Protein–RNA interactions for Protein: Q91V80

Apof, Apolipoprotein F, mousemouse

Predictions only

Length 315 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ApofQ91V80 Mfsd4b1-201ENSMUST00000163705 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ApofQ91V80 0610025J13Rik-203ENSMUST00000180374 713 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ApofQ91V80 Gm29246-201ENSMUST00000189221 349 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ApofQ91V80 AC153889.1-201ENSMUST00000219257 330 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
ApofQ91V80 Ank1-201ENSMUST00000033947 1030 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ApofQ91V80 Cldn19-201ENSMUST00000084309 924 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ApofQ91V80 Kcnq2-201ENSMUST00000016491 3067 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ApofQ91V80 Phtf1-201ENSMUST00000055425 3060 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ApofQ91V80 Cops7b-201ENSMUST00000027446 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ApofQ91V80 Gm6858-201ENSMUST00000208582 1468 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
ApofQ91V80 Hpca-203ENSMUST00000116442 1568 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ApofQ91V80 D17Wsu92e-203ENSMUST00000114863 3828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ApofQ91V80 Zfp865-203ENSMUST00000085427 2751 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ApofQ91V80 AC132265.1-201ENSMUST00000219233 1665 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
ApofQ91V80 Naprt-201ENSMUST00000023237 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ApofQ91V80 Zic3-202ENSMUST00000088629 1951 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ApofQ91V80 Vim-201ENSMUST00000028062 2193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ApofQ91V80 Cacna1c-216ENSMUST00000188522 7338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ApofQ91V80 Ube2i-207ENSMUST00000172868 2755 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ApofQ91V80 Sgpp1-201ENSMUST00000021450 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ApofQ91V80 Mpv17l-205ENSMUST00000143697 580 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ApofQ91V80 Snx15-207ENSMUST00000154601 767 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ApofQ91V80 Ahnak-201ENSMUST00000092955 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ApofQ91V80 Pla2g12b-201ENSMUST00000009790 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ApofQ91V80 Pmm1-201ENSMUST00000023112 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ApofQ91V80 Shd-201ENSMUST00000044216 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ApofQ91V80 Ginm1-201ENSMUST00000039763 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ApofQ91V80 Nox4-202ENSMUST00000068829 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ApofQ91V80 A230103J11Rik-202ENSMUST00000156084 2086 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ApofQ91V80 Clasrp-201ENSMUST00000086041 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ApofQ91V80 Scrt1-202ENSMUST00000164703 3478 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ApofQ91V80 Sept11-205ENSMUST00000201700 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ApofQ91V80 Chn1-209ENSMUST00000166199 3876 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ApofQ91V80 Ppfibp1-201ENSMUST00000016631 4851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ApofQ91V80 Rasgrp1-201ENSMUST00000102534 5229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ApofQ91V80 Col18a1-202ENSMUST00000081654 5063 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ApofQ91V80 Mtx2-201ENSMUST00000028511 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ApofQ91V80 Nsmf-207ENSMUST00000116574 2863 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
ApofQ91V80 Il3ra-203ENSMUST00000224163 2315 ntAPPRIS P2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
ApofQ91V80 Sh3gl2-203ENSMUST00000107188 2286 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ApofQ91V80 Gm17200-201ENSMUST00000170214 2022 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ApofQ91V80 N6amt1-201ENSMUST00000054442 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ApofQ91V80 Tubb4b-201ENSMUST00000043584 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ApofQ91V80 Gm40773-201ENSMUST00000218113 1502 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
ApofQ91V80 Pofut1-203ENSMUST00000099192 1385 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ApofQ91V80 Selenoh-201ENSMUST00000102646 783 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ApofQ91V80 Dguok-202ENSMUST00000113888 1007 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ApofQ91V80 Gm12216-201ENSMUST00000117316 1152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ApofQ91V80 Gm12895-201ENSMUST00000122214 226 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
ApofQ91V80 Dguok-201ENSMUST00000014698 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ApofQ91V80 Mthfsl-204ENSMUST00000186863 725 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
ApofQ91V80 Selenoh-206ENSMUST00000189988 390 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
ApofQ91V80 Gm38973-201ENSMUST00000206810 878 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ApofQ91V80 Mgst3-201ENSMUST00000028005 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ApofQ91V80 Tead3-205ENSMUST00000154873 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ApofQ91V80 Rasgrp2-201ENSMUST00000035716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
ApofQ91V80 Chga-201ENSMUST00000021610 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
ApofQ91V80 Sctr-202ENSMUST00000189037 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
ApofQ91V80 Eva1c-201ENSMUST00000037539 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
ApofQ91V80 Celf6-204ENSMUST00000121266 2610 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
ApofQ91V80 Nptx2-201ENSMUST00000071782 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
ApofQ91V80 Tbc1d12-201ENSMUST00000037302 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
ApofQ91V80 Zkscan8-202ENSMUST00000110481 728 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
ApofQ91V80 Chchd2-ps-201ENSMUST00000117487 462 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
ApofQ91V80 Gm15372-201ENSMUST00000120729 834 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
ApofQ91V80 Gm11729-201ENSMUST00000124901 713 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
ApofQ91V80 Flg-202ENSMUST00000178008 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
ApofQ91V80 Flg-205ENSMUST00000179250 765 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
ApofQ91V80 Flg-206ENSMUST00000179477 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
ApofQ91V80 Gm44454-201ENSMUST00000198541 138 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
ApofQ91V80 AC159641.1-201ENSMUST00000221117 177 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
ApofQ91V80 Cbr2-201ENSMUST00000026148 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
ApofQ91V80 Slc25a43-201ENSMUST00000047655 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
ApofQ91V80 Stk3-201ENSMUST00000018476 2914 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
ApofQ91V80 Katnbl1-201ENSMUST00000028552 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
ApofQ91V80 Gm15743-202ENSMUST00000182690 1901 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
ApofQ91V80 D430001F17Rik-201ENSMUST00000141344 1858 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
ApofQ91V80 Khsrp-201ENSMUST00000007814 3990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
ApofQ91V80 Rb1-201ENSMUST00000022701 4656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
ApofQ91V80 B3gnt6-201ENSMUST00000098278 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
ApofQ91V80 Ush1c-208ENSMUST00000177212 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
ApofQ91V80 Slc7a5-201ENSMUST00000045557 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
ApofQ91V80 Ostf1-201ENSMUST00000025631 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ApofQ91V80 Myo9b-206ENSMUST00000212935 6316 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
ApofQ91V80 Il7-203ENSMUST00000192202 2057 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ApofQ91V80 Prdm5-201ENSMUST00000031973 1488 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ApofQ91V80 Fam181a-203ENSMUST00000191218 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
ApofQ91V80 Anxa2-201ENSMUST00000034756 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ApofQ91V80 Shisa2-201ENSMUST00000053949 3119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ApofQ91V80 Cfap20-208ENSMUST00000213086 2544 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
ApofQ91V80 Tsnax-201ENSMUST00000075896 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ApofQ91V80 Sncaip-205ENSMUST00000178011 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ApofQ91V80 Nat9-203ENSMUST00000103040 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ApofQ91V80 Nat9-204ENSMUST00000103041 953 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
ApofQ91V80 Trmt112-202ENSMUST00000116551 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ApofQ91V80 Rasl2-9-201ENSMUST00000147835 1013 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
ApofQ91V80 Gm14964-202ENSMUST00000149574 716 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ApofQ91V80 Gm17092-201ENSMUST00000166606 698 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
ApofQ91V80 Gm7507-201ENSMUST00000183053 1008 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
ApofQ91V80 CAAA01066804.1-201ENSMUST00000217800 611 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.4 ms