Protein–RNA interactions for Protein: Q8VCS3

Fam20b, Glycosaminoglycan xylosylkinase, mousemouse

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Length 409 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fam20bQ8VCS3 Bnc1-201ENSMUST00000026096 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Fam20bQ8VCS3 Sfrp4-201ENSMUST00000002883 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Fam20bQ8VCS3 Usb1-201ENSMUST00000034245 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Fam20bQ8VCS3 Ube2d3-208ENSMUST00000197134 2493 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Fam20bQ8VCS3 Svip-201ENSMUST00000098414 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Fam20bQ8VCS3 Fam84b-201ENSMUST00000100635 5565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Fam20bQ8VCS3 Mbp-206ENSMUST00000102812 2108 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Fam20bQ8VCS3 Ruvbl2-205ENSMUST00000211214 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Fam20bQ8VCS3 Zswim1-201ENSMUST00000017908 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Fam20bQ8VCS3 Rassf3-201ENSMUST00000026902 3522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Fam20bQ8VCS3 Atp2b3-203ENSMUST00000114479 4637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Fam20bQ8VCS3 Mast3-201ENSMUST00000166004 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Fam20bQ8VCS3 Disc1-206ENSMUST00000118942 2860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Fam20bQ8VCS3 I0C0044D17Rik-201ENSMUST00000097964 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Fam20bQ8VCS3 Pbx4-201ENSMUST00000081503 1560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Fam20bQ8VCS3 Tmem201-201ENSMUST00000054459 4631 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Fam20bQ8VCS3 Gm9917-202ENSMUST00000181099 1499 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Fam20bQ8VCS3 Rilpl2-201ENSMUST00000031347 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Fam20bQ8VCS3 Josd2-204ENSMUST00000118628 864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Fam20bQ8VCS3 Gm6270-201ENSMUST00000132731 559 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Fam20bQ8VCS3 Crybb1-201ENSMUST00000031286 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Fam20bQ8VCS3 Josd2-201ENSMUST00000035844 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Fam20bQ8VCS3 Vgll2-201ENSMUST00000058347 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Fam20bQ8VCS3 Tpsb2-201ENSMUST00000069616 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Fam20bQ8VCS3 Runx2-202ENSMUST00000113571 5898 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Fam20bQ8VCS3 Dpysl3-204ENSMUST00000121805 5484 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Fam20bQ8VCS3 Kcnh1-202ENSMUST00000110844 7161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Fam20bQ8VCS3 Hnrnpul1-205ENSMUST00000206832 3784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Fam20bQ8VCS3 Sik2-201ENSMUST00000041375 3552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Fam20bQ8VCS3 Tpm4-201ENSMUST00000003575 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Fam20bQ8VCS3 B4galt7-201ENSMUST00000064701 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Fam20bQ8VCS3 Irf3-213ENSMUST00000209066 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Fam20bQ8VCS3 Tprn-201ENSMUST00000114336 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Fam20bQ8VCS3 Mib1-201ENSMUST00000052838 10231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Fam20bQ8VCS3 Adipor1-202ENSMUST00000112237 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Fam20bQ8VCS3 Pmpca-201ENSMUST00000076431 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Fam20bQ8VCS3 Slc25a29-201ENSMUST00000021693 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Fam20bQ8VCS3 Hsdl2-201ENSMUST00000030078 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Fam20bQ8VCS3 Nrg1-218ENSMUST00000209107 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Fam20bQ8VCS3 Taf6l-206ENSMUST00000176610 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Fam20bQ8VCS3 Dap-201ENSMUST00000044524 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Fam20bQ8VCS3 Ndufaf3-201ENSMUST00000074208 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Fam20bQ8VCS3 Gm17200-201ENSMUST00000170214 2022 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Fam20bQ8VCS3 Zfp865-201ENSMUST00000076251 7503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Fam20bQ8VCS3 Pitx3-201ENSMUST00000026259 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Fam20bQ8VCS3 Paqr3-201ENSMUST00000069453 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Fam20bQ8VCS3 Mphosph8-201ENSMUST00000116468 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Fam20bQ8VCS3 Gm12527-201ENSMUST00000117967 564 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Fam20bQ8VCS3 Gm15375-201ENSMUST00000119510 849 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Fam20bQ8VCS3 Gm12669-201ENSMUST00000122162 1009 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Fam20bQ8VCS3 Ndufa6-201ENSMUST00000023085 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Fam20bQ8VCS3 Tmem126a-201ENSMUST00000032844 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Fam20bQ8VCS3 Ankrd10-201ENSMUST00000033905 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Fam20bQ8VCS3 Gm26592-201ENSMUST00000180870 1730 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Fam20bQ8VCS3 Rmdn1-201ENSMUST00000029888 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Fam20bQ8VCS3 Noc4l-201ENSMUST00000042147 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Fam20bQ8VCS3 Dgkq-201ENSMUST00000053913 4938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Fam20bQ8VCS3 Bnip2-202ENSMUST00000085393 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Fam20bQ8VCS3 Dio3-201ENSMUST00000097228 1449 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Fam20bQ8VCS3 AU022751-202ENSMUST00000117544 2201 ntAPPRIS P4 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Fam20bQ8VCS3 B3gnt5-202ENSMUST00000119468 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Fam20bQ8VCS3 Spata18-202ENSMUST00000071077 1978 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Fam20bQ8VCS3 Bag4-201ENSMUST00000038498 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Fam20bQ8VCS3 D330023K18Rik-201ENSMUST00000133550 920 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Fam20bQ8VCS3 Gm27275-201ENSMUST00000184318 272 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Fam20bQ8VCS3 Pxn-201ENSMUST00000067268 3706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Fam20bQ8VCS3 March3-202ENSMUST00000102912 1754 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Fam20bQ8VCS3 Nrxn1-209ENSMUST00000161402 4953 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Fam20bQ8VCS3 Kmt5b-206ENSMUST00000113973 6130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
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Fam20bQ8VCS3 Cldn5-201ENSMUST00000043577 1414 ntAPPRIS P1 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Fam20bQ8VCS3 Slc9a3r1-201ENSMUST00000021077 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Fam20bQ8VCS3 Tes-202ENSMUST00000115467 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Fam20bQ8VCS3 Rnf145-201ENSMUST00000019333 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Fam20bQ8VCS3 Pfkfb4-201ENSMUST00000051873 3316 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Fam20bQ8VCS3 Sybu-209ENSMUST00000228639 4113 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Fam20bQ8VCS3 Mrpl49-201ENSMUST00000007482 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Fam20bQ8VCS3 Tmx4-203ENSMUST00000110120 2602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Fam20bQ8VCS3 Nhlrc4-201ENSMUST00000085027 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Fam20bQ8VCS3 Cadps2-206ENSMUST00000115361 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Fam20bQ8VCS3 Pex1-202ENSMUST00000121291 4555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Fam20bQ8VCS3 Barhl1-201ENSMUST00000050776 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Fam20bQ8VCS3 Rbmxl1-202ENSMUST00000211719 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Fam20bQ8VCS3 Rpl5-201ENSMUST00000082223 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Fam20bQ8VCS3 Kcnc1-201ENSMUST00000025202 7760 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Fam20bQ8VCS3 Adgrl1-210ENSMUST00000152978 5734 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Fam20bQ8VCS3 Rabggta-201ENSMUST00000062861 2338 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Fam20bQ8VCS3 Acss3-201ENSMUST00000044668 2494 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Fam20bQ8VCS3 Prss53-202ENSMUST00000205300 1662 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Fam20bQ8VCS3 Prmt1-201ENSMUST00000045325 1071 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Fam20bQ8VCS3 Theg-202ENSMUST00000077433 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Fam20bQ8VCS3 Cpeb2-205ENSMUST00000169035 7050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Fam20bQ8VCS3 Zfp423-202ENSMUST00000109655 4907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Fam20bQ8VCS3 Ambra1-205ENSMUST00000111317 4929 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Fam20bQ8VCS3 Cacnb4-201ENSMUST00000078324 8225 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Fam20bQ8VCS3 Dclk2-201ENSMUST00000029719 4012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Fam20bQ8VCS3 Hdhd2-202ENSMUST00000097521 1716 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
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Fam20bQ8VCS3 Myb-203ENSMUST00000188495 3693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Fam20bQ8VCS3 App-202ENSMUST00000226232 3120 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
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