Protein–RNA interactions for Protein: Q8K2T8

Paf1, RNA polymerase II-associated factor 1 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 535 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Paf1Q8K2T8 Srpx-202ENSMUST00000115543 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Paf1Q8K2T8 Gm14464-201ENSMUST00000119658 1254 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
Paf1Q8K2T8 Qdpr-208ENSMUST00000197946 1206 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Paf1Q8K2T8 Stambp-206ENSMUST00000206400 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Paf1Q8K2T8 AC115863.1-201ENSMUST00000214815 1813 ntBASIC19.02■□□□□ 0.63
Paf1Q8K2T8 Hoxaas2-202ENSMUST00000155922 1567 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
Paf1Q8K2T8 Slc1a6-201ENSMUST00000005490 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Paf1Q8K2T8 Kcnq2-205ENSMUST00000103048 2827 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Paf1Q8K2T8 Pcmt1-202ENSMUST00000159917 2491 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Paf1Q8K2T8 Ccdc174-201ENSMUST00000037783 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Paf1Q8K2T8 Irf7-202ENSMUST00000097952 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Paf1Q8K2T8 Abi1-215ENSMUST00000178908 2239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Paf1Q8K2T8 Xpr1-202ENSMUST00000111774 2753 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Paf1Q8K2T8 Camsap2-203ENSMUST00000192314 4916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Paf1Q8K2T8 Klhdc4-201ENSMUST00000045884 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Paf1Q8K2T8 Ptn-201ENSMUST00000101534 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Paf1Q8K2T8 Tox2-201ENSMUST00000099110 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Paf1Q8K2T8 Gm44973-201ENSMUST00000207050 1003 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Paf1Q8K2T8 Zbtb24-201ENSMUST00000080771 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Paf1Q8K2T8 Ppt2-205ENSMUST00000169067 1392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Paf1Q8K2T8 Sbk2-202ENSMUST00000182214 2236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Paf1Q8K2T8 Dnaaf3-201ENSMUST00000094897 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Paf1Q8K2T8 Irak1-201ENSMUST00000033769 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Paf1Q8K2T8 Ccdc184-201ENSMUST00000031914 2329 ntAPPRIS P1 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Paf1Q8K2T8 Mir22hg-202ENSMUST00000149940 1752 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Paf1Q8K2T8 Rhobtb2-201ENSMUST00000022665 5322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Paf1Q8K2T8 Fiz1-201ENSMUST00000077385 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Paf1Q8K2T8 Simc1-202ENSMUST00000121401 4819 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
Paf1Q8K2T8 Mycs-201ENSMUST00000058404 2368 ntAPPRIS P1 BASIC19■□□□□ 0.63
Paf1Q8K2T8 Haghl-201ENSMUST00000077938 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Paf1Q8K2T8 Inhba-202ENSMUST00000164993 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Paf1Q8K2T8 Ralgapa2-211ENSMUST00000228797 8245 ntAPPRIS ALT2 BASIC19■□□□□ 0.63
Paf1Q8K2T8 Uts2r-201ENSMUST00000039044 1703 ntAPPRIS P1 BASIC19■□□□□ 0.63
Paf1Q8K2T8 Mettl21a-202ENSMUST00000114079 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Paf1Q8K2T8 Atg7-215ENSMUST00000183165 2012 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
Paf1Q8K2T8 Shroom4-202ENSMUST00000103005 4839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Paf1Q8K2T8 Asph-210ENSMUST00000108337 2836 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Paf1Q8K2T8 Lcn12-202ENSMUST00000114245 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Paf1Q8K2T8 Mrps12-204ENSMUST00000171183 883 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
Paf1Q8K2T8 Gm27704-201ENSMUST00000185094 107 ntBASIC19■□□□□ 0.63
Paf1Q8K2T8 Dcps-201ENSMUST00000034539 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Paf1Q8K2T8 Hist1h1a-201ENSMUST00000055770 741 ntAPPRIS P1 BASIC19■□□□□ 0.63
Paf1Q8K2T8 Pym1-201ENSMUST00000065210 1156 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Paf1Q8K2T8 Olfr601-201ENSMUST00000080474 990 ntAPPRIS P1 BASIC19■□□□□ 0.63
Paf1Q8K2T8 Mfsd10-203ENSMUST00000114331 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Paf1Q8K2T8 Syt9-201ENSMUST00000073459 3817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Paf1Q8K2T8 Krt6b-201ENSMUST00000023786 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Paf1Q8K2T8 Gpr20-201ENSMUST00000064166 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Paf1Q8K2T8 Gm13446-201ENSMUST00000124555 2033 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Paf1Q8K2T8 Dok3-202ENSMUST00000223563 1644 ntAPPRIS P1 BASIC19■□□□□ 0.63
Paf1Q8K2T8 Cct8-201ENSMUST00000026704 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Paf1Q8K2T8 Rsph3a-201ENSMUST00000097423 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Paf1Q8K2T8 Cd5-201ENSMUST00000025571 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Paf1Q8K2T8 Col11a2-201ENSMUST00000087497 6048 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Paf1Q8K2T8 Klhdc8b-201ENSMUST00000035232 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Paf1Q8K2T8 Mvk-201ENSMUST00000043760 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Paf1Q8K2T8 Celf6-204ENSMUST00000121266 2610 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Paf1Q8K2T8 Rnf146-202ENSMUST00000160144 4323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Paf1Q8K2T8 Appbp2-201ENSMUST00000018625 6463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Paf1Q8K2T8 Ciao1-204ENSMUST00000174030 1109 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Paf1Q8K2T8 Gm27742-201ENSMUST00000184667 60 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
Paf1Q8K2T8 Mrpl36-202ENSMUST00000221730 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Paf1Q8K2T8 Snhg10-202ENSMUST00000222812 527 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Paf1Q8K2T8 Npcd-201ENSMUST00000023060 1162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Paf1Q8K2T8 Mrps6-201ENSMUST00000047429 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Paf1Q8K2T8 Tsr3-201ENSMUST00000063574 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Paf1Q8K2T8 Gxylt2-201ENSMUST00000032157 7658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Paf1Q8K2T8 Fam46b-201ENSMUST00000051676 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Paf1Q8K2T8 Tom1l2-201ENSMUST00000064019 2151 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Paf1Q8K2T8 Magi1-202ENSMUST00000089317 7209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Paf1Q8K2T8 Gbp5-201ENSMUST00000090127 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Paf1Q8K2T8 Nit1-202ENSMUST00000111295 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Paf1Q8K2T8 Aipl1-201ENSMUST00000048207 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Paf1Q8K2T8 Mfsd4b1-201ENSMUST00000163705 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Paf1Q8K2T8 Pard6g-201ENSMUST00000070219 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Paf1Q8K2T8 Zmynd19-201ENSMUST00000028350 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Paf1Q8K2T8 Acap3-202ENSMUST00000105584 4365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Paf1Q8K2T8 Gm16759-204ENSMUST00000191455 4272 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Paf1Q8K2T8 Asic2-201ENSMUST00000021045 3436 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Paf1Q8K2T8 Pdgfa-203ENSMUST00000110896 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Paf1Q8K2T8 Susd1-202ENSMUST00000107544 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Paf1Q8K2T8 Mtmr12-201ENSMUST00000038172 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Paf1Q8K2T8 Tpm2-203ENSMUST00000107914 1164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Paf1Q8K2T8 Psme2-208ENSMUST00000161807 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Paf1Q8K2T8 E2f7-205ENSMUST00000173634 827 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Paf1Q8K2T8 Syngr2-206ENSMUST00000177131 935 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Paf1Q8K2T8 Gm28793-201ENSMUST00000190845 413 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Paf1Q8K2T8 Gfra4-202ENSMUST00000066958 783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Paf1Q8K2T8 Hist1h2af-201ENSMUST00000073261 399 ntAPPRIS P1 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Paf1Q8K2T8 Slit1-201ENSMUST00000025993 5045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Paf1Q8K2T8 Zpbp-201ENSMUST00000020413 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Paf1Q8K2T8 2810013P06Rik-201ENSMUST00000186531 2137 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
Paf1Q8K2T8 Zswim1-201ENSMUST00000017908 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Paf1Q8K2T8 Iars2-201ENSMUST00000027921 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Paf1Q8K2T8 Nptx2-201ENSMUST00000071782 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Paf1Q8K2T8 Cdkn1a-201ENSMUST00000023829 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Paf1Q8K2T8 Gnb2-203ENSMUST00000111023 1471 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Paf1Q8K2T8 Ptpro-203ENSMUST00000167679 5096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Paf1Q8K2T8 Ap1s1-201ENSMUST00000111080 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Paf1Q8K2T8 Paqr9-201ENSMUST00000079597 8367 ntAPPRIS P1 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.4 ms