Protein–RNA interactions for Protein: Q922J3

Clip1, CAP-Gly domain-containing linker protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,391 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clip1Q922J3 Gmppa-202ENSMUST00000113584 1692 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.64
Clip1Q922J3 Dcdc2c-206ENSMUST00000221349 2209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
Clip1Q922J3 Aig1-202ENSMUST00000105534 617 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
Clip1Q922J3 Batf-201ENSMUST00000040536 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Clip1Q922J3 Pmm1-202ENSMUST00000071462 1059 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Clip1Q922J3 D430001F17Rik-201ENSMUST00000141344 1858 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
Clip1Q922J3 Baz1a-201ENSMUST00000038926 6188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
Clip1Q922J3 Whrn-205ENSMUST00000095038 2665 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Clip1Q922J3 Trip10-205ENSMUST00000224885 2136 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
Clip1Q922J3 Lhx6-205ENSMUST00000112967 3378 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Clip1Q922J3 Igsf11-201ENSMUST00000023478 3443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Clip1Q922J3 Tstd3-201ENSMUST00000029915 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Clip1Q922J3 Stox1-202ENSMUST00000133371 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Clip1Q922J3 Krt83-201ENSMUST00000023718 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Clip1Q922J3 Casq1-201ENSMUST00000003554 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Clip1Q922J3 Tmtc4-209ENSMUST00000148661 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Clip1Q922J3 Triqk-201ENSMUST00000143186 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Clip1Q922J3 Nptn-211ENSMUST00000177064 582 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
Clip1Q922J3 Zfp524-202ENSMUST00000207901 1263 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
Clip1Q922J3 Lce3b-201ENSMUST00000046234 562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Clip1Q922J3 A830031A19Rik-201ENSMUST00000068360 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Clip1Q922J3 Mtss1l-201ENSMUST00000052457 4717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Clip1Q922J3 Gm45188-201ENSMUST00000207592 1369 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Clip1Q922J3 Msantd3-202ENSMUST00000064807 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Clip1Q922J3 Fmnl2-203ENSMUST00000090952 5414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
Clip1Q922J3 Gm42743-201ENSMUST00000051089 1511 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Clip1Q922J3 Psen2-203ENSMUST00000111105 1575 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
Clip1Q922J3 Zfp326-201ENSMUST00000031227 2667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Clip1Q922J3 Chsy3-201ENSMUST00000080721 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Clip1Q922J3 Cdc27-202ENSMUST00000106961 1863 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Clip1Q922J3 N6amt1-201ENSMUST00000054442 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Clip1Q922J3 Ncoa5-201ENSMUST00000040381 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Clip1Q922J3 Trim31-201ENSMUST00000078438 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Clip1Q922J3 Brpf1-204ENSMUST00000113122 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
Clip1Q922J3 Abhd13-202ENSMUST00000139793 5191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
Clip1Q922J3 Cul4a-201ENSMUST00000016680 3728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Clip1Q922J3 Gm4609-201ENSMUST00000106443 1002 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
Clip1Q922J3 Tmsb4x-202ENSMUST00000112175 864 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
Clip1Q922J3 Gm5138-201ENSMUST00000113842 1002 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
Clip1Q922J3 Gm15191-201ENSMUST00000117933 1000 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
Clip1Q922J3 Gm12182-201ENSMUST00000118655 1008 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
Clip1Q922J3 Chchd7-203ENSMUST00000119307 889 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
Clip1Q922J3 Gm13882-201ENSMUST00000120886 1002 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
Clip1Q922J3 Mgarp-203ENSMUST00000141156 1246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
Clip1Q922J3 Gm10284-201ENSMUST00000145057 1005 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
Clip1Q922J3 Prss45-202ENSMUST00000146794 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Clip1Q922J3 Gm10481-201ENSMUST00000179228 1002 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
Clip1Q922J3 Gapdh-ps15-201ENSMUST00000180966 1002 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
Clip1Q922J3 Gm2574-201ENSMUST00000181051 1002 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
Clip1Q922J3 Gm3200-201ENSMUST00000181493 1002 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
Clip1Q922J3 Gm8825-201ENSMUST00000182565 998 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
Clip1Q922J3 Gm4518-201ENSMUST00000182638 718 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
Clip1Q922J3 Gm8330-201ENSMUST00000182754 1008 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
Clip1Q922J3 Gm4575-201ENSMUST00000182991 1002 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
Clip1Q922J3 Gm8709-201ENSMUST00000183230 1012 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
Clip1Q922J3 Gm10293-201ENSMUST00000076317 1002 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
Clip1Q922J3 Gm6316-201ENSMUST00000082064 1020 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
Clip1Q922J3 Lypd1-205ENSMUST00000162899 1511 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Clip1Q922J3 Pdlim5-212ENSMUST00000200043 1581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Clip1Q922J3 Sil1-201ENSMUST00000025215 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Clip1Q922J3 Abhd16a-201ENSMUST00000007251 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Clip1Q922J3 AC121598.2-201ENSMUST00000228376 2325 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
Clip1Q922J3 Hirip3-201ENSMUST00000037248 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Clip1Q922J3 Cdv3-207ENSMUST00000190226 3107 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
Clip1Q922J3 Atp2a2-201ENSMUST00000031423 4486 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Clip1Q922J3 Evx2-201ENSMUST00000001867 4191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Clip1Q922J3 Rab37-202ENSMUST00000067754 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Clip1Q922J3 Rnpep-202ENSMUST00000077340 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Clip1Q922J3 Slc29a1-202ENSMUST00000064889 1988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Clip1Q922J3 Cldn11-201ENSMUST00000046174 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Clip1Q922J3 Tmem217-201ENSMUST00000114683 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Clip1Q922J3 Gm13216-201ENSMUST00000117145 591 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
Clip1Q922J3 1190007I07Rik-202ENSMUST00000176200 586 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
Clip1Q922J3 1190007I07Rik-203ENSMUST00000183363 406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Clip1Q922J3 Gm29456-201ENSMUST00000189894 768 ntTSL 3 BASIC25.3■■□□□ 1.64
Clip1Q922J3 Gm44123-201ENSMUST00000204662 577 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
Clip1Q922J3 Zfp930-203ENSMUST00000212312 493 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
Clip1Q922J3 Olfr30-201ENSMUST00000055204 1066 ntAPPRIS P1 BASIC25.3■■□□□ 1.64
Clip1Q922J3 1190007I07Rik-201ENSMUST00000079648 716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Clip1Q922J3 Mid1ip1-202ENSMUST00000115524 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Clip1Q922J3 Mid1ip1-201ENSMUST00000008179 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Clip1Q922J3 Mtmr1-202ENSMUST00000114601 4640 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
Clip1Q922J3 Mipep-201ENSMUST00000063562 3015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Clip1Q922J3 Pnpla2-202ENSMUST00000064151 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Clip1Q922J3 Rgs9-202ENSMUST00000103062 1743 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
Clip1Q922J3 Smox-203ENSMUST00000110180 1617 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Clip1Q922J3 Ankrd16-201ENSMUST00000056108 1618 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
Clip1Q922J3 Utp3-201ENSMUST00000090413 1629 ntAPPRIS P1 BASIC25.29■■□□□ 1.64
Clip1Q922J3 Slain2-202ENSMUST00000144843 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Clip1Q922J3 Cd40-202ENSMUST00000073707 1596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Clip1Q922J3 Gm45844-204ENSMUST00000209833 1524 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
Clip1Q922J3 Gm12355-201ENSMUST00000104933 1311 ntAPPRIS P1 BASIC25.29■■□□□ 1.64
Clip1Q922J3 Thap7-201ENSMUST00000100125 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Clip1Q922J3 Gm45683-201ENSMUST00000210825 1247 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
Clip1Q922J3 Tnp2-201ENSMUST00000051297 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Clip1Q922J3 Ly6k-201ENSMUST00000060301 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Clip1Q922J3 Fmr1nb-201ENSMUST00000069731 799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Clip1Q922J3 Kank3-201ENSMUST00000048560 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Clip1Q922J3 Zbtb46-202ENSMUST00000087409 2577 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Clip1Q922J3 Cgn-204ENSMUST00000155485 2361 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.6 ms