Protein–RNA interactions for Protein: Q8VEG0

Ccdc71, Coiled-coil domain-containing protein 71, mousemouse

Predictions only

Length 433 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc71Q8VEG0 Rcc1-201ENSMUST00000030726 2278 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ccdc71Q8VEG0 Gm10300-201ENSMUST00000094662 2296 ntAPPRIS P1 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ccdc71Q8VEG0 Kifc3-203ENSMUST00000169748 3384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ccdc71Q8VEG0 Gstt2-201ENSMUST00000038257 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ccdc71Q8VEG0 Fam72a-201ENSMUST00000068613 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ccdc71Q8VEG0 Krt28-201ENSMUST00000006963 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ccdc71Q8VEG0 Fam43b-201ENSMUST00000105032 2437 ntAPPRIS P1 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ccdc71Q8VEG0 Pacsin3-202ENSMUST00000059566 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ccdc71Q8VEG0 Echdc2-201ENSMUST00000052999 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ccdc71Q8VEG0 Gm10518-201ENSMUST00000097454 1301 ntAPPRIS P1 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ccdc71Q8VEG0 Ginm1-201ENSMUST00000039763 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ccdc71Q8VEG0 Cep83-201ENSMUST00000020212 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ccdc71Q8VEG0 Camk2d-228ENSMUST00000200171 5396 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ccdc71Q8VEG0 Epo-202ENSMUST00000111038 855 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ccdc71Q8VEG0 Chchd7-203ENSMUST00000119307 889 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ccdc71Q8VEG0 Tex30-213ENSMUST00000156392 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ccdc71Q8VEG0 Mymx-202ENSMUST00000169137 616 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ccdc71Q8VEG0 Gm5682-201ENSMUST00000173402 505 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
Ccdc71Q8VEG0 Pmm1-202ENSMUST00000071462 1059 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ccdc71Q8VEG0 Gm10175-201ENSMUST00000086013 645 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
Ccdc71Q8VEG0 Alyref-201ENSMUST00000026125 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ccdc71Q8VEG0 Zbtb48-201ENSMUST00000066715 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ccdc71Q8VEG0 Hpn-201ENSMUST00000039435 1743 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ccdc71Q8VEG0 Casp9-201ENSMUST00000030747 3897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ccdc71Q8VEG0 Hs3st1-201ENSMUST00000053116 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ccdc71Q8VEG0 Gm8784-201ENSMUST00000222096 1435 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
Ccdc71Q8VEG0 Gpr150-201ENSMUST00000056130 2146 ntAPPRIS P1 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ccdc71Q8VEG0 Rnf128-201ENSMUST00000113026 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Ccdc71Q8VEG0 Cntln-201ENSMUST00000047023 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Ccdc71Q8VEG0 Ilkap-201ENSMUST00000027534 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Ccdc71Q8VEG0 Gjb1-203ENSMUST00000119190 1585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Ccdc71Q8VEG0 Ptpn2-201ENSMUST00000025420 1568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Ccdc71Q8VEG0 Garem1-201ENSMUST00000049260 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Ccdc71Q8VEG0 Mir22hg-202ENSMUST00000149940 1752 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Ccdc71Q8VEG0 Ndufs2-202ENSMUST00000111318 1545 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Ccdc71Q8VEG0 Gm16835-201ENSMUST00000140488 2809 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Ccdc71Q8VEG0 Nrros-203ENSMUST00000115165 2389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Ccdc71Q8VEG0 Dtx2-201ENSMUST00000005072 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Ccdc71Q8VEG0 Fam161a-205ENSMUST00000172602 1935 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Ccdc71Q8VEG0 Gm11467-201ENSMUST00000129407 674 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Ccdc71Q8VEG0 Pcp2-205ENSMUST00000142431 524 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Ccdc71Q8VEG0 Psma6-204ENSMUST00000163070 787 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Ccdc71Q8VEG0 Hsf4-203ENSMUST00000172525 1276 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Ccdc71Q8VEG0 Frmd5-213ENSMUST00000212518 922 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Ccdc71Q8VEG0 AC117588.1-201ENSMUST00000228510 999 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
Ccdc71Q8VEG0 Atp5o-201ENSMUST00000023677 838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Ccdc71Q8VEG0 Olfr30-201ENSMUST00000055204 1066 ntAPPRIS P1 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Ccdc71Q8VEG0 Psmb4-201ENSMUST00000005923 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Ccdc71Q8VEG0 Gbe1-206ENSMUST00000170464 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Ccdc71Q8VEG0 Cldn11-201ENSMUST00000046174 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Ccdc71Q8VEG0 Fam46b-201ENSMUST00000051676 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Ccdc71Q8VEG0 Fxr1-201ENSMUST00000001620 2459 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
Ccdc71Q8VEG0 Coil-201ENSMUST00000036649 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Ccdc71Q8VEG0 Wac-207ENSMUST00000167020 5208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Ccdc71Q8VEG0 Plekhf2-201ENSMUST00000054776 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Ccdc71Q8VEG0 Gm11841-201ENSMUST00000117060 1963 ntBASIC16.77■□□□□ 0.27
Ccdc71Q8VEG0 Rbpms-213ENSMUST00000191473 2547 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ccdc71Q8VEG0 Csnk1e-201ENSMUST00000117786 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ccdc71Q8VEG0 4933434E20Rik-203ENSMUST00000068798 1500 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ccdc71Q8VEG0 Glcci1-201ENSMUST00000064285 6200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ccdc71Q8VEG0 Lncpint-201ENSMUST00000115107 1676 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ccdc71Q8VEG0 Slc25a39-201ENSMUST00000018821 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ccdc71Q8VEG0 Nin-203ENSMUST00000095666 7183 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ccdc71Q8VEG0 Slc35g1-201ENSMUST00000054098 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ccdc71Q8VEG0 Gpr161-202ENSMUST00000178700 1827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ccdc71Q8VEG0 Tcp1-207ENSMUST00000143961 614 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ccdc71Q8VEG0 Gm25911-201ENSMUST00000157621 56 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Ccdc71Q8VEG0 Retsat-204ENSMUST00000176168 1203 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ccdc71Q8VEG0 Gm20680-201ENSMUST00000176881 789 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ccdc71Q8VEG0 1700025J12Rik-201ENSMUST00000205586 630 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ccdc71Q8VEG0 Ppp1r3f-201ENSMUST00000115742 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ccdc71Q8VEG0 Syt3-202ENSMUST00000118962 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ccdc71Q8VEG0 Ank1-207ENSMUST00000118733 8201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ccdc71Q8VEG0 Tstd3-201ENSMUST00000029915 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ccdc71Q8VEG0 Map3k1-201ENSMUST00000109267 6978 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ccdc71Q8VEG0 Magi3-203ENSMUST00000122303 3827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ccdc71Q8VEG0 Cul4a-201ENSMUST00000016680 3728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ccdc71Q8VEG0 9330160F10Rik-201ENSMUST00000101007 2766 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Ccdc71Q8VEG0 Sptbn4-201ENSMUST00000011895 8747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ccdc71Q8VEG0 Btf3-204ENSMUST00000134542 780 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ccdc71Q8VEG0 Gm11455-201ENSMUST00000149285 733 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ccdc71Q8VEG0 Tmem9-205ENSMUST00000165125 901 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ccdc71Q8VEG0 Gm20478-201ENSMUST00000173648 1031 ntTSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ccdc71Q8VEG0 Ighv1-15-201ENSMUST00000192077 351 ntAPPRIS P1 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ccdc71Q8VEG0 Gm10419-203ENSMUST00000197854 653 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ccdc71Q8VEG0 1110035H17Rik-202ENSMUST00000205672 1231 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Ccdc71Q8VEG0 Ly6k-201ENSMUST00000060301 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ccdc71Q8VEG0 Rnf7-202ENSMUST00000071301 334 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ccdc71Q8VEG0 Crb3-201ENSMUST00000071826 1194 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ccdc71Q8VEG0 1500035N22Rik-201ENSMUST00000075081 865 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ccdc71Q8VEG0 Olfr1272-201ENSMUST00000099750 927 ntAPPRIS P1 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ccdc71Q8VEG0 Agk-201ENSMUST00000031977 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ccdc71Q8VEG0 Ddx59-201ENSMUST00000027655 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ccdc71Q8VEG0 Klf3-201ENSMUST00000165536 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ccdc71Q8VEG0 Lypd1-205ENSMUST00000162899 1511 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ccdc71Q8VEG0 Il17re-203ENSMUST00000101065 1973 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ccdc71Q8VEG0 Yipf4-201ENSMUST00000024873 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ccdc71Q8VEG0 Dph1-201ENSMUST00000044949 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ccdc71Q8VEG0 Trabd-201ENSMUST00000081702 2439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ccdc71Q8VEG0 Polr3e-203ENSMUST00000207481 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.1 ms