Protein–RNA interactions for Protein: Q91W40

Klc3, Kinesin light chain 3, mousemouse

Predictions only

Length 508 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Klc3Q91W40 Lypd1-201ENSMUST00000027582 1447 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Klc3Q91W40 Tmem97-201ENSMUST00000103242 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Klc3Q91W40 Gm16151-201ENSMUST00000129696 639 ntTSL 3 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Klc3Q91W40 Gm2308-201ENSMUST00000166539 1004 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
Klc3Q91W40 Gm27300-201ENSMUST00000184085 97 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
Klc3Q91W40 Gm27335-201ENSMUST00000184758 97 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
Klc3Q91W40 AC159114.1-201ENSMUST00000220349 266 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
Klc3Q91W40 AC117588.1-201ENSMUST00000228510 999 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
Klc3Q91W40 Mt3-201ENSMUST00000034211 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Klc3Q91W40 Gm26663-201ENSMUST00000181105 1882 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Klc3Q91W40 Camsap3-206ENSMUST00000207533 2584 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Klc3Q91W40 Tubb4b-201ENSMUST00000043584 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Klc3Q91W40 Kmt5c-201ENSMUST00000098853 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Klc3Q91W40 Ube2e1-201ENSMUST00000022296 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Klc3Q91W40 Map3k5-201ENSMUST00000095806 5450 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Klc3Q91W40 4930452B06Rik-201ENSMUST00000102996 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Klc3Q91W40 Igf2bp2-201ENSMUST00000100052 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Klc3Q91W40 Dlk1-203ENSMUST00000109842 1129 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Klc3Q91W40 Acyp1-203ENSMUST00000117138 735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Klc3Q91W40 Lrrc3c-201ENSMUST00000142268 902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Klc3Q91W40 Rhox6-201ENSMUST00000006362 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Klc3Q91W40 Stradb-201ENSMUST00000027185 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Klc3Q91W40 Nagpa-203ENSMUST00000147567 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Klc3Q91W40 Rnf112-201ENSMUST00000054927 3086 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Klc3Q91W40 Gm26675-201ENSMUST00000181068 1525 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Klc3Q91W40 Hspa1l-201ENSMUST00000007248 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Klc3Q91W40 Ing1-202ENSMUST00000209565 1971 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Klc3Q91W40 Gm32369-201ENSMUST00000222630 1467 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Klc3Q91W40 Cep68-204ENSMUST00000162811 2788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Klc3Q91W40 Gm11620-201ENSMUST00000118770 1845 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
Klc3Q91W40 Zscan12-201ENSMUST00000053293 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Klc3Q91W40 Six3os1-206ENSMUST00000175921 2737 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Klc3Q91W40 Gm20478-201ENSMUST00000173648 1031 ntTSL 3 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Klc3Q91W40 Gm27244-201ENSMUST00000184260 380 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Klc3Q91W40 Thap4-205ENSMUST00000189728 713 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Klc3Q91W40 Tomm20l-201ENSMUST00000021482 578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Klc3Q91W40 Trip10-205ENSMUST00000224885 2136 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Klc3Q91W40 Lce1b-201ENSMUST00000029531 647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Klc3Q91W40 Emg1-201ENSMUST00000004379 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Klc3Q91W40 Sdhc-201ENSMUST00000081560 815 ntTSL 3 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Klc3Q91W40 Cd82-205ENSMUST00000116457 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Klc3Q91W40 Ssfa2-203ENSMUST00000111788 4976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Klc3Q91W40 Tulp1-201ENSMUST00000041819 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Klc3Q91W40 Ppp2r1b-206ENSMUST00000175645 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Klc3Q91W40 Nhs-201ENSMUST00000081569 4881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Klc3Q91W40 Runx2-204ENSMUST00000159943 2316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Klc3Q91W40 Marveld3-201ENSMUST00000001722 1330 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Klc3Q91W40 Dcaf8-206ENSMUST00000192704 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Klc3Q91W40 Dhdds-203ENSMUST00000105886 1015 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Klc3Q91W40 Psmb5-ps-201ENSMUST00000119744 798 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
Klc3Q91W40 Gm12999-201ENSMUST00000124471 485 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Klc3Q91W40 Gm15635-203ENSMUST00000148972 554 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Klc3Q91W40 Gm4899-201ENSMUST00000178708 719 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
Klc3Q91W40 Gm44872-201ENSMUST00000207864 420 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
Klc3Q91W40 Gm34397-203ENSMUST00000214991 630 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Klc3Q91W40 AC124549.3-201ENSMUST00000225541 367 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
Klc3Q91W40 Gdpd3-201ENSMUST00000032944 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Klc3Q91W40 Gm8396-201ENSMUST00000057361 823 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
Klc3Q91W40 Sfxn5-202ENSMUST00000059034 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Klc3Q91W40 Ndufs8-201ENSMUST00000075092 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Klc3Q91W40 Mzt1-201ENSMUST00000042662 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Klc3Q91W40 Lancl2-202ENSMUST00000072954 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Klc3Q91W40 Hoxb5-201ENSMUST00000049272 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Klc3Q91W40 Atp8b2-201ENSMUST00000069805 5559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Klc3Q91W40 Icmt-201ENSMUST00000048892 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Klc3Q91W40 Igfbp1-201ENSMUST00000020704 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Klc3Q91W40 Cidec-202ENSMUST00000113089 1720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Klc3Q91W40 Spg7-209ENSMUST00000149248 2896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Klc3Q91W40 Pak1ip1-201ENSMUST00000046951 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Klc3Q91W40 Pld2-203ENSMUST00000108557 3655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Klc3Q91W40 Slc39a10-201ENSMUST00000027131 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Klc3Q91W40 Tom1l2-201ENSMUST00000064019 2151 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Klc3Q91W40 Prnp-201ENSMUST00000091288 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Klc3Q91W40 Krt12-201ENSMUST00000017741 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Klc3Q91W40 Gpr150-201ENSMUST00000056130 2146 ntAPPRIS P1 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Klc3Q91W40 Gstz1-205ENSMUST00000222885 1571 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Klc3Q91W40 Tstd3-201ENSMUST00000029915 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Klc3Q91W40 Fam241b-208ENSMUST00000142796 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Klc3Q91W40 Slc25a5-201ENSMUST00000016463 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Klc3Q91W40 BC022687-202ENSMUST00000177808 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Klc3Q91W40 Dad1-201ENSMUST00000022781 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Klc3Q91W40 Tspo-201ENSMUST00000047419 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Klc3Q91W40 1700086L19Rik-201ENSMUST00000095617 706 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
Klc3Q91W40 Gm13446-201ENSMUST00000124555 2033 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Klc3Q91W40 Ism1-202ENSMUST00000184404 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Klc3Q91W40 Ino80e-203ENSMUST00000106343 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Klc3Q91W40 Sox12-201ENSMUST00000063332 4169 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Klc3Q91W40 Chst1-201ENSMUST00000065797 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Klc3Q91W40 Agfg2-202ENSMUST00000100544 2858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Klc3Q91W40 Irak1-205ENSMUST00000114353 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Klc3Q91W40 Ankra2-203ENSMUST00000123924 2328 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Klc3Q91W40 Zbtb8a-201ENSMUST00000030610 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Klc3Q91W40 Camkk2-211ENSMUST00000200109 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Klc3Q91W40 Ccdc106-204ENSMUST00000207974 2492 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Klc3Q91W40 Arl5c-201ENSMUST00000042971 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Klc3Q91W40 Sfxn4-203ENSMUST00000135808 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Klc3Q91W40 Tmem253-201ENSMUST00000100638 1234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Klc3Q91W40 Meig1-204ENSMUST00000115083 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Klc3Q91W40 AC159295.1-201ENSMUST00000225326 940 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
Klc3Q91W40 Chtf8-206ENSMUST00000177068 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.1 ms