Protein–RNA interactions for Protein: Q8VBW5

Bbx, HMG box transcription factor BBX, mousemouse

Predictions only

Length 907 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BbxQ8VBW5 H2-Q6-201ENSMUST00000113879 981 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
BbxQ8VBW5 Lyzl4-202ENSMUST00000120918 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
BbxQ8VBW5 Ptf1aos-201ENSMUST00000122978 916 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
BbxQ8VBW5 AC120002.2-201ENSMUST00000220205 773 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
BbxQ8VBW5 Rundc3b-201ENSMUST00000047485 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
BbxQ8VBW5 Mtif3-201ENSMUST00000016654 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
BbxQ8VBW5 4932422M17Rik-201ENSMUST00000195992 2639 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
BbxQ8VBW5 Comtd1-202ENSMUST00000124549 2314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
BbxQ8VBW5 Rassf3-201ENSMUST00000026902 3522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
BbxQ8VBW5 Tmprss5-201ENSMUST00000070390 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
BbxQ8VBW5 Gm20628-201ENSMUST00000177363 3215 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
BbxQ8VBW5 Tbc1d9-201ENSMUST00000034145 4631 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
BbxQ8VBW5 Pias4-201ENSMUST00000005064 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
BbxQ8VBW5 Fosl1-201ENSMUST00000025850 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
BbxQ8VBW5 Qprt-201ENSMUST00000032912 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
BbxQ8VBW5 Ppp2r2d-207ENSMUST00000155672 1938 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
BbxQ8VBW5 Plac9a-201ENSMUST00000052286 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
BbxQ8VBW5 Mycl-201ENSMUST00000030407 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
BbxQ8VBW5 Asic4-201ENSMUST00000037708 2464 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
BbxQ8VBW5 Rbpms-203ENSMUST00000053251 2466 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
BbxQ8VBW5 Dph1-201ENSMUST00000044949 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
BbxQ8VBW5 Mfsd4b1-201ENSMUST00000163705 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
BbxQ8VBW5 Pid1-201ENSMUST00000168574 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
BbxQ8VBW5 Sgta-201ENSMUST00000005067 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
BbxQ8VBW5 Steap1-201ENSMUST00000015796 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
BbxQ8VBW5 AC124601.2-201ENSMUST00000222888 759 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
BbxQ8VBW5 Gm8994-201ENSMUST00000077886 1236 ntAPPRIS P1 BASIC17.92■□□□□ 0.46
BbxQ8VBW5 Hif3a-201ENSMUST00000037762 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
BbxQ8VBW5 Acap3-201ENSMUST00000079031 4301 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
BbxQ8VBW5 Fam185a-201ENSMUST00000056045 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
BbxQ8VBW5 Dlk2-202ENSMUST00000166280 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
BbxQ8VBW5 Trappc3-201ENSMUST00000030660 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
BbxQ8VBW5 Hand1-201ENSMUST00000036917 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
BbxQ8VBW5 Chn1-209ENSMUST00000166199 3876 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
BbxQ8VBW5 Men1-205ENSMUST00000113501 2508 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
BbxQ8VBW5 Hyls1-201ENSMUST00000115110 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
BbxQ8VBW5 Ctsf-201ENSMUST00000119694 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
BbxQ8VBW5 Fam219b-202ENSMUST00000114200 3017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
BbxQ8VBW5 Mst1-204ENSMUST00000162886 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
BbxQ8VBW5 Nudt16-201ENSMUST00000035179 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
BbxQ8VBW5 Gm26580-201ENSMUST00000181002 2095 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
BbxQ8VBW5 Slc30a10-201ENSMUST00000061093 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
BbxQ8VBW5 Gm2431-201ENSMUST00000171531 519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
BbxQ8VBW5 Stard3nl-208ENSMUST00000200323 1128 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
BbxQ8VBW5 Gm18959-201ENSMUST00000208954 655 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
BbxQ8VBW5 Mgst3-201ENSMUST00000028005 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
BbxQ8VBW5 Tmem205-201ENSMUST00000046831 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
BbxQ8VBW5 Lsm10-201ENSMUST00000055575 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
BbxQ8VBW5 Kcnk4-201ENSMUST00000025908 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
BbxQ8VBW5 Slc35f1-201ENSMUST00000105473 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
BbxQ8VBW5 Ccdc166-202ENSMUST00000183130 1563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
BbxQ8VBW5 Kdr-201ENSMUST00000113516 5924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
BbxQ8VBW5 Gpr137b-201ENSMUST00000021738 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
BbxQ8VBW5 Mypopos-202ENSMUST00000205975 2321 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
BbxQ8VBW5 Lrrc36-206ENSMUST00000216765 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
BbxQ8VBW5 E030042O20Rik-201ENSMUST00000135244 1427 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
BbxQ8VBW5 Sgpp1-201ENSMUST00000021450 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
BbxQ8VBW5 Prss53-202ENSMUST00000205300 1662 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
BbxQ8VBW5 Vangl2-202ENSMUST00000111263 6528 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
BbxQ8VBW5 Nupl2-201ENSMUST00000049887 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
BbxQ8VBW5 Slc29a1-202ENSMUST00000064889 1988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
BbxQ8VBW5 Papolb-201ENSMUST00000099400 4239 ntAPPRIS P1 BASIC17.9■□□□□ 0.46
BbxQ8VBW5 Gm10013-201ENSMUST00000106074 672 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
BbxQ8VBW5 Anapc13-203ENSMUST00000188398 727 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
BbxQ8VBW5 Ndufa12-201ENSMUST00000020209 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
BbxQ8VBW5 Krt88-201ENSMUST00000023781 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
BbxQ8VBW5 Sirpa-202ENSMUST00000099113 3342 ntTSL 3 BASIC17.9■□□□□ 0.46
BbxQ8VBW5 Cdh24-201ENSMUST00000067784 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
BbxQ8VBW5 Foxl1-201ENSMUST00000181609 2705 ntAPPRIS P1 BASIC17.9■□□□□ 0.46
BbxQ8VBW5 Pprc1-203ENSMUST00000111899 5246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
BbxQ8VBW5 Dnaaf3-201ENSMUST00000094897 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
BbxQ8VBW5 Gm5414-201ENSMUST00000062879 1659 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
BbxQ8VBW5 Tsc22d2-201ENSMUST00000099090 9799 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.89■□□□□ 0.45
BbxQ8VBW5 Mms22l-202ENSMUST00000108222 4478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
BbxQ8VBW5 Ankrd44-210ENSMUST00000179030 6140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
BbxQ8VBW5 Eif4g3-203ENSMUST00000084215 8134 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
BbxQ8VBW5 Arhgef9-216ENSMUST00000197206 2227 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
BbxQ8VBW5 Gm13216-201ENSMUST00000117145 591 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
BbxQ8VBW5 Gm4316-202ENSMUST00000212490 1115 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
BbxQ8VBW5 Nkx2-9-201ENSMUST00000072631 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
BbxQ8VBW5 Pi4kb-202ENSMUST00000107251 2895 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
BbxQ8VBW5 Rusc1-203ENSMUST00000166687 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
BbxQ8VBW5 Sec14l1-203ENSMUST00000103026 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
BbxQ8VBW5 Mdm1-204ENSMUST00000169817 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
BbxQ8VBW5 Notch3-201ENSMUST00000087723 8044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
BbxQ8VBW5 Timm44-201ENSMUST00000003029 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
BbxQ8VBW5 Tmem47-203ENSMUST00000171953 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
BbxQ8VBW5 Mapk8ip3-201ENSMUST00000088345 5543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
BbxQ8VBW5 Abhd11-206ENSMUST00000154469 1473 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
BbxQ8VBW5 Pacsin3-202ENSMUST00000059566 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
BbxQ8VBW5 Snx16-201ENSMUST00000029047 2288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
BbxQ8VBW5 Kctd1-202ENSMUST00000168989 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
BbxQ8VBW5 Zmynd11-204ENSMUST00000110635 3881 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
BbxQ8VBW5 Klf15-202ENSMUST00000113530 2374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
BbxQ8VBW5 Matr3-214ENSMUST00000190029 2845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
BbxQ8VBW5 Nsmf-207ENSMUST00000116574 2863 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
BbxQ8VBW5 Large2-215ENSMUST00000176810 2477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
BbxQ8VBW5 Cblb-201ENSMUST00000114471 6648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
BbxQ8VBW5 Opn4-202ENSMUST00000168444 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
BbxQ8VBW5 Cog6-204ENSMUST00000193432 2078 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.5 ms