Protein–RNA interactions for Protein: Q921F2

Tardbp, TAR DNA-binding protein 43, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 414 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TardbpQ921F2 Gm15173-201ENSMUST00000122049 433 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
TardbpQ921F2 4930515G01Rik-201ENSMUST00000173208 1247 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
TardbpQ921F2 Gm16845-202ENSMUST00000216270 567 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
TardbpQ921F2 AC164441.1-201ENSMUST00000221369 1004 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
TardbpQ921F2 Gm15590-201ENSMUST00000078419 552 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
TardbpQ921F2 Pecr-202ENSMUST00000097698 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TardbpQ921F2 Trabd-201ENSMUST00000081702 2439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TardbpQ921F2 Lrp5-201ENSMUST00000025856 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TardbpQ921F2 Ankrd17-202ENSMUST00000081914 8057 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
TardbpQ921F2 Paip2-201ENSMUST00000041314 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TardbpQ921F2 1810013L24Rik-201ENSMUST00000023150 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TardbpQ921F2 Crebzf-201ENSMUST00000061767 3376 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
TardbpQ921F2 Nploc4-202ENSMUST00000103017 4025 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TardbpQ921F2 Rtn4-204ENSMUST00000102842 2257 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TardbpQ921F2 Lrrc45-201ENSMUST00000026139 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TardbpQ921F2 Sfrp2-201ENSMUST00000029625 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TardbpQ921F2 Zmynd15-203ENSMUST00000108563 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TardbpQ921F2 Ank1-203ENSMUST00000110688 7206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TardbpQ921F2 Abhd10-201ENSMUST00000066983 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TardbpQ921F2 Cnih1-201ENSMUST00000015903 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TardbpQ921F2 Casp9-201ENSMUST00000030747 3897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TardbpQ921F2 Rnf103-201ENSMUST00000064637 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TardbpQ921F2 Myo16-204ENSMUST00000208309 2462 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TardbpQ921F2 Gm25990-201ENSMUST00000102440 86 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
TardbpQ921F2 Aig1-202ENSMUST00000105534 617 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TardbpQ921F2 Thap3-202ENSMUST00000105665 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TardbpQ921F2 Cnbp-202ENSMUST00000113617 952 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TardbpQ921F2 Tmem208-201ENSMUST00000015000 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TardbpQ921F2 Gm7230-201ENSMUST00000173026 815 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
TardbpQ921F2 Rnf13-209ENSMUST00000199041 1062 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TardbpQ921F2 Ap2s1-204ENSMUST00000205607 372 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TardbpQ921F2 Fam26f-201ENSMUST00000062784 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TardbpQ921F2 A830031A19Rik-201ENSMUST00000068360 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TardbpQ921F2 Gtpbp3-208ENSMUST00000168847 2803 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TardbpQ921F2 Vps53-203ENSMUST00000108419 2209 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TardbpQ921F2 Hikeshi-206ENSMUST00000153470 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TardbpQ921F2 Tead3-205ENSMUST00000154873 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TardbpQ921F2 Donson-201ENSMUST00000023682 2360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TardbpQ921F2 Chrm4-201ENSMUST00000045537 1440 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TardbpQ921F2 Acp7-201ENSMUST00000040112 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TardbpQ921F2 Atoh1-201ENSMUST00000101351 2121 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TardbpQ921F2 2610301B20Rik-201ENSMUST00000080517 2116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TardbpQ921F2 Baz1a-205ENSMUST00000173433 5788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TardbpQ921F2 Arpc1b-211ENSMUST00000196111 1394 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TardbpQ921F2 Rab3a-201ENSMUST00000034301 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TardbpQ921F2 Cacna1b-204ENSMUST00000102939 9736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TardbpQ921F2 Zfp92-202ENSMUST00000086470 2050 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TardbpQ921F2 C230012O17Rik-201ENSMUST00000130085 2999 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TardbpQ921F2 Dok3-201ENSMUST00000047877 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TardbpQ921F2 Cep68-204ENSMUST00000162811 2788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TardbpQ921F2 Gm17018-201ENSMUST00000047057 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TardbpQ921F2 Tmem33-206ENSMUST00000162543 664 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TardbpQ921F2 Gm4535-201ENSMUST00000182274 558 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
TardbpQ921F2 Gm36584-201ENSMUST00000209046 708 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TardbpQ921F2 Rangrf-201ENSMUST00000038644 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TardbpQ921F2 Bhlha9-201ENSMUST00000056184 1207 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TardbpQ921F2 Gm10355-201ENSMUST00000097146 517 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
TardbpQ921F2 Lrrc14-202ENSMUST00000127208 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TardbpQ921F2 Tbp-202ENSMUST00000117593 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TardbpQ921F2 Nfe2l1-202ENSMUST00000107657 3869 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TardbpQ921F2 Tmem131l-201ENSMUST00000052342 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TardbpQ921F2 Gabpa-201ENSMUST00000009120 4987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TardbpQ921F2 Prss8-201ENSMUST00000032988 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TardbpQ921F2 Plppr2-201ENSMUST00000046371 2626 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TardbpQ921F2 Il11ra1-202ENSMUST00000108040 1837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TardbpQ921F2 Tbxas1-201ENSMUST00000003017 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TardbpQ921F2 H2-D1-202ENSMUST00000172785 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TardbpQ921F2 Zfp746-201ENSMUST00000073124 3651 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TardbpQ921F2 Rbm3-206ENSMUST00000115621 1338 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TardbpQ921F2 Samd4-211ENSMUST00000228404 3039 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TardbpQ921F2 Slit1-201ENSMUST00000025993 5045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TardbpQ921F2 Tnks-201ENSMUST00000033929 9163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TardbpQ921F2 Cnn2-202ENSMUST00000105374 926 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TardbpQ921F2 Trmt112-202ENSMUST00000116551 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TardbpQ921F2 Tpt1-205ENSMUST00000142061 996 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TardbpQ921F2 Gm26768-201ENSMUST00000181097 966 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TardbpQ921F2 Gm44123-201ENSMUST00000204662 577 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TardbpQ921F2 Gm26646-202ENSMUST00000205705 439 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TardbpQ921F2 Gm7506-201ENSMUST00000207758 815 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
TardbpQ921F2 AC171004.1-201ENSMUST00000221723 664 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TardbpQ921F2 AC154222.1-201ENSMUST00000223882 475 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
TardbpQ921F2 Slc7a5-201ENSMUST00000045557 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TardbpQ921F2 Chmp2a-201ENSMUST00000005711 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TardbpQ921F2 Trap1-201ENSMUST00000006137 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TardbpQ921F2 Gm11696-201ENSMUST00000070956 2765 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TardbpQ921F2 Gm42417-201ENSMUST00000191849 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TardbpQ921F2 Adam15-203ENSMUST00000107446 1686 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TardbpQ921F2 CT010456.1-201ENSMUST00000222465 1688 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TardbpQ921F2 Cbarp-201ENSMUST00000105369 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TardbpQ921F2 Nespas-203ENSMUST00000151472 2248 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TardbpQ921F2 Pdgfa-202ENSMUST00000076095 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TardbpQ921F2 Ermp1-203ENSMUST00000159692 7058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TardbpQ921F2 Rprd1b-207ENSMUST00000152452 1910 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TardbpQ921F2 Ptprs-201ENSMUST00000067538 6855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TardbpQ921F2 Snx27-201ENSMUST00000029783 6261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
TardbpQ921F2 B4galnt4-201ENSMUST00000048002 3556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
TardbpQ921F2 Pomp-201ENSMUST00000031654 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
TardbpQ921F2 Krt16-201ENSMUST00000007280 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
TardbpQ921F2 Jam2-201ENSMUST00000098407 1998 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
TardbpQ921F2 Gm43338-201ENSMUST00000198617 2223 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 64.6 ms