Protein–RNA interactions for Protein: Q8R2N2

Utp4, U3 small nucleolar RNA-associated protein 4 homolog, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 686 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Utp4Q8R2N2 Erlec1-201ENSMUST00000073192 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Utp4Q8R2N2 Acap3-202ENSMUST00000105584 4365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Utp4Q8R2N2 Homer2-206ENSMUST00000207983 1634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Utp4Q8R2N2 Coq6-201ENSMUST00000021661 1602 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Utp4Q8R2N2 Parg-201ENSMUST00000022470 4413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Utp4Q8R2N2 March8-201ENSMUST00000079012 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Utp4Q8R2N2 Wwox-207ENSMUST00000160862 1715 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Utp4Q8R2N2 D930048G16Rik-201ENSMUST00000180975 2266 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Utp4Q8R2N2 Gatc-201ENSMUST00000139167 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Utp4Q8R2N2 Gm26697-201ENSMUST00000180898 1760 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Utp4Q8R2N2 E330011M16Rik-201ENSMUST00000193614 1794 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Utp4Q8R2N2 Gm13186-201ENSMUST00000118031 316 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Utp4Q8R2N2 Gm14464-201ENSMUST00000119658 1254 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Utp4Q8R2N2 Gm17949-201ENSMUST00000210548 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Utp4Q8R2N2 AC112142.1-201ENSMUST00000228796 918 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Utp4Q8R2N2 Lat-201ENSMUST00000032997 1235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Utp4Q8R2N2 Adgra3-201ENSMUST00000030971 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Utp4Q8R2N2 Ocln-205ENSMUST00000160859 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Utp4Q8R2N2 Opa3-202ENSMUST00000161711 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Utp4Q8R2N2 Atp8b1-201ENSMUST00000025482 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Utp4Q8R2N2 Strn4-202ENSMUST00000108495 3082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Utp4Q8R2N2 Hs3st5-201ENSMUST00000058738 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Utp4Q8R2N2 Zbtb4-201ENSMUST00000108638 2552 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Utp4Q8R2N2 Smad1-203ENSMUST00000109885 3775 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Utp4Q8R2N2 Mrps2-201ENSMUST00000038600 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Utp4Q8R2N2 P2ry2-206ENSMUST00000208340 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Utp4Q8R2N2 Dnajc2-201ENSMUST00000030771 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Utp4Q8R2N2 Etnk1-201ENSMUST00000032413 6433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Utp4Q8R2N2 Isoc2a-201ENSMUST00000125249 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Utp4Q8R2N2 Zswim8-201ENSMUST00000022358 6073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Utp4Q8R2N2 Smarcc1-204ENSMUST00000197984 3538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Utp4Q8R2N2 Smox-203ENSMUST00000110180 1617 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Utp4Q8R2N2 Mphosph8-201ENSMUST00000116468 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Utp4Q8R2N2 Cd82-205ENSMUST00000116457 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Utp4Q8R2N2 R74862-202ENSMUST00000133630 2482 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Utp4Q8R2N2 Ccdc158-204ENSMUST00000151180 3352 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Utp4Q8R2N2 N6amt1-201ENSMUST00000054442 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Utp4Q8R2N2 Prodh2-201ENSMUST00000058280 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Utp4Q8R2N2 Ntn1-202ENSMUST00000108674 5874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Utp4Q8R2N2 Cdk12-203ENSMUST00000107539 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Utp4Q8R2N2 Mrs2-201ENSMUST00000021772 7035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Utp4Q8R2N2 Tpm2-202ENSMUST00000107913 2098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Utp4Q8R2N2 Gm44729-201ENSMUST00000206759 2052 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Utp4Q8R2N2 Cacna1a-201ENSMUST00000121390 7926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Utp4Q8R2N2 Sik3-204ENSMUST00000126865 6287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Utp4Q8R2N2 Cyp4f41-ps-201ENSMUST00000126790 1077 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Utp4Q8R2N2 B430219N15Rik-201ENSMUST00000147230 835 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
Utp4Q8R2N2 Myo5a-214ENSMUST00000155282 6372 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Utp4Q8R2N2 Vps51-209ENSMUST00000160590 840 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Utp4Q8R2N2 Slc25a41-202ENSMUST00000169012 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Utp4Q8R2N2 Tsc22d2-203ENSMUST00000199164 4659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Utp4Q8R2N2 AL731706.1-201ENSMUST00000227806 944 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.06■□□□□ 0
Utp4Q8R2N2 Tmem239-201ENSMUST00000055421 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Utp4Q8R2N2 BC048679-201ENSMUST00000073406 522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Utp4Q8R2N2 Gm10501-201ENSMUST00000151136 2200 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
Utp4Q8R2N2 Smarcd1-201ENSMUST00000023759 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Utp4Q8R2N2 4933428P19Rik-201ENSMUST00000199616 1376 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Utp4Q8R2N2 Tekt1-202ENSMUST00000108502 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Utp4Q8R2N2 Wipi1-201ENSMUST00000047186 3338 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Utp4Q8R2N2 E2f2-201ENSMUST00000061721 4739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Utp4Q8R2N2 Nhsl1-209ENSMUST00000207038 4854 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Utp4Q8R2N2 Nectin2-201ENSMUST00000075447 2735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Utp4Q8R2N2 Lias-202ENSMUST00000122026 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Utp4Q8R2N2 Hsf4-201ENSMUST00000036127 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Utp4Q8R2N2 Soga3-201ENSMUST00000092629 4105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Utp4Q8R2N2 Rassf1-204ENSMUST00000122225 1783 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Utp4Q8R2N2 Zbtb7c-201ENSMUST00000058997 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Utp4Q8R2N2 Camkv-201ENSMUST00000035700 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Utp4Q8R2N2 Abhd3-203ENSMUST00000117828 1962 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Utp4Q8R2N2 Tex19.2-201ENSMUST00000039146 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Utp4Q8R2N2 Klf13-201ENSMUST00000063694 6396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Utp4Q8R2N2 Gabpa-201ENSMUST00000009120 4987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Utp4Q8R2N2 Aifm1-202ENSMUST00000114945 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
Utp4Q8R2N2 Dnajb12-201ENSMUST00000020309 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Utp4Q8R2N2 Fam81a-201ENSMUST00000034749 3703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Utp4Q8R2N2 Myo5b-201ENSMUST00000074157 6745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Utp4Q8R2N2 Rcc2-202ENSMUST00000071169 3999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Utp4Q8R2N2 Ccdc13-202ENSMUST00000135986 2640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
Utp4Q8R2N2 Ctage5-213ENSMUST00000176464 4434 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
Utp4Q8R2N2 Prmt6-203ENSMUST00000190378 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Utp4Q8R2N2 Gm15556-201ENSMUST00000122904 663 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Utp4Q8R2N2 Gm16127-201ENSMUST00000131619 234 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Utp4Q8R2N2 Gm21814-202ENSMUST00000203277 873 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Utp4Q8R2N2 2310033P09Rik-201ENSMUST00000020719 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Utp4Q8R2N2 Pgpep1-208ENSMUST00000211715 676 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
Utp4Q8R2N2 Pigf-201ENSMUST00000024957 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Utp4Q8R2N2 Nme2-202ENSMUST00000072566 734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Utp4Q8R2N2 Mpdu1-201ENSMUST00000018905 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Utp4Q8R2N2 Shq1-202ENSMUST00000113312 6816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Utp4Q8R2N2 Slc8a3-202ENSMUST00000085238 4927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Utp4Q8R2N2 Ip6k2-206ENSMUST00000193560 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Utp4Q8R2N2 Irf7-202ENSMUST00000097952 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Utp4Q8R2N2 Fam120c-201ENSMUST00000073364 5463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Utp4Q8R2N2 Galt-202ENSMUST00000108038 1859 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
Utp4Q8R2N2 B4galt3-201ENSMUST00000064272 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Utp4Q8R2N2 Slc23a3-201ENSMUST00000027405 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Utp4Q8R2N2 Snx30-201ENSMUST00000030080 7314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Utp4Q8R2N2 Zfp553-201ENSMUST00000056232 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Utp4Q8R2N2 Tead4-201ENSMUST00000006311 3076 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Utp4Q8R2N2 Ppfibp1-201ENSMUST00000016631 4851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.4 ms