Protein–RNA interactions for Protein: Q99KR6

Rnf34, E3 ubiquitin-protein ligase RNF34, mousemouse

Predictions only

Length 376 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf34Q99KR6 Btbd3-202ENSMUST00000091556 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Rnf34Q99KR6 Espn-204ENSMUST00000080042 1402 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Rnf34Q99KR6 Dlk2-202ENSMUST00000166280 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Rnf34Q99KR6 Fubp3-202ENSMUST00000113482 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Rnf34Q99KR6 Cog8-201ENSMUST00000034391 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Rnf34Q99KR6 Gm26821-201ENSMUST00000181954 2652 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Rnf34Q99KR6 Dennd1a-201ENSMUST00000102787 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Rnf34Q99KR6 Tsc22d2-201ENSMUST00000099090 9799 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Rnf34Q99KR6 Taz-201ENSMUST00000069722 1851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Rnf34Q99KR6 Bend6-204ENSMUST00000129464 1750 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Rnf34Q99KR6 Nucb2-201ENSMUST00000032895 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Rnf34Q99KR6 Bicdl1-204ENSMUST00000121746 1568 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Rnf34Q99KR6 Dnajb11-204ENSMUST00000166487 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Rnf34Q99KR6 Ttll11-202ENSMUST00000112976 3077 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Rnf34Q99KR6 Icam2-201ENSMUST00000001055 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Rnf34Q99KR6 Zfp467-208ENSMUST00000114564 626 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Rnf34Q99KR6 Gm17182-201ENSMUST00000163795 860 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Rnf34Q99KR6 Zfas1-205ENSMUST00000189909 738 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Rnf34Q99KR6 Gm17949-201ENSMUST00000210548 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Rnf34Q99KR6 Timm23-208ENSMUST00000226683 750 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
Rnf34Q99KR6 Gm10273-201ENSMUST00000092511 1126 ntAPPRIS P1 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Rnf34Q99KR6 Olfr1232-201ENSMUST00000099785 936 ntAPPRIS P1 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Rnf34Q99KR6 Bpifb3-201ENSMUST00000088950 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Rnf34Q99KR6 Ankrd10-201ENSMUST00000033905 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Rnf34Q99KR6 Zmynd11-207ENSMUST00000110638 4003 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Rnf34Q99KR6 Trmo-201ENSMUST00000030015 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Rnf34Q99KR6 Faf1-201ENSMUST00000102724 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Rnf34Q99KR6 Zfp451-201ENSMUST00000019861 3958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
Rnf34Q99KR6 Epor-201ENSMUST00000006397 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Rnf34Q99KR6 Kif21a-201ENSMUST00000067205 6307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Rnf34Q99KR6 Tnfaip2-201ENSMUST00000102745 3762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Rnf34Q99KR6 Crb2-201ENSMUST00000050372 6372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Rnf34Q99KR6 Npffr1-201ENSMUST00000020287 3479 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Rnf34Q99KR6 Gata5-201ENSMUST00000015771 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Rnf34Q99KR6 Med15-202ENSMUST00000080936 3263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Rnf34Q99KR6 Npnt-206ENSMUST00000117811 4532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Rnf34Q99KR6 Gfra2-202ENSMUST00000227633 1480 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
Rnf34Q99KR6 Rcbtb1-201ENSMUST00000022551 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Rnf34Q99KR6 Gaa-202ENSMUST00000106258 1369 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Rnf34Q99KR6 Ccdc107-202ENSMUST00000107922 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Rnf34Q99KR6 Zfp467-209ENSMUST00000114566 543 ntTSL 3 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Rnf34Q99KR6 Pigf-201ENSMUST00000024957 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Rnf34Q99KR6 Ccdc107-201ENSMUST00000030181 817 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Rnf34Q99KR6 Crem-228ENSMUST00000150235 2662 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Rnf34Q99KR6 Fam185a-201ENSMUST00000056045 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Rnf34Q99KR6 Gpsm1-202ENSMUST00000066936 3384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Rnf34Q99KR6 Rbm26-202ENSMUST00000100327 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Rnf34Q99KR6 Nkpd1-202ENSMUST00000207576 2916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Rnf34Q99KR6 Galnt18-201ENSMUST00000049430 2575 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Rnf34Q99KR6 Papd5-202ENSMUST00000118952 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Rnf34Q99KR6 Hspa1b-201ENSMUST00000172753 2803 ntAPPRIS P1 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Rnf34Q99KR6 Slc12a5-207ENSMUST00000202223 5690 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Rnf34Q99KR6 Nell1-201ENSMUST00000081872 6617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Rnf34Q99KR6 Gm26889-201ENSMUST00000181523 2252 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Rnf34Q99KR6 Nipal2-201ENSMUST00000040791 4331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Rnf34Q99KR6 Bptf-201ENSMUST00000057892 11488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Rnf34Q99KR6 Gpc5-202ENSMUST00000175665 2187 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Rnf34Q99KR6 Zpbp2-203ENSMUST00000107509 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Rnf34Q99KR6 Tchh-201ENSMUST00000064257 5823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Rnf34Q99KR6 Tmem201-201ENSMUST00000054459 4631 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Rnf34Q99KR6 Rnf170-209ENSMUST00000209300 1881 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Rnf34Q99KR6 Pde4b-208ENSMUST00000106911 3020 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Rnf34Q99KR6 H2-Q4-201ENSMUST00000081435 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Rnf34Q99KR6 Smim1-212ENSMUST00000146543 839 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Rnf34Q99KR6 Steap1-201ENSMUST00000015796 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Rnf34Q99KR6 Anapc13-203ENSMUST00000188398 727 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Rnf34Q99KR6 D130020L05Rik-202ENSMUST00000220889 769 ntTSL 3 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Rnf34Q99KR6 AC124601.2-201ENSMUST00000222888 759 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Rnf34Q99KR6 AC156016.1-201ENSMUST00000227190 1035 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
Rnf34Q99KR6 A930018P22Rik-201ENSMUST00000040374 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Rnf34Q99KR6 Ptch1-201ENSMUST00000021921 7725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Rnf34Q99KR6 Rsrc1-205ENSMUST00000161726 3213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Rnf34Q99KR6 Cdh11-201ENSMUST00000075190 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Rnf34Q99KR6 Cpeb2-205ENSMUST00000169035 7050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Rnf34Q99KR6 Gm19430-201ENSMUST00000193847 2137 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
Rnf34Q99KR6 Zbtb16-202ENSMUST00000216150 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Rnf34Q99KR6 Krt90-201ENSMUST00000023714 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Rnf34Q99KR6 Zc3h13-203ENSMUST00000227049 6144 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Rnf34Q99KR6 Rprd1a-201ENSMUST00000046206 4297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Rnf34Q99KR6 Pum2-202ENSMUST00000111122 6311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Rnf34Q99KR6 Lactbl1-201ENSMUST00000178843 2954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Rnf34Q99KR6 Gm45736-201ENSMUST00000210592 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Rnf34Q99KR6 Agbl3-205ENSMUST00000115017 3719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Rnf34Q99KR6 Tax1bp3-201ENSMUST00000040687 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Rnf34Q99KR6 Fnbp1-208ENSMUST00000113560 4726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Rnf34Q99KR6 Fam83g-202ENSMUST00000093019 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Rnf34Q99KR6 Sarnp-201ENSMUST00000105230 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Rnf34Q99KR6 Rbm39-202ENSMUST00000109584 667 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Rnf34Q99KR6 Gm13181-201ENSMUST00000120117 1069 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
Rnf34Q99KR6 Impa1-204ENSMUST00000191670 1100 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Rnf34Q99KR6 Med29-201ENSMUST00000003536 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Rnf34Q99KR6 Ube2e1-201ENSMUST00000022296 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Rnf34Q99KR6 Serinc2-203ENSMUST00000122374 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Rnf34Q99KR6 Wnt8b-201ENSMUST00000041163 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Rnf34Q99KR6 Kazn-201ENSMUST00000036476 3843 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Rnf34Q99KR6 AC154855.1-201ENSMUST00000227353 1458 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
Rnf34Q99KR6 Prkag2-203ENSMUST00000114975 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Rnf34Q99KR6 Fhl1-201ENSMUST00000023854 2356 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Rnf34Q99KR6 Llgl1-201ENSMUST00000052346 4303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Rnf34Q99KR6 Tor1aip2-205ENSMUST00000111757 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.7 ms