Protein–RNA interactions for Protein: Q91VT8

Smim14, Small integral membrane protein 14, mousemouse

Predictions only

Length 99 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smim14Q91VT8 Pofut2-201ENSMUST00000020493 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Smim14Q91VT8 Ankrd10-201ENSMUST00000033905 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Smim14Q91VT8 Pgap3-202ENSMUST00000090827 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Smim14Q91VT8 Shd-201ENSMUST00000044216 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Smim14Q91VT8 Nova2-202ENSMUST00000220302 8372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Smim14Q91VT8 Nova2-201ENSMUST00000032571 8372 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Smim14Q91VT8 Pola2-202ENSMUST00000165143 2397 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Smim14Q91VT8 Slc15a3-201ENSMUST00000025646 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Smim14Q91VT8 Bhlhe41-202ENSMUST00000111703 744 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Smim14Q91VT8 Gm15234-201ENSMUST00000141485 1058 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Smim14Q91VT8 Rnf170-208ENSMUST00000153528 1026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Smim14Q91VT8 Hint3-203ENSMUST00000161074 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Smim14Q91VT8 Gm34391-201ENSMUST00000203706 907 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Smim14Q91VT8 Calm2-201ENSMUST00000040440 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Smim14Q91VT8 Clvs2-203ENSMUST00000160299 2610 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Smim14Q91VT8 Tmed9-201ENSMUST00000109905 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Smim14Q91VT8 Lmo4-202ENSMUST00000121112 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Smim14Q91VT8 Dmpk-203ENSMUST00000108474 2591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Smim14Q91VT8 Zhx1-202ENSMUST00000110168 5212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Smim14Q91VT8 Hist1h1c-201ENSMUST00000040914 1560 ntAPPRIS P1 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Smim14Q91VT8 Ranbp9-201ENSMUST00000144326 3371 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Smim14Q91VT8 Ikbke-204ENSMUST00000161764 2867 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Smim14Q91VT8 Nox4-202ENSMUST00000068829 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Smim14Q91VT8 Ube2d3-202ENSMUST00000166033 2504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Smim14Q91VT8 Glcci1-201ENSMUST00000064285 6200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Smim14Q91VT8 Ptbp2-213ENSMUST00000200097 3777 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Smim14Q91VT8 Lhfpl3-202ENSMUST00000197992 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Smim14Q91VT8 AK157302-201ENSMUST00000104942 1924 ntAPPRIS P1 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Smim14Q91VT8 Wnt1-201ENSMUST00000023734 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Smim14Q91VT8 Large1-202ENSMUST00000119826 4647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Smim14Q91VT8 Gpr142-202ENSMUST00000106584 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Smim14Q91VT8 Ift74-202ENSMUST00000107104 1713 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Smim14Q91VT8 2310009B15Rik-201ENSMUST00000112025 565 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Smim14Q91VT8 Gm14964-202ENSMUST00000149574 716 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Smim14Q91VT8 Gm17092-201ENSMUST00000166606 698 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Smim14Q91VT8 Smim22-208ENSMUST00000185147 399 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Smim14Q91VT8 AV026068-207ENSMUST00000187718 400 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Smim14Q91VT8 Lmo1-203ENSMUST00000208136 772 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Smim14Q91VT8 Pdcd2l-201ENSMUST00000002710 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Smim14Q91VT8 Gpr142-201ENSMUST00000045319 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Smim14Q91VT8 Spr-ps1-201ENSMUST00000089584 605 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Smim14Q91VT8 Ptpre-201ENSMUST00000073961 5410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Smim14Q91VT8 Ikzf1-203ENSMUST00000065433 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Smim14Q91VT8 Cant1-204ENSMUST00000106288 2873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Smim14Q91VT8 Men1-204ENSMUST00000113500 2742 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Smim14Q91VT8 Gm13327-201ENSMUST00000133391 2741 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Smim14Q91VT8 Prr14-201ENSMUST00000033095 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Smim14Q91VT8 Zic3-202ENSMUST00000088629 1951 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Smim14Q91VT8 Ush1c-208ENSMUST00000177212 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Smim14Q91VT8 Glra1-202ENSMUST00000102716 2390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Smim14Q91VT8 Cap1-203ENSMUST00000106257 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Smim14Q91VT8 Atf6b-202ENSMUST00000173984 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Smim14Q91VT8 Fam76a-202ENSMUST00000097856 1863 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Smim14Q91VT8 Uts2r-201ENSMUST00000039044 1703 ntAPPRIS P1 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Smim14Q91VT8 Slc22a16-202ENSMUST00000078314 2269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Smim14Q91VT8 Emd-201ENSMUST00000002029 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Smim14Q91VT8 Anxa2-201ENSMUST00000034756 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Smim14Q91VT8 Mal-202ENSMUST00000028854 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Smim14Q91VT8 Ccl27a-202ENSMUST00000108032 350 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Smim14Q91VT8 Tfpt-202ENSMUST00000108641 1166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Smim14Q91VT8 Zfp133-ps-202ENSMUST00000124788 1079 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Smim14Q91VT8 Tulp3-205ENSMUST00000157005 1053 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Smim14Q91VT8 Flg-202ENSMUST00000178008 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Smim14Q91VT8 Flg-205ENSMUST00000179250 765 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Smim14Q91VT8 Flg-206ENSMUST00000179477 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Smim14Q91VT8 Gm45890-204ENSMUST00000212356 545 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Smim14Q91VT8 Ppib-201ENSMUST00000034947 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Smim14Q91VT8 A230103J11Rik-202ENSMUST00000156084 2086 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Smim14Q91VT8 Hnrnpa1-202ENSMUST00000087351 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Smim14Q91VT8 Gm6858-201ENSMUST00000208582 1468 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Smim14Q91VT8 Washc1-202ENSMUST00000116556 2887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Smim14Q91VT8 Phkg2-202ENSMUST00000121004 1840 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Smim14Q91VT8 Sctr-202ENSMUST00000189037 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Smim14Q91VT8 Hey2-201ENSMUST00000019924 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Smim14Q91VT8 Atp8b2-201ENSMUST00000069805 5559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Smim14Q91VT8 Slc9a6-202ENSMUST00000114784 4449 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Smim14Q91VT8 Mid1-206ENSMUST00000112107 3194 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Smim14Q91VT8 Ngly1-201ENSMUST00000022310 2935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Smim14Q91VT8 Mier2-203ENSMUST00000165028 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Smim14Q91VT8 Tcp1-209ENSMUST00000151287 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Smim14Q91VT8 Cdkn1a-201ENSMUST00000023829 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Smim14Q91VT8 AC132265.1-201ENSMUST00000219233 1665 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Smim14Q91VT8 Sil1-201ENSMUST00000025215 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Smim14Q91VT8 Hs3st1-201ENSMUST00000053116 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Smim14Q91VT8 Trim37-201ENSMUST00000041282 5632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Smim14Q91VT8 Vamp4-203ENSMUST00000132158 2752 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Smim14Q91VT8 Sh3yl1-201ENSMUST00000020997 1750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Smim14Q91VT8 Gm7935-201ENSMUST00000100555 1278 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Smim14Q91VT8 Nat9-203ENSMUST00000103040 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Smim14Q91VT8 Nat9-204ENSMUST00000103041 953 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Smim14Q91VT8 Gm11729-201ENSMUST00000124901 713 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Smim14Q91VT8 AC153889.1-201ENSMUST00000219257 330 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Smim14Q91VT8 Psmg3-201ENSMUST00000031531 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Smim14Q91VT8 Chga-201ENSMUST00000021610 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Smim14Q91VT8 Kifc3-203ENSMUST00000169748 3384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Smim14Q91VT8 Prdm5-201ENSMUST00000031973 1488 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Smim14Q91VT8 Fmr1-205ENSMUST00000114656 4257 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Smim14Q91VT8 Adprh-201ENSMUST00000002923 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Smim14Q91VT8 Cdc14b-201ENSMUST00000039318 5859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Smim14Q91VT8 Adnp2-201ENSMUST00000066743 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.4 ms