Protein–RNA interactions for Protein: Q8K2Y9

Ccm2, Cerebral cavernous malformations protein 2 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 453 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccm2Q8K2Y9 Crebzf-201ENSMUST00000061767 3376 ntAPPRIS P1 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ccm2Q8K2Y9 2810013P06Rik-201ENSMUST00000186531 2137 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Ccm2Q8K2Y9 Sbk2-202ENSMUST00000182214 2236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ccm2Q8K2Y9 Krt6b-201ENSMUST00000023786 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ccm2Q8K2Y9 Nsmf-207ENSMUST00000116574 2863 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ccm2Q8K2Y9 Ostf1-201ENSMUST00000025631 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ccm2Q8K2Y9 A230103J11Rik-202ENSMUST00000156084 2086 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ccm2Q8K2Y9 Ccdc184-201ENSMUST00000031914 2329 ntAPPRIS P1 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ccm2Q8K2Y9 Mvk-201ENSMUST00000043760 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ccm2Q8K2Y9 Cdkn1a-201ENSMUST00000023829 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ccm2Q8K2Y9 Sgpp1-201ENSMUST00000021450 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ccm2Q8K2Y9 Ripor2-205ENSMUST00000110384 5608 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ccm2Q8K2Y9 Znhit1-203ENSMUST00000111090 698 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ccm2Q8K2Y9 Ppp1r2-202ENSMUST00000115233 958 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ccm2Q8K2Y9 A730015C16Rik-201ENSMUST00000164855 1221 ntAPPRIS P1 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ccm2Q8K2Y9 S100a16-202ENSMUST00000098911 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ccm2Q8K2Y9 Mycn-201ENSMUST00000043396 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ccm2Q8K2Y9 Mir22hg-202ENSMUST00000149940 1752 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ccm2Q8K2Y9 Nadk2-203ENSMUST00000100790 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ccm2Q8K2Y9 Gm13446-201ENSMUST00000124555 2033 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ccm2Q8K2Y9 Slc1a6-201ENSMUST00000005490 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ccm2Q8K2Y9 Ptbp2-213ENSMUST00000200097 3777 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ccm2Q8K2Y9 Slc44a1-201ENSMUST00000102911 3102 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ccm2Q8K2Y9 Ptprd-206ENSMUST00000107289 9899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ccm2Q8K2Y9 Homer2-206ENSMUST00000207983 1634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ccm2Q8K2Y9 Pla2g2c-201ENSMUST00000030530 1618 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ccm2Q8K2Y9 C230012O17Rik-201ENSMUST00000130085 2999 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ccm2Q8K2Y9 Cops7b-201ENSMUST00000027446 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Ccm2Q8K2Y9 Chn1-203ENSMUST00000112024 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Ccm2Q8K2Y9 Chn1-210ENSMUST00000180045 4050 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Ccm2Q8K2Y9 Plppr5-201ENSMUST00000039564 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Ccm2Q8K2Y9 Plekhh3-201ENSMUST00000043397 3056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Ccm2Q8K2Y9 Gnb2-203ENSMUST00000111023 1471 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.1
Ccm2Q8K2Y9 Stxbp3-201ENSMUST00000102621 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ccm2Q8K2Y9 Gm9889-202ENSMUST00000206983 1577 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Ccm2Q8K2Y9 Vim-201ENSMUST00000028062 2193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ccm2Q8K2Y9 BC030336-201ENSMUST00000060175 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ccm2Q8K2Y9 Gnas-202ENSMUST00000087871 3903 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ccm2Q8K2Y9 4933434E20Rik-209ENSMUST00000162114 1411 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ccm2Q8K2Y9 Cct8-201ENSMUST00000026704 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ccm2Q8K2Y9 Irf7-202ENSMUST00000097952 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ccm2Q8K2Y9 Gpr20-201ENSMUST00000064166 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ccm2Q8K2Y9 Abi1-215ENSMUST00000178908 2239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ccm2Q8K2Y9 Kcna6-204ENSMUST00000185333 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ccm2Q8K2Y9 Crem-228ENSMUST00000150235 2662 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ccm2Q8K2Y9 Tpm2-203ENSMUST00000107914 1164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ccm2Q8K2Y9 4930401G09Rik-201ENSMUST00000139500 637 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ccm2Q8K2Y9 Gm15234-201ENSMUST00000141485 1058 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ccm2Q8K2Y9 Rnf170-208ENSMUST00000153528 1026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ccm2Q8K2Y9 Ciao1-204ENSMUST00000174030 1109 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ccm2Q8K2Y9 Syngr2-206ENSMUST00000177131 935 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ccm2Q8K2Y9 Bex3-204ENSMUST00000178632 933 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ccm2Q8K2Y9 AC130671.1-201ENSMUST00000227384 1237 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Ccm2Q8K2Y9 Fhl1-203ENSMUST00000114769 2770 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ccm2Q8K2Y9 Tead3-201ENSMUST00000114799 2448 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ccm2Q8K2Y9 Adgrl1-201ENSMUST00000045393 5643 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ccm2Q8K2Y9 Nptx2-201ENSMUST00000071782 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ccm2Q8K2Y9 Pgc-201ENSMUST00000024782 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ccm2Q8K2Y9 Tfap2b-202ENSMUST00000064976 1946 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ccm2Q8K2Y9 Tsc22d2-203ENSMUST00000199164 4659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ccm2Q8K2Y9 Pgap2-203ENSMUST00000120119 1979 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ccm2Q8K2Y9 Nagk-201ENSMUST00000037376 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ccm2Q8K2Y9 Inhba-202ENSMUST00000164993 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ccm2Q8K2Y9 Rnpep-202ENSMUST00000077340 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ccm2Q8K2Y9 Gss-203ENSMUST00000130881 1724 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ccm2Q8K2Y9 2310009B15Rik-201ENSMUST00000112025 565 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ccm2Q8K2Y9 Mir142hg-201ENSMUST00000123700 269 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ccm2Q8K2Y9 Gm15690-201ENSMUST00000128728 432 ntTSL 3 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ccm2Q8K2Y9 Gm20675-201ENSMUST00000175861 338 ntTSL 3 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ccm2Q8K2Y9 Rbm4-203ENSMUST00000178615 1018 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ccm2Q8K2Y9 Dvl2-201ENSMUST00000019362 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ccm2Q8K2Y9 Gm43077-201ENSMUST00000200602 491 ntTSL 3 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ccm2Q8K2Y9 AC114585.2-202ENSMUST00000228094 426 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
Ccm2Q8K2Y9 Gmnn-201ENSMUST00000006898 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ccm2Q8K2Y9 Glt28d2-201ENSMUST00000033643 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ccm2Q8K2Y9 Actg1-202ENSMUST00000071555 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ccm2Q8K2Y9 Rsph3a-201ENSMUST00000097423 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ccm2Q8K2Y9 B3gnt6-201ENSMUST00000098278 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ccm2Q8K2Y9 Wrb-201ENSMUST00000023913 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ccm2Q8K2Y9 Bhlhe41-201ENSMUST00000032386 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ccm2Q8K2Y9 Babam1-201ENSMUST00000002473 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ccm2Q8K2Y9 Cidec-202ENSMUST00000113089 1720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ccm2Q8K2Y9 Tubg1-201ENSMUST00000043680 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ccm2Q8K2Y9 Dnaaf3-201ENSMUST00000094897 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ccm2Q8K2Y9 Cadm3-201ENSMUST00000005470 2518 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ccm2Q8K2Y9 Celf6-204ENSMUST00000121266 2610 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ccm2Q8K2Y9 Gabra5-202ENSMUST00000206382 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ccm2Q8K2Y9 Zrsr2-202ENSMUST00000112289 2735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ccm2Q8K2Y9 Tsnax-201ENSMUST00000075896 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ccm2Q8K2Y9 A930003O13Rik-203ENSMUST00000199056 1955 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ccm2Q8K2Y9 Klhdc8b-201ENSMUST00000035232 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ccm2Q8K2Y9 Borcs5-201ENSMUST00000062755 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ccm2Q8K2Y9 Dag1-203ENSMUST00000171412 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ccm2Q8K2Y9 Sirt7-202ENSMUST00000106183 427 ntTSL 3 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ccm2Q8K2Y9 Cd82-204ENSMUST00000111257 1003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ccm2Q8K2Y9 Dpy30-201ENSMUST00000112571 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ccm2Q8K2Y9 Rnf181-203ENSMUST00000114095 869 ntTSL 3 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ccm2Q8K2Y9 2410004I01Rik-201ENSMUST00000138424 1187 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ccm2Q8K2Y9 Hint3-203ENSMUST00000161074 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ccm2Q8K2Y9 Hist1h2bc-201ENSMUST00000018246 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.3 ms