Protein–RNA interactions for Protein: Q8K330

Ssh3, Protein phosphatase Slingshot homolog 3, mousemouse

Predictions only

Length 649 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ssh3Q8K330 3110002H16Rik-201ENSMUST00000025276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ssh3Q8K330 Ak1-203ENSMUST00000113278 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ssh3Q8K330 Gm13074-201ENSMUST00000124848 2735 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ssh3Q8K330 Tbx3os2-201ENSMUST00000135385 1345 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ssh3Q8K330 Atp5g1-202ENSMUST00000107684 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ssh3Q8K330 Gm6433-201ENSMUST00000118634 875 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
Ssh3Q8K330 4930526A20Rik-201ENSMUST00000134228 941 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
Ssh3Q8K330 Irak1-205ENSMUST00000114353 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ssh3Q8K330 Acvrl1-203ENSMUST00000119063 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ssh3Q8K330 Slc41a3-202ENSMUST00000044019 2412 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ssh3Q8K330 Tfeb-204ENSMUST00000113288 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ssh3Q8K330 Nucb2-201ENSMUST00000032895 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ssh3Q8K330 Sept8-201ENSMUST00000108987 4436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ssh3Q8K330 Shisa7-201ENSMUST00000066041 6006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ssh3Q8K330 Dars-201ENSMUST00000027602 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ssh3Q8K330 Adam23-204ENSMUST00000114103 2655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ssh3Q8K330 Tspyl2-201ENSMUST00000044509 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ssh3Q8K330 Gm15582-201ENSMUST00000132849 1581 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ssh3Q8K330 Dmpk-202ENSMUST00000108473 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ssh3Q8K330 Ttyh1-217ENSMUST00000206869 1491 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ssh3Q8K330 Zfp212-201ENSMUST00000009411 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ssh3Q8K330 Impdh1-205ENSMUST00000160878 2314 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ssh3Q8K330 Psmd6-201ENSMUST00000022256 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ssh3Q8K330 L3hypdh-201ENSMUST00000019862 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ssh3Q8K330 Pex11a-201ENSMUST00000032761 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ssh3Q8K330 Insc-201ENSMUST00000117543 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ssh3Q8K330 Gm1043-204ENSMUST00000207866 4296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ssh3Q8K330 Gm45058-201ENSMUST00000205810 766 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
Ssh3Q8K330 Fuz-209ENSMUST00000208179 1164 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ssh3Q8K330 Gm7213-201ENSMUST00000215977 950 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
Ssh3Q8K330 Was-201ENSMUST00000033505 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ssh3Q8K330 Psmd4-201ENSMUST00000071664 1276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ssh3Q8K330 Chst8-201ENSMUST00000078686 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ssh3Q8K330 Tpd52-205ENSMUST00000120143 6317 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ssh3Q8K330 Rab10-201ENSMUST00000021001 3513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ssh3Q8K330 Lrrc36-206ENSMUST00000216765 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ssh3Q8K330 Acot7-206ENSMUST00000167926 1505 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ssh3Q8K330 Gm26762-201ENSMUST00000180864 5284 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ssh3Q8K330 Atxn7l3-202ENSMUST00000107132 3706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ssh3Q8K330 Ebf3-208ENSMUST00000210774 2994 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ssh3Q8K330 Adamtsl1-201ENSMUST00000048885 1842 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ssh3Q8K330 Gtf3a-201ENSMUST00000132102 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ssh3Q8K330 Msi1-208ENSMUST00000150779 3133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ssh3Q8K330 Ddx51-201ENSMUST00000031478 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ssh3Q8K330 Gm21981-201ENSMUST00000143789 2721 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ssh3Q8K330 Gm36858-201ENSMUST00000194501 2391 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
Ssh3Q8K330 Kat5-201ENSMUST00000113641 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ssh3Q8K330 Mdm1-204ENSMUST00000169817 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ssh3Q8K330 Cry1-201ENSMUST00000020227 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ssh3Q8K330 Fam78b-206ENSMUST00000190081 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ssh3Q8K330 Sec14l1-203ENSMUST00000103026 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ssh3Q8K330 Gnaz-201ENSMUST00000037813 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ssh3Q8K330 Gm13186-201ENSMUST00000118031 316 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
Ssh3Q8K330 Izumo1r-204ENSMUST00000121116 726 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ssh3Q8K330 Slc2a8-204ENSMUST00000153484 1168 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ssh3Q8K330 Gm29994-201ENSMUST00000195495 1193 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
Ssh3Q8K330 Arpc4-204ENSMUST00000204802 794 ntTSL 3 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ssh3Q8K330 Mrpl21-202ENSMUST00000025745 1138 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ssh3Q8K330 Pldi-201ENSMUST00000036304 853 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ssh3Q8K330 Prkag2-203ENSMUST00000114975 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ssh3Q8K330 Pacs2-202ENSMUST00000220541 3101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ssh3Q8K330 Agtr1a-201ENSMUST00000066412 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ssh3Q8K330 Bnip2-201ENSMUST00000034754 2464 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ssh3Q8K330 Itga6-201ENSMUST00000028522 4310 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ssh3Q8K330 Cdca7-201ENSMUST00000102691 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ssh3Q8K330 Casc4-201ENSMUST00000078752 4215 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ssh3Q8K330 Agrn-206ENSMUST00000180572 6891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ssh3Q8K330 Mier2-203ENSMUST00000165028 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ssh3Q8K330 Pid1-201ENSMUST00000168574 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ssh3Q8K330 Tuba8-201ENSMUST00000032233 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ssh3Q8K330 Kcnn1-207ENSMUST00000212509 1608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Ssh3Q8K330 P2ry2-206ENSMUST00000208340 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Ssh3Q8K330 4930455H04Rik-201ENSMUST00000117592 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Ssh3Q8K330 Rundc3a-202ENSMUST00000107102 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Ssh3Q8K330 Slc23a3-201ENSMUST00000027405 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Ssh3Q8K330 Mpz-202ENSMUST00000111334 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Ssh3Q8K330 Hist1h2br-203ENSMUST00000180288 1256 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Ssh3Q8K330 Hist1h2bq-202ENSMUST00000091749 1254 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Ssh3Q8K330 Taf6l-213ENSMUST00000189739 1794 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Ssh3Q8K330 Nptx2-201ENSMUST00000071782 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Ssh3Q8K330 Large2-215ENSMUST00000176810 2477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
Ssh3Q8K330 AU022751-202ENSMUST00000117544 2201 ntAPPRIS P4 BASIC16.27■□□□□ 0.19
Ssh3Q8K330 Zdhhc15-201ENSMUST00000042070 5509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Ssh3Q8K330 Med7-209ENSMUST00000170928 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Ssh3Q8K330 Tspan9-201ENSMUST00000032503 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Ssh3Q8K330 A330035P11Rik-202ENSMUST00000144926 3074 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Ssh3Q8K330 Plbd2-201ENSMUST00000031597 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Ssh3Q8K330 Pcmt1-208ENSMUST00000162606 2757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ssh3Q8K330 Tubb6-201ENSMUST00000001513 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ssh3Q8K330 Chrd-202ENSMUST00000115423 2417 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ssh3Q8K330 Timp2-201ENSMUST00000017610 3709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ssh3Q8K330 Casp3-204ENSMUST00000211115 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ssh3Q8K330 Actl10-201ENSMUST00000104928 1501 ntAPPRIS P1 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ssh3Q8K330 Actl10-202ENSMUST00000226583 1501 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Ssh3Q8K330 Sufu-202ENSMUST00000111867 1747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ssh3Q8K330 Zfp64-202ENSMUST00000109161 1009 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ssh3Q8K330 Slc25a51-203ENSMUST00000132815 1005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ssh3Q8K330 Cdc34-202ENSMUST00000166603 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ssh3Q8K330 Ptgis-201ENSMUST00000018113 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ssh3Q8K330 Tnnt2-212ENSMUST00000189732 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.2 ms