Protein–RNA interactions for Protein: Q8K2L8

Trappc12, Trafficking protein particle complex subunit 12, mousemouse

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Length 797 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trappc12Q8K2L8 Ptgfrn-201ENSMUST00000102694 5902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Trappc12Q8K2L8 1500011B03Rik-202ENSMUST00000112160 1333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Trappc12Q8K2L8 Smarca4-201ENSMUST00000034707 6354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Trappc12Q8K2L8 4833418N02Rik-202ENSMUST00000146560 1495 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Trappc12Q8K2L8 Gm32369-201ENSMUST00000222630 1467 ntTSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
Trappc12Q8K2L8 Gm30097-202ENSMUST00000194580 329 ntTSL 3 BASIC18.8■□□□□ 0.6
Trappc12Q8K2L8 Rhebl1-201ENSMUST00000024518 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Trappc12Q8K2L8 Epc2-201ENSMUST00000092123 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Trappc12Q8K2L8 Mex3b-201ENSMUST00000082237 3355 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
Trappc12Q8K2L8 Bcl9l-206ENSMUST00000220303 5760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Trappc12Q8K2L8 Tstd3-201ENSMUST00000029915 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Trappc12Q8K2L8 Tubb4b-201ENSMUST00000043584 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Trappc12Q8K2L8 Fam103a1-202ENSMUST00000118190 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Trappc12Q8K2L8 Zbtb48-201ENSMUST00000066715 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Trappc12Q8K2L8 2610035D17Rik-201ENSMUST00000127263 1861 ntTSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
Trappc12Q8K2L8 Larp1b-202ENSMUST00000048490 2354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
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Trappc12Q8K2L8 Clint1-202ENSMUST00000109261 3365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Trappc12Q8K2L8 Kcnj4-201ENSMUST00000057801 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Trappc12Q8K2L8 Spata2l-202ENSMUST00000166768 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Trappc12Q8K2L8 Nkain4-202ENSMUST00000108873 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Trappc12Q8K2L8 Josd2-202ENSMUST00000117324 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
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Trappc12Q8K2L8 4930481B07Rik-201ENSMUST00000128160 1089 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Trappc12Q8K2L8 Gm11025-201ENSMUST00000140773 466 ntBASIC18.79■□□□□ 0.6
Trappc12Q8K2L8 Gm16191-201ENSMUST00000141445 520 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Trappc12Q8K2L8 Slc25a5-201ENSMUST00000016463 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
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Trappc12Q8K2L8 Mon1a-201ENSMUST00000035202 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
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Trappc12Q8K2L8 Atp5b-201ENSMUST00000026459 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Trappc12Q8K2L8 Lrrc43-202ENSMUST00000121444 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
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Trappc12Q8K2L8 Nr1h2-203ENSMUST00000107911 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
Trappc12Q8K2L8 Fip1l1-203ENSMUST00000113535 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
Trappc12Q8K2L8 Tfap2b-202ENSMUST00000064976 1946 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Trappc12Q8K2L8 Abhd16a-201ENSMUST00000007251 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Trappc12Q8K2L8 Inppl1-202ENSMUST00000165052 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Trappc12Q8K2L8 Cxcl12-202ENSMUST00000112866 1878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Trappc12Q8K2L8 Pid1-201ENSMUST00000168574 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Trappc12Q8K2L8 Acyp1-203ENSMUST00000117138 735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Trappc12Q8K2L8 Gm16151-201ENSMUST00000129696 639 ntTSL 3 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Trappc12Q8K2L8 Arid2-202ENSMUST00000134985 809 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Trappc12Q8K2L8 Fam241b-208ENSMUST00000142796 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Trappc12Q8K2L8 Erp27-201ENSMUST00000032343 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Trappc12Q8K2L8 Rhox6-201ENSMUST00000006362 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Trappc12Q8K2L8 Gstm4-201ENSMUST00000029489 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Trappc12Q8K2L8 Fam72a-201ENSMUST00000068613 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Trappc12Q8K2L8 Prnp-201ENSMUST00000091288 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Trappc12Q8K2L8 Maneal-201ENSMUST00000064444 2727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.6 ms