Protein–RNA interactions for Protein: Q8K349

Gimap6, GTPase IMAP family member 6, mousemouse

Predictions only

Length 305 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gimap6Q8K349 Map7-201ENSMUST00000020173 4252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Gimap6Q8K349 Wdr45-201ENSMUST00000043045 1609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Gimap6Q8K349 Camk2d-228ENSMUST00000200171 5396 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Gimap6Q8K349 Ppp1r13b-201ENSMUST00000054815 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Gimap6Q8K349 Rabepk-202ENSMUST00000113086 1106 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Gimap6Q8K349 Gm11795-201ENSMUST00000127180 396 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Gimap6Q8K349 Gm15706-201ENSMUST00000139612 899 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
Gimap6Q8K349 Pantr2-201ENSMUST00000180589 463 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
Gimap6Q8K349 Gm45167-201ENSMUST00000208007 322 ntBASIC21.3■■□□□ 1
Gimap6Q8K349 Syce1l-204ENSMUST00000212269 753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Gimap6Q8K349 Gm7229-201ENSMUST00000214719 1007 ntBASIC21.3■■□□□ 1
Gimap6Q8K349 Gm12689-201ENSMUST00000094955 1359 ntAPPRIS P1 BASIC21.3■■□□□ 1
Gimap6Q8K349 Exog-202ENSMUST00000164213 2627 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Gimap6Q8K349 Raet1e-204ENSMUST00000181645 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Gimap6Q8K349 Fip1l1-203ENSMUST00000113535 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Gimap6Q8K349 Tox2-201ENSMUST00000099110 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Gimap6Q8K349 Nrbp1-207ENSMUST00000202576 2221 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Gimap6Q8K349 Nrbp1-201ENSMUST00000031034 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Gimap6Q8K349 Map1lc3b-204ENSMUST00000181826 2633 ntBASIC21.29■■□□□ 1
Gimap6Q8K349 Wnk2-205ENSMUST00000110097 6882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Gimap6Q8K349 Wnk2-203ENSMUST00000091623 6897 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Gimap6Q8K349 Cndp2-201ENSMUST00000025546 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Gimap6Q8K349 Slc46a1-201ENSMUST00000001126 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Gimap6Q8K349 Lncpint-201ENSMUST00000115107 1676 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Gimap6Q8K349 Slc25a39-201ENSMUST00000018821 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Gimap6Q8K349 Gm29455-202ENSMUST00000186697 1369 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Gimap6Q8K349 Josd2-202ENSMUST00000117324 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Gimap6Q8K349 Gm15920-201ENSMUST00000118998 402 ntBASIC21.29■■□□□ 1
Gimap6Q8K349 Mgarp-203ENSMUST00000141156 1246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
Gimap6Q8K349 Cntln-201ENSMUST00000047023 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Gimap6Q8K349 2810013P06Rik-201ENSMUST00000186531 2137 ntBASIC21.29■■□□□ 1
Gimap6Q8K349 Scrib-202ENSMUST00000063747 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Gimap6Q8K349 A930012L18Rik-201ENSMUST00000181094 2364 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Gimap6Q8K349 Sptbn4-201ENSMUST00000011895 8747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Gimap6Q8K349 Mxi1-201ENSMUST00000003870 5156 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Gimap6Q8K349 Apbb1-209ENSMUST00000188368 1970 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Gimap6Q8K349 Gm43182-201ENSMUST00000199476 2528 ntBASIC21.28■■□□□ 1
Gimap6Q8K349 Selenok-201ENSMUST00000112268 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Gimap6Q8K349 Lrrc36-206ENSMUST00000216765 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Gimap6Q8K349 Bcl11b-203ENSMUST00000109891 2888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Gimap6Q8K349 Kat5-201ENSMUST00000113641 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Gimap6Q8K349 Adprhl1-201ENSMUST00000033825 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Gimap6Q8K349 Dio1-202ENSMUST00000106748 396 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Gimap6Q8K349 Cyb5rl-204ENSMUST00000106760 840 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
Gimap6Q8K349 Prmt7-203ENSMUST00000109297 1094 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Gimap6Q8K349 Dlk1-203ENSMUST00000109842 1129 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Gimap6Q8K349 Gm17178-201ENSMUST00000163273 357 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Gimap6Q8K349 Gm27300-201ENSMUST00000184085 97 ntBASIC21.28■■□□□ 1
Gimap6Q8K349 Gm27335-201ENSMUST00000184758 97 ntBASIC21.28■■□□□ 1
Gimap6Q8K349 Gm44081-201ENSMUST00000204406 643 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
Gimap6Q8K349 Stum-205ENSMUST00000211561 1063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Gimap6Q8K349 Snrnp25-201ENSMUST00000039601 821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Gimap6Q8K349 Rgs9-202ENSMUST00000103062 1743 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Gimap6Q8K349 Vkorc1l1-203ENSMUST00000201855 4809 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Gimap6Q8K349 Htatip2-201ENSMUST00000085272 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Gimap6Q8K349 Siglecf-206ENSMUST00000206299 2149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Gimap6Q8K349 Psen2-203ENSMUST00000111105 1575 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Gimap6Q8K349 Fam171b-201ENSMUST00000051454 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Gimap6Q8K349 Coro1a-202ENSMUST00000106364 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Gimap6Q8K349 Sufu-202ENSMUST00000111867 1747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Gimap6Q8K349 Gm5922-201ENSMUST00000214963 1723 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Gimap6Q8K349 Klf3-201ENSMUST00000165536 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Gimap6Q8K349 Mprip-203ENSMUST00000108751 4021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Gimap6Q8K349 Krt28-201ENSMUST00000006963 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Gimap6Q8K349 Impdh1-210ENSMUST00000162739 2471 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Gimap6Q8K349 Atp11a-202ENSMUST00000091237 7443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Gimap6Q8K349 Gm26663-201ENSMUST00000181105 1882 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Gimap6Q8K349 Maneal-201ENSMUST00000064444 2727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
Gimap6Q8K349 Pcp2-204ENSMUST00000136105 504 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Gimap6Q8K349 Gm10576-201ENSMUST00000191927 825 ntBASIC21.27■■□□□ 1
Gimap6Q8K349 H2-Bl-211ENSMUST00000195838 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Gimap6Q8K349 Gm45844-204ENSMUST00000209833 1524 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Gimap6Q8K349 Gm42743-201ENSMUST00000051089 1511 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Gimap6Q8K349 Etnk1-204ENSMUST00000205256 2647 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Gimap6Q8K349 Arhgef16-201ENSMUST00000030898 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Gimap6Q8K349 Msmo1-201ENSMUST00000034015 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Gimap6Q8K349 Rbm24-201ENSMUST00000037923 3086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.27■□□□□ 0.99
Gimap6Q8K349 Stradb-201ENSMUST00000027185 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
Gimap6Q8K349 Cadm1-204ENSMUST00000114548 4482 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Gimap6Q8K349 Capzb-202ENSMUST00000042675 1604 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Gimap6Q8K349 Prnp-201ENSMUST00000091288 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Gimap6Q8K349 Camsap3-206ENSMUST00000207533 2584 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Gimap6Q8K349 Ndufs2-202ENSMUST00000111318 1545 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Gimap6Q8K349 Rara-204ENSMUST00000107475 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Gimap6Q8K349 Syt3-202ENSMUST00000118962 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Gimap6Q8K349 Znhit1-204ENSMUST00000111091 1070 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Gimap6Q8K349 Sfxn5-203ENSMUST00000113787 638 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Gimap6Q8K349 Gm15358-201ENSMUST00000119249 520 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
Gimap6Q8K349 Gm13849-201ENSMUST00000153328 835 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Gimap6Q8K349 Znhit1-206ENSMUST00000156963 1208 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Gimap6Q8K349 Auts2-212ENSMUST00000178555 309 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
Gimap6Q8K349 Gm4899-201ENSMUST00000178708 719 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
Gimap6Q8K349 AC093926.2-201ENSMUST00000214468 1228 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
Gimap6Q8K349 Ppme1-201ENSMUST00000032963 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Gimap6Q8K349 Cyth2-201ENSMUST00000056820 2527 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Gimap6Q8K349 Auh-202ENSMUST00000110031 3235 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Gimap6Q8K349 Cog2-201ENSMUST00000034460 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Gimap6Q8K349 Rtn4-204ENSMUST00000102842 2257 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Gimap6Q8K349 Bmp8a-201ENSMUST00000040496 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Gimap6Q8K349 Sfxn4-203ENSMUST00000135808 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.9 ms