Protein–RNA interactions for Protein: Q8VBW6

Nae1, NEDD8-activating enzyme E1 regulatory subunit, mousemouse

Predictions only

Length 534 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nae1Q8VBW6 Ggnbp1-201ENSMUST00000053683 1525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Nae1Q8VBW6 Snph-203ENSMUST00000109875 4910 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Nae1Q8VBW6 Dok3-202ENSMUST00000223563 1644 ntAPPRIS P1 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Nae1Q8VBW6 Mtx2-201ENSMUST00000028511 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Nae1Q8VBW6 Slc1a6-201ENSMUST00000005490 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Nae1Q8VBW6 Gm13283-201ENSMUST00000191112 1463 ntAPPRIS P1 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Nae1Q8VBW6 Crem-228ENSMUST00000150235 2662 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Nae1Q8VBW6 Kctd6-202ENSMUST00000170111 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Nae1Q8VBW6 Ube2d3-202ENSMUST00000166033 2504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Nae1Q8VBW6 Sbk2-202ENSMUST00000182214 2236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Nae1Q8VBW6 Rnf121-202ENSMUST00000096639 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Nae1Q8VBW6 Kcnq2-204ENSMUST00000103047 2899 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Nae1Q8VBW6 Eda-202ENSMUST00000113775 5088 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Nae1Q8VBW6 A230103J11Rik-202ENSMUST00000156084 2086 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Nae1Q8VBW6 Slc25a39-201ENSMUST00000018821 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Nae1Q8VBW6 Cacna1b-204ENSMUST00000102939 9736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Nae1Q8VBW6 Gm14859-201ENSMUST00000117752 357 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Nae1Q8VBW6 Gm15295-201ENSMUST00000139874 488 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Nae1Q8VBW6 Gm15890-201ENSMUST00000161024 770 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Nae1Q8VBW6 Gm26644-201ENSMUST00000181365 958 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Nae1Q8VBW6 Gm27742-201ENSMUST00000184667 60 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Nae1Q8VBW6 Snhg10-202ENSMUST00000222812 527 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Nae1Q8VBW6 Tesc-201ENSMUST00000031304 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Nae1Q8VBW6 Gfra4-202ENSMUST00000066958 783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Nae1Q8VBW6 Paox-202ENSMUST00000097967 1024 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Nae1Q8VBW6 Gm26752-201ENSMUST00000181086 1537 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Nae1Q8VBW6 Snap91-204ENSMUST00000098495 4150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Nae1Q8VBW6 Ep300-201ENSMUST00000068387 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Nae1Q8VBW6 Ptn-201ENSMUST00000101534 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Nae1Q8VBW6 Ap1s1-201ENSMUST00000111080 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Nae1Q8VBW6 Chic2-201ENSMUST00000075452 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Nae1Q8VBW6 Map2k5-201ENSMUST00000034920 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Nae1Q8VBW6 Hebp2-203ENSMUST00000214548 2083 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Nae1Q8VBW6 Atp2b2-201ENSMUST00000089003 7067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Nae1Q8VBW6 Zfp281-201ENSMUST00000047734 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Nae1Q8VBW6 Evx1-201ENSMUST00000031787 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Nae1Q8VBW6 Tacc1-201ENSMUST00000084030 7788 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Nae1Q8VBW6 Gm13446-201ENSMUST00000124555 2033 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Nae1Q8VBW6 Mfsd10-203ENSMUST00000114331 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Nae1Q8VBW6 Bcr-201ENSMUST00000164107 6839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Nae1Q8VBW6 Galnt13-204ENSMUST00000112636 7530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Nae1Q8VBW6 Sept8-201ENSMUST00000108987 4436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Nae1Q8VBW6 Homer2-206ENSMUST00000207983 1634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Nae1Q8VBW6 Olfr129-201ENSMUST00000122318 993 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Nae1Q8VBW6 Ramp2-204ENSMUST00000129680 1178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Nae1Q8VBW6 Psme2-208ENSMUST00000161807 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Nae1Q8VBW6 Mrpl36-202ENSMUST00000221730 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Nae1Q8VBW6 AC130671.1-201ENSMUST00000227384 1237 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Nae1Q8VBW6 Cdc23-201ENSMUST00000025228 2084 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Nae1Q8VBW6 Gss-203ENSMUST00000130881 1724 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Nae1Q8VBW6 Fam120c-201ENSMUST00000073364 5463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Nae1Q8VBW6 E130307A14Rik-213ENSMUST00000155482 2803 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Nae1Q8VBW6 Dtx2-202ENSMUST00000111142 2650 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Nae1Q8VBW6 Fancg-201ENSMUST00000030165 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Nae1Q8VBW6 Hnrnpa1-202ENSMUST00000087351 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Nae1Q8VBW6 Irf7-202ENSMUST00000097952 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Nae1Q8VBW6 Fam76a-202ENSMUST00000097856 1863 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Nae1Q8VBW6 Dohh-201ENSMUST00000072751 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Nae1Q8VBW6 Dennd4b-202ENSMUST00000129564 5647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Nae1Q8VBW6 Syt3-202ENSMUST00000118962 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Nae1Q8VBW6 Spock3-204ENSMUST00000119068 3201 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Nae1Q8VBW6 Emc8-201ENSMUST00000034277 4942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Nae1Q8VBW6 Tfap2b-202ENSMUST00000064976 1946 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Nae1Q8VBW6 Znhit1-203ENSMUST00000111090 698 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Nae1Q8VBW6 Gm14464-201ENSMUST00000119658 1254 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Nae1Q8VBW6 Npcd-201ENSMUST00000023060 1162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Nae1Q8VBW6 Was-201ENSMUST00000033505 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Nae1Q8VBW6 Cfap20-208ENSMUST00000213086 2544 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Nae1Q8VBW6 Ptprd-206ENSMUST00000107289 9899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Nae1Q8VBW6 Gm9889-202ENSMUST00000206983 1577 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Nae1Q8VBW6 Fam221a-201ENSMUST00000060561 2730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Nae1Q8VBW6 Slc38a10-203ENSMUST00000076697 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Nae1Q8VBW6 Pprc1-203ENSMUST00000111899 5246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Nae1Q8VBW6 Fip1l1-203ENSMUST00000113535 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Nae1Q8VBW6 A930003O13Rik-203ENSMUST00000199056 1955 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Nae1Q8VBW6 Klhdc4-201ENSMUST00000045884 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Nae1Q8VBW6 Sgsm2-202ENSMUST00000081799 4873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Nae1Q8VBW6 Pigl-201ENSMUST00000014389 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Nae1Q8VBW6 Fam178b-202ENSMUST00000170295 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Nae1Q8VBW6 Acsl3-205ENSMUST00000142704 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Nae1Q8VBW6 Il6st-208ENSMUST00000184311 2985 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Nae1Q8VBW6 Lmo4-202ENSMUST00000121112 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Nae1Q8VBW6 Klhl33-202ENSMUST00000170855 1422 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Nae1Q8VBW6 Cidec-202ENSMUST00000113089 1720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Nae1Q8VBW6 Uts2r-201ENSMUST00000039044 1703 ntAPPRIS P1 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Nae1Q8VBW6 4930448E22Rik-202ENSMUST00000215242 2102 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Nae1Q8VBW6 Fbxl12os-202ENSMUST00000136376 2349 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Nae1Q8VBW6 P2rx4-201ENSMUST00000031429 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Nae1Q8VBW6 Simc1-202ENSMUST00000121401 4819 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Nae1Q8VBW6 Cnksr2-201ENSMUST00000026750 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Nae1Q8VBW6 Wscd1-202ENSMUST00000108510 2956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Nae1Q8VBW6 Hivep3-201ENSMUST00000084306 2973 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Nae1Q8VBW6 Pgap2-203ENSMUST00000120119 1979 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Nae1Q8VBW6 Mir22hg-202ENSMUST00000149940 1752 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Nae1Q8VBW6 Tekt5-202ENSMUST00000115831 1277 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Nae1Q8VBW6 Aicda-202ENSMUST00000160685 1292 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Nae1Q8VBW6 Gm7367-201ENSMUST00000057611 492 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Nae1Q8VBW6 S100a16-202ENSMUST00000098911 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Nae1Q8VBW6 Gdf5-201ENSMUST00000040162 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Nae1Q8VBW6 Gpr150-201ENSMUST00000056130 2146 ntAPPRIS P1 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.7 ms