Protein–RNA interactions for Protein: Q91YK0

Lrrc49, Leucine-rich repeat-containing protein 49, mousemouse

Predictions only

Length 686 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrrc49Q91YK0 Pcolce-202ENSMUST00000054564 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Lrrc49Q91YK0 Acvr1c-204ENSMUST00000112608 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Lrrc49Q91YK0 Gm26781-201ENSMUST00000181385 1477 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Lrrc49Q91YK0 Tnfaip2-202ENSMUST00000109792 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Lrrc49Q91YK0 Izumo1r-204ENSMUST00000121116 726 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Lrrc49Q91YK0 Hist1h2br-203ENSMUST00000180288 1256 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Lrrc49Q91YK0 Gm26879-201ENSMUST00000181127 1176 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Lrrc49Q91YK0 4930544I03Rik-201ENSMUST00000181184 1276 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Lrrc49Q91YK0 Gm44965-201ENSMUST00000204121 360 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Lrrc49Q91YK0 Chmp2a-203ENSMUST00000210587 930 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Lrrc49Q91YK0 Pgpep1-208ENSMUST00000211715 676 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Lrrc49Q91YK0 Gm18115-201ENSMUST00000221209 621 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Lrrc49Q91YK0 Gm32151-201ENSMUST00000223521 915 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Lrrc49Q91YK0 Hist1h2bq-202ENSMUST00000091749 1254 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Lrrc49Q91YK0 Ube2r2-201ENSMUST00000040008 3600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Lrrc49Q91YK0 BC030336-201ENSMUST00000060175 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Lrrc49Q91YK0 Gfy-201ENSMUST00000179443 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Lrrc49Q91YK0 Itgb4-201ENSMUST00000021107 6014 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Lrrc49Q91YK0 Map6-207ENSMUST00000208924 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Lrrc49Q91YK0 Cenpw-201ENSMUST00000099985 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Lrrc49Q91YK0 Isl2-201ENSMUST00000034869 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Lrrc49Q91YK0 Stxbp3-205ENSMUST00000138552 1789 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Lrrc49Q91YK0 Pfkfb4-203ENSMUST00000198140 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Lrrc49Q91YK0 Cdon-202ENSMUST00000119129 7503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Lrrc49Q91YK0 Bin2-207ENSMUST00000183211 2036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Lrrc49Q91YK0 Fhl2-201ENSMUST00000008280 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Lrrc49Q91YK0 Osbpl1a-205ENSMUST00000119512 1947 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Lrrc49Q91YK0 Atp5b-201ENSMUST00000026459 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Lrrc49Q91YK0 Tenm3-204ENSMUST00000110346 2267 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Lrrc49Q91YK0 Safb-207ENSMUST00000182533 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Lrrc49Q91YK0 Gm20878-202ENSMUST00000108028 339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Lrrc49Q91YK0 Slc2a8-204ENSMUST00000153484 1168 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Lrrc49Q91YK0 Gm3272-201ENSMUST00000181181 1229 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Lrrc49Q91YK0 Gm19426-201ENSMUST00000181711 726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Lrrc49Q91YK0 Eloc-203ENSMUST00000185771 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Lrrc49Q91YK0 Tnnt2-212ENSMUST00000189732 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Lrrc49Q91YK0 Pih1d1-201ENSMUST00000085375 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Lrrc49Q91YK0 Gm10566-201ENSMUST00000086739 996 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Lrrc49Q91YK0 Tsc22d2-201ENSMUST00000099090 9799 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Lrrc49Q91YK0 Naa35-201ENSMUST00000022038 3793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Lrrc49Q91YK0 Ephb4-203ENSMUST00000111055 4296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Lrrc49Q91YK0 Zkscan3-203ENSMUST00000116434 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Lrrc49Q91YK0 Irf5-205ENSMUST00000167252 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Lrrc49Q91YK0 Zpbp2-203ENSMUST00000107509 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Lrrc49Q91YK0 Matr3-214ENSMUST00000190029 2845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Lrrc49Q91YK0 Gtpbp3-201ENSMUST00000007754 2800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Lrrc49Q91YK0 Gfra2-202ENSMUST00000227633 1480 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Lrrc49Q91YK0 Fem1b-201ENSMUST00000034775 6785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Lrrc49Q91YK0 Sorbs1-213ENSMUST00000225153 3589 ntAPPRIS P4 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Lrrc49Q91YK0 Ahctf1-201ENSMUST00000027768 8506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Lrrc49Q91YK0 Chn1-209ENSMUST00000166199 3876 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Lrrc49Q91YK0 Wdr45-201ENSMUST00000043045 1609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Lrrc49Q91YK0 Rasd1-201ENSMUST00000062405 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Lrrc49Q91YK0 Mapk9-205ENSMUST00000109179 4682 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Lrrc49Q91YK0 Mapk9-209ENSMUST00000164643 4682 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Lrrc49Q91YK0 Cops6-201ENSMUST00000019638 1787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Lrrc49Q91YK0 Tspyl2-201ENSMUST00000044509 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Lrrc49Q91YK0 Taco1os-201ENSMUST00000140736 644 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Lrrc49Q91YK0 Acaa1a-203ENSMUST00000175743 1219 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Lrrc49Q91YK0 Acaa1a-207ENSMUST00000176397 996 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Lrrc49Q91YK0 Pcyox1-206ENSMUST00000204116 546 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Lrrc49Q91YK0 Olfr317-201ENSMUST00000075607 1128 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Lrrc49Q91YK0 Ldlrad1-201ENSMUST00000094916 1093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Lrrc49Q91YK0 Pex12-205ENSMUST00000175741 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Lrrc49Q91YK0 Fbxl3-206ENSMUST00000145693 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Lrrc49Q91YK0 Ngrn-201ENSMUST00000117989 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Lrrc49Q91YK0 Coro1a-202ENSMUST00000106364 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Lrrc49Q91YK0 Zbtb16-202ENSMUST00000216150 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Lrrc49Q91YK0 Tcf3-207ENSMUST00000105343 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Lrrc49Q91YK0 Gm11748-201ENSMUST00000153825 1498 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Lrrc49Q91YK0 Dusp14-205ENSMUST00000164891 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Lrrc49Q91YK0 Adat2-201ENSMUST00000019944 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Lrrc49Q91YK0 Psen2-201ENSMUST00000010753 2004 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Lrrc49Q91YK0 Eml5-210ENSMUST00000223282 7595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Lrrc49Q91YK0 Gfod1-201ENSMUST00000055341 6928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Lrrc49Q91YK0 Lrrfip1-212ENSMUST00000189617 2155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Lrrc49Q91YK0 Nipal3-201ENSMUST00000102549 5153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Lrrc49Q91YK0 Fnbp1-205ENSMUST00000113552 1910 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Lrrc49Q91YK0 Tgfb2-201ENSMUST00000045288 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Lrrc49Q91YK0 Rdx-202ENSMUST00000061352 1502 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Lrrc49Q91YK0 Dmtn-201ENSMUST00000022694 5418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Lrrc49Q91YK0 Nes-201ENSMUST00000090973 6126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Lrrc49Q91YK0 Fam208a-201ENSMUST00000022450 7590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Lrrc49Q91YK0 Dnajb3-201ENSMUST00000119972 1051 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Lrrc49Q91YK0 Spata25-201ENSMUST00000017911 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Lrrc49Q91YK0 AC134329.2-201ENSMUST00000217897 428 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Lrrc49Q91YK0 Olfr279-201ENSMUST00000050451 933 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Lrrc49Q91YK0 Hist1h2ai-201ENSMUST00000070124 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Lrrc49Q91YK0 Snapc3-202ENSMUST00000071544 942 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Lrrc49Q91YK0 Fam92a-201ENSMUST00000087052 1292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Lrrc49Q91YK0 Hist1h2an-201ENSMUST00000091751 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Lrrc49Q91YK0 Gata5-201ENSMUST00000015771 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Lrrc49Q91YK0 Gm26568-201ENSMUST00000180496 1594 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Lrrc49Q91YK0 Glt28d2-201ENSMUST00000033643 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Lrrc49Q91YK0 Cyp2f2-201ENSMUST00000003100 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Lrrc49Q91YK0 Wipf1-202ENSMUST00000102679 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Lrrc49Q91YK0 Ggnbp2-211ENSMUST00000168434 3056 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Lrrc49Q91YK0 Usp27x-201ENSMUST00000115744 3240 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Lrrc49Q91YK0 2810408A11Rik-204ENSMUST00000108621 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Lrrc49Q91YK0 Mier2-203ENSMUST00000165028 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.7 ms