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Vmp1Q99KU0 Grm4-201ENSMUST00000118161 4537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Vmp1Q99KU0 Nagk-203ENSMUST00000113851 1323 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Vmp1Q99KU0 Hmg20b-213ENSMUST00000167481 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Vmp1Q99KU0 Disc1-208ENSMUST00000122389 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Vmp1Q99KU0 Gm20460-201ENSMUST00000168709 1572 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Vmp1Q99KU0 Fxyd3-205ENSMUST00000167369 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Vmp1Q99KU0 Taf6l-212ENSMUST00000177216 2167 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Vmp1Q99KU0 Tnfrsf1a-201ENSMUST00000032491 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Vmp1Q99KU0 Slc13a3-202ENSMUST00000109279 3131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Vmp1Q99KU0 Casp6-201ENSMUST00000029626 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Vmp1Q99KU0 Tmem87b-201ENSMUST00000110325 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Vmp1Q99KU0 Sgta-201ENSMUST00000005067 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Vmp1Q99KU0 Fam171a1-203ENSMUST00000091505 3449 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Vmp1Q99KU0 Fancm-201ENSMUST00000058889 7775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Vmp1Q99KU0 2210016F16Rik-201ENSMUST00000022032 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Vmp1Q99KU0 Ctage5-213ENSMUST00000176464 4434 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Vmp1Q99KU0 Tlcd2-202ENSMUST00000108435 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Vmp1Q99KU0 Gtf3a-204ENSMUST00000146511 1298 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Vmp1Q99KU0 Gm6659-201ENSMUST00000174752 547 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
Vmp1Q99KU0 Pcyox1-206ENSMUST00000204116 546 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Vmp1Q99KU0 Ttc32-203ENSMUST00000219488 768 ntTSL 3 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Vmp1Q99KU0 Tmem205-201ENSMUST00000046831 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Vmp1Q99KU0 Olfr315-201ENSMUST00000081533 998 ntAPPRIS P1 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Vmp1Q99KU0 Acap3-201ENSMUST00000079031 4301 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Vmp1Q99KU0 Zbtb7c-201ENSMUST00000058997 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Vmp1Q99KU0 Kctd15-203ENSMUST00000108070 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Vmp1Q99KU0 Zfp277-202ENSMUST00000069692 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Vmp1Q99KU0 Lca5l-202ENSMUST00000113804 3162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Vmp1Q99KU0 2810410L24Rik-202ENSMUST00000155681 2615 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Vmp1Q99KU0 Gramd3-201ENSMUST00000070166 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Vmp1Q99KU0 AC154855.1-201ENSMUST00000227353 1458 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
Vmp1Q99KU0 Acads-201ENSMUST00000031524 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Vmp1Q99KU0 Abhd5-204ENSMUST00000156520 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Vmp1Q99KU0 Camsap3-201ENSMUST00000057028 4450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Vmp1Q99KU0 Rnpep-202ENSMUST00000077340 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Vmp1Q99KU0 Mdm1-204ENSMUST00000169817 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Vmp1Q99KU0 Ndufv3-201ENSMUST00000046288 1537 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Vmp1Q99KU0 Osbpl1a-205ENSMUST00000119512 1947 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Vmp1Q99KU0 Tnfrsf13c-201ENSMUST00000089161 1906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Vmp1Q99KU0 Cacnb4-201ENSMUST00000078324 8225 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Vmp1Q99KU0 Atp5g1-202ENSMUST00000107684 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Vmp1Q99KU0 Echdc2-203ENSMUST00000116307 893 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Vmp1Q99KU0 Spsb2-202ENSMUST00000052727 1219 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Vmp1Q99KU0 Olfr317-201ENSMUST00000075607 1128 ntAPPRIS P1 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.1 ms