Protein–RNA interactions for Protein: Q91WC0

Setd3, Histone-lysine N-methyltransferase setd3, mousemouse

Predictions only

Length 594 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Setd3Q91WC0 Tlk1-201ENSMUST00000038584 4280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Setd3Q91WC0 Mycn-201ENSMUST00000043396 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Setd3Q91WC0 Lonp2-201ENSMUST00000034141 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Setd3Q91WC0 Htr3a-201ENSMUST00000003826 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Setd3Q91WC0 Ptn-201ENSMUST00000101534 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Setd3Q91WC0 Hmbs-201ENSMUST00000077353 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Setd3Q91WC0 Ncoa1-201ENSMUST00000085814 7329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Setd3Q91WC0 Nat9-203ENSMUST00000103040 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Setd3Q91WC0 Nat9-204ENSMUST00000103041 953 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Setd3Q91WC0 Gm7153-201ENSMUST00000117092 455 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
Setd3Q91WC0 Gm15372-201ENSMUST00000120729 834 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
Setd3Q91WC0 Oip5-202ENSMUST00000123818 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Setd3Q91WC0 Rnf170-208ENSMUST00000153528 1026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Setd3Q91WC0 Fuz-206ENSMUST00000207485 1140 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Setd3Q91WC0 Pnmt-201ENSMUST00000041301 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Setd3Q91WC0 Sult2b1-201ENSMUST00000075571 1193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Setd3Q91WC0 Rbck1-202ENSMUST00000109847 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Setd3Q91WC0 Osbpl1a-205ENSMUST00000119512 1947 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Setd3Q91WC0 Mid1ip1-201ENSMUST00000008179 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Setd3Q91WC0 Simc1-201ENSMUST00000118072 2116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Setd3Q91WC0 Cask-201ENSMUST00000033321 4057 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Setd3Q91WC0 Bcr-201ENSMUST00000164107 6839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Setd3Q91WC0 Gm9821-201ENSMUST00000178895 1953 ntAPPRIS P1 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Setd3Q91WC0 Rab11fip4-201ENSMUST00000017783 7156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Setd3Q91WC0 Dohh-201ENSMUST00000072751 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Setd3Q91WC0 Adamtsl1-201ENSMUST00000048885 1842 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Setd3Q91WC0 Camk2n1-201ENSMUST00000050918 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Setd3Q91WC0 Gprc5b-201ENSMUST00000008878 4518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Setd3Q91WC0 E2f2-201ENSMUST00000061721 4739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Setd3Q91WC0 Agk-201ENSMUST00000031977 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Setd3Q91WC0 Sf1-202ENSMUST00000113487 2649 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Setd3Q91WC0 Abl1-202ENSMUST00000075759 6327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Setd3Q91WC0 Robo3-202ENSMUST00000115038 4797 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Setd3Q91WC0 Susd1-202ENSMUST00000107544 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Setd3Q91WC0 Dguok-202ENSMUST00000113888 1007 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Setd3Q91WC0 Dguok-201ENSMUST00000014698 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Setd3Q91WC0 Syngr2-206ENSMUST00000177131 935 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Setd3Q91WC0 Olfr571-201ENSMUST00000061738 969 ntAPPRIS P1 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Setd3Q91WC0 Slc29a1-202ENSMUST00000064889 1988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Setd3Q91WC0 Ostf1-201ENSMUST00000025631 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Setd3Q91WC0 Kptn-201ENSMUST00000006178 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Setd3Q91WC0 Shd-201ENSMUST00000044216 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Setd3Q91WC0 Ccnl1-201ENSMUST00000029416 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Setd3Q91WC0 E330011M16Rik-201ENSMUST00000193614 1794 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
Setd3Q91WC0 Pole4-201ENSMUST00000095786 1769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Setd3Q91WC0 Rab27b-202ENSMUST00000117692 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Setd3Q91WC0 Efemp2-204ENSMUST00000165485 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Setd3Q91WC0 Nsmf-203ENSMUST00000100334 2957 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Setd3Q91WC0 Rnf141-201ENSMUST00000106682 1101 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Setd3Q91WC0 Yif1b-203ENSMUST00000108238 1126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Setd3Q91WC0 Yif1b-201ENSMUST00000032809 1111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Setd3Q91WC0 Pla2g12b-201ENSMUST00000009790 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Setd3Q91WC0 Mettl21a-202ENSMUST00000114079 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Setd3Q91WC0 Rbpms-203ENSMUST00000053251 2466 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Setd3Q91WC0 Lrp6-201ENSMUST00000032322 9368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Setd3Q91WC0 Slc35e3-201ENSMUST00000079041 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Setd3Q91WC0 Ndufv2-203ENSMUST00000143987 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Setd3Q91WC0 Mier2-212ENSMUST00000172158 1400 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Setd3Q91WC0 Plcl2-201ENSMUST00000043938 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
Setd3Q91WC0 Ogfod3-201ENSMUST00000026169 1308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
Setd3Q91WC0 Abcd4-201ENSMUST00000021666 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
Setd3Q91WC0 Aqp5-202ENSMUST00000169082 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Setd3Q91WC0 Gm9889-202ENSMUST00000206983 1577 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
Setd3Q91WC0 Wasf1-202ENSMUST00000105509 2719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Setd3Q91WC0 Tssc4-206ENSMUST00000177841 1364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Setd3Q91WC0 Mif4gd-201ENSMUST00000021087 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Setd3Q91WC0 Relt-201ENSMUST00000008462 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Setd3Q91WC0 Gmnn-202ENSMUST00000110382 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Setd3Q91WC0 Gm24589-201ENSMUST00000116692 94 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
Setd3Q91WC0 Gm12963-201ENSMUST00000131846 783 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Setd3Q91WC0 1700001G17Rik-201ENSMUST00000191779 889 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
Setd3Q91WC0 Gm36967-201ENSMUST00000193814 266 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
Setd3Q91WC0 Gm40457-201ENSMUST00000205319 1174 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Setd3Q91WC0 Gm44930-202ENSMUST00000208733 689 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Setd3Q91WC0 CT009713.7-201ENSMUST00000224689 571 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
Setd3Q91WC0 Slc25a43-201ENSMUST00000047655 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Setd3Q91WC0 Coro2a-202ENSMUST00000107756 4154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Setd3Q91WC0 Slc11a1-201ENSMUST00000027368 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Setd3Q91WC0 Yipf4-201ENSMUST00000024873 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Setd3Q91WC0 Tm6sf2-201ENSMUST00000049197 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Setd3Q91WC0 Lhfp-203ENSMUST00000147139 1932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Setd3Q91WC0 Cacna1h-201ENSMUST00000078496 8220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Setd3Q91WC0 Plekhh3-206ENSMUST00000164474 3010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Setd3Q91WC0 Gm42918-201ENSMUST00000199249 1580 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
Setd3Q91WC0 Mag-203ENSMUST00000187137 2434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Setd3Q91WC0 Gm16759-204ENSMUST00000191455 4272 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Setd3Q91WC0 Snx25-203ENSMUST00000110378 3445 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Setd3Q91WC0 Gm13283-201ENSMUST00000191112 1463 ntAPPRIS P1 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Setd3Q91WC0 Prdm5-201ENSMUST00000031973 1488 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Setd3Q91WC0 Ccdc30-201ENSMUST00000044781 1464 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Setd3Q91WC0 Rfx7-202ENSMUST00000163401 7880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Setd3Q91WC0 Ggnbp2-201ENSMUST00000018547 2478 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Setd3Q91WC0 Lad1-201ENSMUST00000038760 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Setd3Q91WC0 Rab6a-201ENSMUST00000032946 3214 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Setd3Q91WC0 Eif6-202ENSMUST00000109638 1382 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Setd3Q91WC0 Gm8839-201ENSMUST00000121279 1645 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
Setd3Q91WC0 Fbxl19-204ENSMUST00000188580 2601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Setd3Q91WC0 Cnot9-201ENSMUST00000087215 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Setd3Q91WC0 Ndufs2-202ENSMUST00000111318 1545 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Setd3Q91WC0 Prkcz-203ENSMUST00000105624 694 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.6 ms