Protein–RNA interactions for Protein: Q99JW4

Lims1, LIM and senescent cell antigen-like-containing domain protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 325 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lims1Q99JW4 Rundc3b-201ENSMUST00000047485 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Lims1Q99JW4 Rdx-202ENSMUST00000061352 1502 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Lims1Q99JW4 Rnf14-203ENSMUST00000171461 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Lims1Q99JW4 Npnt-202ENSMUST00000042744 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Lims1Q99JW4 Podn-203ENSMUST00000106709 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Lims1Q99JW4 Gm1673-203ENSMUST00000114383 511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Lims1Q99JW4 4930526A20Rik-201ENSMUST00000134228 941 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
Lims1Q99JW4 Tpsg1-202ENSMUST00000160377 1040 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Lims1Q99JW4 Sct-202ENSMUST00000167790 507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Lims1Q99JW4 Gm19426-201ENSMUST00000181711 726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Lims1Q99JW4 5430416N02Rik-202ENSMUST00000181873 626 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Lims1Q99JW4 Sct-201ENSMUST00000046156 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Lims1Q99JW4 Mau2-204ENSMUST00000212308 2887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Lims1Q99JW4 Chrna2-202ENSMUST00000206455 1933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Lims1Q99JW4 B230217O12Rik-201ENSMUST00000181921 1642 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Lims1Q99JW4 Zic1-201ENSMUST00000034927 5606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Lims1Q99JW4 Trappc3-201ENSMUST00000030660 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Lims1Q99JW4 Map3k7cl-201ENSMUST00000026700 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Lims1Q99JW4 Fbrsl1-202ENSMUST00000069483 4720 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Lims1Q99JW4 Tssc4-206ENSMUST00000177841 1364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Lims1Q99JW4 Nploc4-201ENSMUST00000044271 4121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Lims1Q99JW4 Gm26904-201ENSMUST00000181301 1742 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Lims1Q99JW4 Hsf4-201ENSMUST00000036127 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Lims1Q99JW4 E030042O20Rik-201ENSMUST00000135244 1427 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Lims1Q99JW4 Golph3-201ENSMUST00000059680 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Lims1Q99JW4 Fbxo17-203ENSMUST00000108279 1563 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Lims1Q99JW4 Cfap97-202ENSMUST00000110376 2043 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Lims1Q99JW4 Rnf207-201ENSMUST00000076183 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Lims1Q99JW4 Tcf3-209ENSMUST00000105345 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Lims1Q99JW4 Gm26938-201ENSMUST00000182839 744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Lims1Q99JW4 Dleu2-210ENSMUST00000183054 722 ntTSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Lims1Q99JW4 Gm29707-201ENSMUST00000196325 491 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
Lims1Q99JW4 Arfip2-212ENSMUST00000209550 1141 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Lims1Q99JW4 Arfip2-214ENSMUST00000210911 938 ntTSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Lims1Q99JW4 Lce1m-201ENSMUST00000029520 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Lims1Q99JW4 Flvcr1-201ENSMUST00000085635 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Lims1Q99JW4 Cyp4f13-204ENSMUST00000139353 1389 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Lims1Q99JW4 Gm7854-202ENSMUST00000187409 1433 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Lims1Q99JW4 Adipor1-202ENSMUST00000112237 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Lims1Q99JW4 Syngr3-201ENSMUST00000007236 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Lims1Q99JW4 Gm15442-201ENSMUST00000117905 1527 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
Lims1Q99JW4 Rsu1-201ENSMUST00000028059 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Lims1Q99JW4 Rsph6a-202ENSMUST00000076887 1580 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Lims1Q99JW4 Pacsin1-203ENSMUST00000114872 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Lims1Q99JW4 Gm45470-202ENSMUST00000210817 2192 ntTSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Lims1Q99JW4 Cask-201ENSMUST00000033321 4057 ntTSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Lims1Q99JW4 Lrrc42-201ENSMUST00000030360 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Lims1Q99JW4 Foxq1-201ENSMUST00000042118 4843 ntAPPRIS P1 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Lims1Q99JW4 Fmnl3-203ENSMUST00000120633 4290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Lims1Q99JW4 Gm20403-201ENSMUST00000173803 372 ntAPPRIS P1 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Lims1Q99JW4 Muc2-203ENSMUST00000179227 399 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Lims1Q99JW4 Gprc5b-201ENSMUST00000008878 4518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Lims1Q99JW4 Taf5-201ENSMUST00000026027 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Lims1Q99JW4 Abhd3-203ENSMUST00000117828 1962 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Lims1Q99JW4 Rrp15-201ENSMUST00000001339 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Lims1Q99JW4 Rab32-201ENSMUST00000019974 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Lims1Q99JW4 Synpo-201ENSMUST00000097566 5060 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Lims1Q99JW4 Tmem229b-206ENSMUST00000174697 3697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Lims1Q99JW4 Gm26627-201ENSMUST00000181540 1487 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Lims1Q99JW4 Serpine2-201ENSMUST00000027467 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Lims1Q99JW4 Gm26892-201ENSMUST00000181695 1636 ntTSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Lims1Q99JW4 Ttc6-203ENSMUST00000172939 5782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Lims1Q99JW4 Cend1-201ENSMUST00000084436 1672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Lims1Q99JW4 Zdhhc6-209ENSMUST00000225495 1711 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
Lims1Q99JW4 Gopc-202ENSMUST00000105475 4317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Lims1Q99JW4 Arf2-202ENSMUST00000063347 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Lims1Q99JW4 Patz1-205ENSMUST00000110043 3702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Lims1Q99JW4 Galt-202ENSMUST00000108038 1859 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Lims1Q99JW4 Emc8-201ENSMUST00000034277 4942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Lims1Q99JW4 Gm27528-202ENSMUST00000222916 2012 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
Lims1Q99JW4 Sybu-202ENSMUST00000110267 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Lims1Q99JW4 Zfp109-203ENSMUST00000206960 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Lims1Q99JW4 Wt1-201ENSMUST00000111098 2395 ntTSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Lims1Q99JW4 Atp5g1-202ENSMUST00000107684 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Lims1Q99JW4 Hilpda-202ENSMUST00000115289 658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Lims1Q99JW4 D330020A13Rik-201ENSMUST00000181956 1069 ntAPPRIS P1 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Lims1Q99JW4 Gm29994-201ENSMUST00000195495 1193 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
Lims1Q99JW4 6530437J22Rik-201ENSMUST00000207515 773 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Lims1Q99JW4 Espn-202ENSMUST00000049305 1142 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Lims1Q99JW4 Snapc3-202ENSMUST00000071544 942 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Lims1Q99JW4 Tead3-206ENSMUST00000156862 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Lims1Q99JW4 Dach1-202ENSMUST00000071533 5219 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Lims1Q99JW4 Disp3-201ENSMUST00000047720 5282 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Lims1Q99JW4 Syf2-201ENSMUST00000030622 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Lims1Q99JW4 4930448E22Rik-201ENSMUST00000181712 1581 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Lims1Q99JW4 Gm12866-201ENSMUST00000128998 1671 ntTSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Lims1Q99JW4 Sort1-201ENSMUST00000102632 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Lims1Q99JW4 Rffl-202ENSMUST00000071152 3633 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Lims1Q99JW4 T-201ENSMUST00000074667 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Lims1Q99JW4 Sec31a-201ENSMUST00000094578 4228 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Lims1Q99JW4 Ocln-205ENSMUST00000160859 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Lims1Q99JW4 Rpn2-201ENSMUST00000029171 2621 ntTSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Lims1Q99JW4 Kifc3-203ENSMUST00000169748 3384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Lims1Q99JW4 Spsb2-203ENSMUST00000112473 1322 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
Lims1Q99JW4 Insc-201ENSMUST00000117543 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Lims1Q99JW4 Slc35c1-202ENSMUST00000125276 2668 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Lims1Q99JW4 Ager-201ENSMUST00000015596 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Lims1Q99JW4 Crem-239ENSMUST00000165086 2778 ntTSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Lims1Q99JW4 Gm26825-201ENSMUST00000181751 2026 ntTSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Lims1Q99JW4 Agfg1-204ENSMUST00000186302 2352 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.5 ms