Protein–RNA interactions for Protein: Q8K2F0

Brd3, Bromodomain-containing protein 3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 726 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Brd3Q8K2F0 Tor1b-201ENSMUST00000028199 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Brd3Q8K2F0 Kctd20-208ENSMUST00000168507 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Brd3Q8K2F0 Cuedc1-201ENSMUST00000018522 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Brd3Q8K2F0 Gm45203-201ENSMUST00000206384 1831 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Brd3Q8K2F0 Sox18-201ENSMUST00000054491 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Brd3Q8K2F0 Pagr1a-202ENSMUST00000200948 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Brd3Q8K2F0 Gm42742-205ENSMUST00000202798 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Brd3Q8K2F0 Nmt2-203ENSMUST00000102989 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Brd3Q8K2F0 Lgr6-201ENSMUST00000044828 6675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Brd3Q8K2F0 Sec31a-201ENSMUST00000094578 4228 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Brd3Q8K2F0 Slbp-203ENSMUST00000101354 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Brd3Q8K2F0 Yes1-205ENSMUST00000202543 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Brd3Q8K2F0 Anks6-201ENSMUST00000084616 3552 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Brd3Q8K2F0 Malsu1-203ENSMUST00000128616 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Brd3Q8K2F0 Tmem5-205ENSMUST00000140299 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Brd3Q8K2F0 Spdya-204ENSMUST00000167641 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Brd3Q8K2F0 Foxo3-201ENSMUST00000056974 2889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Brd3Q8K2F0 Tnfrsf1a-201ENSMUST00000032491 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Brd3Q8K2F0 Zc3h14-204ENSMUST00000110105 3514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Brd3Q8K2F0 Bad-202ENSMUST00000113423 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Brd3Q8K2F0 Hilpda-202ENSMUST00000115289 658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Brd3Q8K2F0 Utf1-201ENSMUST00000168457 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Brd3Q8K2F0 Prkcg-202ENSMUST00000172109 2119 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Brd3Q8K2F0 Gm26643-201ENSMUST00000180854 1274 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Brd3Q8K2F0 Gm38027-201ENSMUST00000192315 235 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Brd3Q8K2F0 Fxyd1-208ENSMUST00000205807 539 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Brd3Q8K2F0 Bax-201ENSMUST00000033093 867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Brd3Q8K2F0 Cog8-201ENSMUST00000034391 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Brd3Q8K2F0 Trim14-201ENSMUST00000046897 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Brd3Q8K2F0 Celf1-206ENSMUST00000111451 4678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Brd3Q8K2F0 Gaa-202ENSMUST00000106258 1369 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Brd3Q8K2F0 Psmd6-201ENSMUST00000022256 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Brd3Q8K2F0 Gm8909-201ENSMUST00000040467 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Brd3Q8K2F0 Prss33-201ENSMUST00000059906 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Brd3Q8K2F0 Capn15-205ENSMUST00000212520 5216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Brd3Q8K2F0 Kbtbd11-201ENSMUST00000069399 6973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Brd3Q8K2F0 Znfx1-201ENSMUST00000048988 7218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Brd3Q8K2F0 Hand1-203ENSMUST00000160392 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Brd3Q8K2F0 Cyfip2-205ENSMUST00000165599 6659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Brd3Q8K2F0 Wnt8b-201ENSMUST00000041163 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Brd3Q8K2F0 4931440P22Rik-202ENSMUST00000147424 2430 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Brd3Q8K2F0 Zfp281-202ENSMUST00000112046 4937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Brd3Q8K2F0 4930455H04Rik-201ENSMUST00000117592 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Brd3Q8K2F0 Dusp14-205ENSMUST00000164891 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Brd3Q8K2F0 Gm6093-201ENSMUST00000221792 1623 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Brd3Q8K2F0 Myef2-201ENSMUST00000067780 2999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Brd3Q8K2F0 Zfp64-202ENSMUST00000109161 1009 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Brd3Q8K2F0 Mta3-203ENSMUST00000112350 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Brd3Q8K2F0 Tprn-201ENSMUST00000114336 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Brd3Q8K2F0 Rpl18-ps2-201ENSMUST00000118863 567 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
Brd3Q8K2F0 Gm11539-201ENSMUST00000119837 557 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
Brd3Q8K2F0 Gm13436-201ENSMUST00000120418 567 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
Brd3Q8K2F0 Serinc2-203ENSMUST00000122374 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Brd3Q8K2F0 Ssr2-207ENSMUST00000195014 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Brd3Q8K2F0 Fkbp3-201ENSMUST00000021332 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Brd3Q8K2F0 AC122465.1-201ENSMUST00000220813 1209 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Brd3Q8K2F0 Nudt8-202ENSMUST00000025802 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Brd3Q8K2F0 Limd2-202ENSMUST00000064545 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Brd3Q8K2F0 Gm9987-201ENSMUST00000069768 567 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
Brd3Q8K2F0 Fgf2-208ENSMUST00000200585 5973 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Brd3Q8K2F0 Hnrnph1-202ENSMUST00000077817 2126 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Brd3Q8K2F0 Ush1c-208ENSMUST00000177212 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
Brd3Q8K2F0 Tbx3os2-201ENSMUST00000135385 1345 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Brd3Q8K2F0 Stx7-201ENSMUST00000020174 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Brd3Q8K2F0 Arid4b-204ENSMUST00000110536 5783 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Brd3Q8K2F0 E030042O20Rik-201ENSMUST00000135244 1427 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Brd3Q8K2F0 Stpg1-201ENSMUST00000063707 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Brd3Q8K2F0 Mindy4-203ENSMUST00000204842 2211 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Brd3Q8K2F0 Khdc3-204ENSMUST00000173734 1228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Brd3Q8K2F0 Gm16759-201ENSMUST00000126238 1393 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Brd3Q8K2F0 Prkab1-202ENSMUST00000111999 2026 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Brd3Q8K2F0 Ctsh-201ENSMUST00000034915 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Brd3Q8K2F0 Mbp-206ENSMUST00000102812 2108 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Brd3Q8K2F0 Fgf11-202ENSMUST00000102585 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Brd3Q8K2F0 Prob1-201ENSMUST00000097619 3021 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Brd3Q8K2F0 Platr31-201ENSMUST00000180653 1466 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Brd3Q8K2F0 Rmdn1-201ENSMUST00000029888 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Brd3Q8K2F0 Cfap206-201ENSMUST00000029971 2246 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Brd3Q8K2F0 Trappc3-201ENSMUST00000030660 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Brd3Q8K2F0 Lhx5-201ENSMUST00000031591 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Brd3Q8K2F0 Insig1-201ENSMUST00000059155 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Brd3Q8K2F0 Smad1-203ENSMUST00000109885 3775 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Brd3Q8K2F0 Mapk8ip2-201ENSMUST00000023291 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Brd3Q8K2F0 Ext2-201ENSMUST00000028623 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Brd3Q8K2F0 Diaph2-201ENSMUST00000037854 3742 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Brd3Q8K2F0 Clvs2-203ENSMUST00000160299 2610 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Brd3Q8K2F0 Ogg1-201ENSMUST00000032406 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Brd3Q8K2F0 Dnajb3-201ENSMUST00000119972 1051 ntAPPRIS P1 BASIC18■□□□□ 0.47
Brd3Q8K2F0 Atp23-201ENSMUST00000026504 903 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Brd3Q8K2F0 Psmd4-201ENSMUST00000071664 1276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Brd3Q8K2F0 Ankrd44-210ENSMUST00000179030 6140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Brd3Q8K2F0 Vps51-201ENSMUST00000025711 2489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Brd3Q8K2F0 Kcnj6-202ENSMUST00000099508 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Brd3Q8K2F0 Kri1-201ENSMUST00000038671 2598 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Brd3Q8K2F0 Rabggta-201ENSMUST00000062861 2338 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Brd3Q8K2F0 Tes-202ENSMUST00000115467 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Brd3Q8K2F0 4930426L09Rik-201ENSMUST00000028069 1459 ntAPPRIS P1 BASIC18■□□□□ 0.47
Brd3Q8K2F0 Faap20-201ENSMUST00000097747 1479 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Brd3Q8K2F0 Tpm3-202ENSMUST00000118566 2190 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Brd3Q8K2F0 Rsrc1-205ENSMUST00000161726 3213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.6 ms