Protein–RNA interactions for Protein: Q91XD2

Lims2, LIM and senescent cell antigen-like-containing domain protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 341 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lims2Q91XD2 Gm4459-201ENSMUST00000118750 468 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Lims2Q91XD2 Hnrnpa1l2-ps-201ENSMUST00000129154 964 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Lims2Q91XD2 4933405L10Rik-201ENSMUST00000013302 1214 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Lims2Q91XD2 Tsc22d1-208ENSMUST00000142683 797 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Lims2Q91XD2 Gm3336-201ENSMUST00000179347 1149 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Lims2Q91XD2 Gm26646-202ENSMUST00000205705 439 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Lims2Q91XD2 Gm3336-202ENSMUST00000213065 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Lims2Q91XD2 Fars2-201ENSMUST00000021857 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Lims2Q91XD2 Gm6296-201ENSMUST00000222599 943 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Lims2Q91XD2 Cd300c-201ENSMUST00000061637 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Lims2Q91XD2 Cd300c-202ENSMUST00000092466 700 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Lims2Q91XD2 Gm26803-201ENSMUST00000181705 2011 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Lims2Q91XD2 Peli2-201ENSMUST00000073150 5900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Lims2Q91XD2 Mettl21a-201ENSMUST00000053469 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Lims2Q91XD2 Hhatl-201ENSMUST00000035110 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Lims2Q91XD2 Prdm12-201ENSMUST00000113470 2471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Lims2Q91XD2 Mif4gd-203ENSMUST00000106507 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Lims2Q91XD2 Cebpg-202ENSMUST00000130491 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Lims2Q91XD2 Pafah1b1-201ENSMUST00000021091 5803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Lims2Q91XD2 Dnal4-201ENSMUST00000023055 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Lims2Q91XD2 T-201ENSMUST00000074667 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Lims2Q91XD2 Gm8784-201ENSMUST00000222096 1435 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Lims2Q91XD2 Jph1-201ENSMUST00000038382 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Lims2Q91XD2 Mapk1ip1-203ENSMUST00000119664 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Lims2Q91XD2 Wnt1-201ENSMUST00000023734 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Lims2Q91XD2 Mcfd2-201ENSMUST00000024963 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Lims2Q91XD2 1810010H24Rik-201ENSMUST00000106767 1100 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Lims2Q91XD2 1700008O03Rik-201ENSMUST00000107933 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Lims2Q91XD2 Slc19a2-204ENSMUST00000169394 894 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Lims2Q91XD2 Bend6-204ENSMUST00000129464 1750 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Lims2Q91XD2 Hmgb3-204ENSMUST00000114582 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Lims2Q91XD2 Hmgb3-203ENSMUST00000088874 1728 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Lims2Q91XD2 Col15a1-201ENSMUST00000082303 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Lims2Q91XD2 Dpys-201ENSMUST00000022915 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Lims2Q91XD2 Zfp446-202ENSMUST00000108535 2594 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Lims2Q91XD2 Pigl-201ENSMUST00000014389 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Lims2Q91XD2 Fbxo9-202ENSMUST00000085311 2155 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Lims2Q91XD2 Hsf4-201ENSMUST00000036127 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Lims2Q91XD2 Cd2bp2-201ENSMUST00000035771 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Lims2Q91XD2 Cyp11b2-201ENSMUST00000167634 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Lims2Q91XD2 Fbxl21-203ENSMUST00000121871 1963 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Lims2Q91XD2 Ube2w-201ENSMUST00000117146 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Lims2Q91XD2 Nup98-205ENSMUST00000211022 3132 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Lims2Q91XD2 Zfp367-202ENSMUST00000117241 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Lims2Q91XD2 Cndp2-201ENSMUST00000025546 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Lims2Q91XD2 Slc25a11-201ENSMUST00000014750 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Lims2Q91XD2 E230025N22Rik-201ENSMUST00000115682 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Lims2Q91XD2 Gm5837-201ENSMUST00000191844 1369 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Lims2Q91XD2 Negr1-202ENSMUST00000074015 4983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Lims2Q91XD2 Shh-201ENSMUST00000002708 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Lims2Q91XD2 Trmt2a-202ENSMUST00000100099 2235 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Lims2Q91XD2 Cpq-201ENSMUST00000042167 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Lims2Q91XD2 Gm38392-202ENSMUST00000165196 1303 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Lims2Q91XD2 Alkbh5-201ENSMUST00000044250 5730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Lims2Q91XD2 Tpm2-201ENSMUST00000030184 2175 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Lims2Q91XD2 Ascl2-202ENSMUST00000121862 814 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Lims2Q91XD2 BC051226-201ENSMUST00000172526 837 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Lims2Q91XD2 Pdk3-201ENSMUST00000045748 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Lims2Q91XD2 Rps4l-201ENSMUST00000071745 943 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Lims2Q91XD2 Csnk1g3-201ENSMUST00000069597 4394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Lims2Q91XD2 Sox13-201ENSMUST00000094551 1842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Lims2Q91XD2 BC034090-204ENSMUST00000186156 4873 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Lims2Q91XD2 Phf7-201ENSMUST00000022459 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Lims2Q91XD2 Klhdc10-201ENSMUST00000068240 3951 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Lims2Q91XD2 Gm28265-201ENSMUST00000188201 2319 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Lims2Q91XD2 Mmp14-201ENSMUST00000089688 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Lims2Q91XD2 Sobp-201ENSMUST00000040275 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Lims2Q91XD2 Ly6e-201ENSMUST00000051698 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Lims2Q91XD2 Mydgf-201ENSMUST00000019723 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Lims2Q91XD2 Cbx2-201ENSMUST00000026662 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Lims2Q91XD2 Pde8b-214ENSMUST00000172104 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Lims2Q91XD2 Neu1-201ENSMUST00000007253 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Lims2Q91XD2 1700001O22Rik-201ENSMUST00000050003 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Lims2Q91XD2 Agtr1a-201ENSMUST00000066412 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Lims2Q91XD2 Cd164-201ENSMUST00000019962 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Lims2Q91XD2 Zxdc-203ENSMUST00000113539 4864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Lims2Q91XD2 Dtwd2-203ENSMUST00000163590 2857 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Lims2Q91XD2 Snupn-201ENSMUST00000068856 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Lims2Q91XD2 Rragd-201ENSMUST00000029946 5055 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Lims2Q91XD2 Atf6b-202ENSMUST00000173984 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Lims2Q91XD2 Btn1a1-202ENSMUST00000110434 1077 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Lims2Q91XD2 9430038I01Rik-202ENSMUST00000117404 699 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Lims2Q91XD2 Nabp2-204ENSMUST00000166608 979 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Lims2Q91XD2 1300002E11Rik-207ENSMUST00000211443 767 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Lims2Q91XD2 Gm8655-201ENSMUST00000221159 852 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Lims2Q91XD2 Magohb-201ENSMUST00000032307 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Lims2Q91XD2 Apopt1-201ENSMUST00000040519 1065 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Lims2Q91XD2 Aurkaip1-201ENSMUST00000084097 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Lims2Q91XD2 Rps6ka2-201ENSMUST00000024575 5404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Lims2Q91XD2 Zbtb5-204ENSMUST00000180217 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Lims2Q91XD2 Irx4-202ENSMUST00000176684 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Lims2Q91XD2 Wdr86-201ENSMUST00000068693 2364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Lims2Q91XD2 Ddx39-201ENSMUST00000019576 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Lims2Q91XD2 Fars2-205ENSMUST00000224241 1665 ntAPPRIS P1 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Lims2Q91XD2 Sgsm1-204ENSMUST00000112325 2274 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Lims2Q91XD2 Kifc3-212ENSMUST00000213004 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Lims2Q91XD2 Ppp1r11-201ENSMUST00000040402 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Lims2Q91XD2 Hbs1l-203ENSMUST00000092674 2625 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Lims2Q91XD2 Cyp26b1-203ENSMUST00000204109 1340 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Lims2Q91XD2 Gm10532-201ENSMUST00000181913 2301 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.2 ms